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幽客独往ID:casularm
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我把HTML格式的文档压为ZIP格式api.zip或者文件夹的也不行
casularm:是的
郜刚:请问这个东西是中科院划分的吗?
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新一篇: 与上海天文台关于坐标转换的约定 | 旧一篇: 匈奴人的西迁和匈奴帝国的欧洲战记

《现代分子生物学》第二版   

  朱玉贤 李毅 编著

  高等教育出版社

发表于 @ 2007年01月02日 12:12:00|评论(loading...)|编辑

新一篇: 与上海天文台关于坐标转换的约定 | 旧一篇: 匈奴人的西迁和匈奴帝国的欧洲战记

评论

#casularm 发表于2007-01-02 12:20:51  IP: 211.162.10.*
分子生物学三条基本原则:
1、构成生物体各类有机大分子的单体在不同生物中都是相同的(如蛋白质分子中的20种氨基酸及DNA和RNA中的8种碱基)。
2、生物体内的一切有机大分子的建成都遵循共同的规则。
3、某一特定生物体所拥有的核糖及蛋白质分子决定了它的属性。
#casularm 发表于2007-01-02 13:40:39  IP: 211.162.10.*
动物靠氧化磷酸化,在十五的氧化过程中合成ATP。植物通过光合作用,将光能转变成ATP。动植物细胞代谢活动的实质都是电子在一系列受体蛋白之间传递,造成膜内外质子梯度差,以合成ATP。
#casularm 发表于2007-01-02 15:58:34  IP: 211.162.10.*
原核生物DNA的主要特征:
原核生物中一般只有一条染色体,且大都带有单拷贝基因,只有很少数基因(如rRNA基因)是以多拷贝形式存在的;
整个染色体DNA几乎全部由功能基因与调控序列所组成;
几乎每个基因序列都与它所编码的蛋白质序列呈线性对应状态。
#casularm 发表于2007-01-02 16:39:53  IP: 211.162.10.*
软色体上的蛋白质主要包括组蛋白和非组蛋白

组蛋白是染色体的结构蛋白,它与DNA组成核小体。根据其凝胶电泳性质划分为H1、H2A、H2B、H3及H4。
组蛋白特性:
1、进化上的极端保守性。不同种生物组蛋白的氨基酸组成十分相似。
2、无组织特异性。目前为止,仅发现鸟类、鱼类及两栖类红细胞染色体不含H1而带有H5,精细胞染色体的组蛋白是鱼精蛋白,两个例外。
3、肽链上氨基酸分布的不对称性。
4、组蛋白的修饰作用。包括甲基化、乙酰化、磷酸化及ADP核糖基化等。
5、富含赖氨酸

非组蛋白包括酶类,如RNA聚合酶及细胞分裂有关的收缩蛋白、骨架蛋白、核孔复合物蛋白以及肌动蛋白、肌球蛋白、微管蛋白、原肌蛋白等,它们也可能是染色质的结构成分。
#casularm 发表于2007-01-02 20:53:04  IP: 211.162.10.*
核小体是由H2A、H2B、H3、H4各两个分子生成的八聚体和由大约200bp DNA组成的。八聚体在中间,DNA分子盘旋在外,而H1则在核小体的外面。每个核小体只有一个H1。
核小体的形成是染色体中DNA压缩的第一个阶段。
#casularm 发表于2007-01-02 23:01:25  IP: 211.162.10.*
原核细胞DNA特点:
1、结构简练
原核DNA分子的绝大部分是用来编码蛋白质的,只有非常小的一部分不转录,这与真核DNA的冗余现象不同。
2、存在转录单元
原核生物DNA序列中功能相关的RNA和蛋白质基因,往往丛集在基因组的一个或几个特定部位,形成功能单位或转录单元,它们可被一起转录为含多个mRNA的分子,叫多顺反子mRNA。
3、有重叠基因
同一段DNA能携带两种不同蛋白质的信息。
#casularm 发表于2007-01-03 13:37:32  IP:
DNA的半保留复制机理(semiconservative replication)
DNA在复制过程中碱基间的氢键首先断裂,双螺旋解旋并被分开,每条链分别作为模板合成新链,产生互补的两条链。这样新形成的两个DNA分子与原来DNA分子的碱基顺序完全一样。因此,每个子代分子的一条链来自亲代DNA,另一条链则是新合成的。
现已查明,无论是原核生物还是真核生物其DNA都是以半保留复制方式遗传的。
#casularm 发表于2007-01-03 18:10:02  IP:
真核生物与原核生物DNA复制的不同点:
真核生物每条染色质上可以有多处复制起始点,而原核生物只有一个起始点;
真核生物的染色体在全部完成复制之前,各个起始点上DNA的复制不能再开始,而在快速生长的原核生物中,复制起始点上可以连续开始新的DNA复制,表现为虽只有一个复制单元,但可有多个复制叉。
#casularm 发表于2007-01-03 20:21:35  IP: 211.162.10.*
转座作用的遗传学效应
1、转座引起插入突变
各种IS、Tn转座子都可以引起插入突变。如果插入位于某操作子的前半部分,就可能造成极性突变,导致该操作子后半部分结构基因表达失活。
2、转座产生新的基因
如果转座子上带有抗药性基因,它一方面造成靶DNA上的插入突变,同时也使这个位点产生抗药性。
3、转座产生的染色体畸变
当复制性转座发生在宿主DNA原有为点附近时,往往导致转座子两个拷贝之间的同源重组,引起DNA缺失或倒位。若同源重组发生在两个正向重复转座区之间,就导致宿主染色体DNA缺失;若重组发生在两个反向重复转座区之间,则引起染色体DNA倒位。
4、转座引起的生物进化
由于转座作用,使一些原来在染色体上相距甚远的基因组合在一起,构建成一个操纵子或表达单元,也可能产生一些具有新的生物学功能的基因和新的蛋白质分子。
#casularm 发表于2007-01-06 20:53:56  IP: 211.162.10.*
现代分子生物学的最基本原理是:基因座位唯一能够自我复制、永久存在的单位,其生物功能是以蛋白质的形式表达出来的。
#casularm 发表于2007-01-06 20:57:56  IP: 211.162.10.*
基因表达包括转录(transcription)和翻译(translation)两个阶段。转录是指拷贝出一条与DNA链序列完全相同(除了T-U之外)的RNA单链的过程,是基因表达的核心步骤;翻译是指以新生的mRNA为模板,把核苷酸三联遗传密码子翻译成氨基酸序列、合成多肽链的过程,是基因表达的最终目的。
#casularm 发表于2007-01-06 21:03:01  IP: 211.162.10.*
生物体内共有3种RNA:
编码特定蛋白质序列的信使RNA(messenger RNA,mRNA)
能特异性解读mRNA中的遗传信息、将其转化成相应氨基酸后加入多肽链中的转移RNA(transfer RNA,tRNA)
直接参与核糖体中蛋白质合成的核糖体RNA(ribosomal RNA,rRNA)
#casularm 发表于2007-01-11 11:24:04  IP: 211.162.10.*
真核生物与原核生物mRNA的特征比较:
真核细胞mRNA的最大特点在于它往往以一个较大相对分子质量的前体RNA出现在核内,只有成熟的、相对分子质量明显变小并经过化学修饰的mRNA才能进入细胞质,参与蛋白质的合成。
原核生物中,mRNA的转录和翻译不仅发生在同一个细胞空间里,而且这两个过程几乎是同步进行的,蛋白质合成往往在mRNA刚开始转录时就被引发了。
一个原核细胞的mRNA(包括病毒)有时可以编码几个多肽,而一个真核细胞的mRNA最多只能编码一个多肽。
原核生物常以AUG(有时GUG,甚至UUG)作为起始密码子,而真核生物几乎永远以AUG作为起始密码子。
#casularm 发表于2007-01-11 13:04:46  IP:
目前尚未发现某个单位点具有转录终止功能,但是实验表明可能存在共同的转录终止机制。
#casularm 发表于2007-01-11 18:43:12  IP: 211.162.10.*
真核基因表达往往伴随着RNA的剪接过程(splicing),从mRNA前体分子中切除被称为内含子(intron)的非编码区,并使基因中被称为外显子(exon)的编码区拼接形成成熟mRNA。
#casularm 发表于2007-01-11 18:46:21  IP: 211.162.10.*
由DNA转录声称的原始转录产物——核不均一RNA(hnRNA,heterogeneous nuclear RNA),即mRNA前体,经过5'加帽和3'酶切加多聚腺苷酸,再经过RNA的剪接,编码蛋白质的外显子部分就连接成为一个连续的可读框(open reading frame,ORF),通过核孔进入细胞质,就能作为蛋白质合成的模板了。
#casularm 发表于2007-01-11 21:12:13  IP: 211.162.10.*
蛋白质合成的过程:
1、翻译的起始
核糖体与mRNA结合并与氨酰-tRNA生成起始复合物
2、肽链的延伸
由于核糖体沿mRNA5'端向3'端移动,开始了从N端向C端的多肽合成,这是蛋白质合成过程中速度最快的阶段
3、肽链的终止及释放
核糖体从mRNA上解离,准备新一轮合成反应
#casularm 发表于2007-01-11 21:36:54  IP: 211.162.10.*
核糖体是蛋白质合成的场所,mRNA是蛋白质合成的模板,转移RNA(transfer RNA,tRNA)是模板与氨基酸之间的结合体。
#casularm 发表于2007-01-11 21:39:09  IP: 211.162.10.*
由一种以上密码子编码同一个氨基酸的现象称为简并(degeneracy),对应于同一个氨基酸的密码子称为同义密码子(synonymous codon)。
#casularm 发表于2007-01-11 22:13:57  IP: 211.162.10.*
反密码子摆动假说:
在密码子与反密码子的配对中,前两对严格遵守碱基配对原则,第三对碱基有一定的自由度,可以“摆动”,因而使某些tRNA可以识别1个以上的密码子。
反密码子第一位为A或C时只能识别1种密码子,为G或U时可以识别2种密码子,为I时可识别3种密码子。
#casularm 发表于2007-01-12 15:06:58  IP: 211.162.10.*
只有tRNA上的反密码子能与mRNA上的密码子相互识别并配对,而氨基酸本身不能识别密码子,只有结合到tRNA上生成AA-tRNA,才能被带到mRNA-核糖体复合物上,插入到正在合成的多肽链的适当位置。
#casularm 发表于2007-01-12 15:47:29  IP: 211.162.10.*
tRNA的种类:
能特异的识别mRNA模板上起始密码子的tRNA称为起始tRNA,其他tRNA统称为延伸tRNA。
几个代表相同氨基酸的tRNA称为同工tRNA。在一个同工tRNA组内,所有tRNA均专一于相同的氨酰-tRNA合成酶。
无义突变的校正tRNA可通过改变反密码子区校正无义突变。
#casularm 发表于2007-01-12 15:50:58  IP: 211.162.10.*
在真核生物中,所有正在进行蛋白质合成的核糖体都不是在细胞质内自由飘浮,而是直接或间接与细胞骨架结构有关联或者与内质网膜结构相连的。
细菌核糖体大都通过与mRNA的相互作用,被固定在核基因组上。
#casularm 发表于2007-01-12 16:52:39  IP: 211.162.10.*
核糖体必须包括至少5个活性中心,即mRNA结合部位、结合或接受AA-tRNA部位(A位)、结合或接受肽基tRNA的部位、肽基转移部位(p位)及形成肽键的部位(转肽酶中心)。此外,还应有负责肽链延伸的各种延伸因子的结合位点。
#casularm 发表于2007-01-12 16:57:34  IP: 211.162.10.*
核糖体小亚基负责对模板mRNA进行序列特异性识别,如起始部分的识别、密码子与反密码子的相互作用等,mRNA的结合位点也在小亚基上。
大亚基负责携带氨基酸及tRNA的功能,肽键的形成、AA-tRNA、肽基-tRNA的结合等。A位、P位、转肽酶中心等主要在大亚基上。
#casularm 发表于2007-01-12 17:03:02  IP: 211.162.10.*
蛋白质的生物合成包括氨基酸活化、肽链的起始、伸长、终止以及新合成多肽链的折叠和加工。
#casularm 发表于2007-01-15 20:39:10  IP:
肽键延伸由许多循环组成,每加一个氨基酸就是一个循环,每个循环包括AA-tRNA与核糖体结合、肽键的生成和移位。
#casularm 发表于2007-01-15 21:05:16  IP:
肽链的延伸过程中,当终止密码子UAA、UAG或UGA出现在核糖体的A位时,没有相应的AA-tRNA能与之结合,而释放因子能识别这些密码子并与之结合,水解P位上多肽链与tRNA之间的二酯键。接着,新生的肽链和tRNA从核糖体上释放,核糖体大、小亚基解体,蛋白质合成结束。
释放因子RF具有GTP酶活性,它催化GTP水解,使肽链与核糖体解离。
#casularm 发表于2007-01-15 21:13:15  IP:
蜂毒素能溶解动物细胞,也能溶解蜜蜂自身的细胞,所以只能在细胞内合成没有活性的前毒素,分泌进入刺吸器后,其N端的22个氨基酸残基被蛋白酶水解,生成有毒性的功能蛋白质。
#casularm 发表于2007-01-15 21:17:11  IP:
蛋白质前体的加工:
新生的多肽链大多数是没有功能的,必须经过加工修饰才能转变为有活性的蛋白质。
1、N端fMet或Met的切除
2、二硫键的形成
3、特定氨基酸的修饰
4、切除新生肽链中非功能片段
#casularm 发表于2007-01-16 11:52:01  IP: 211.162.10.*
蛋白质运转可分为两大类:
1、蛋白质的合成和运转是同时发生的,属于翻译运转同步机制。
2、蛋白质从核糖体上释放后才发生运转,则属于翻译后运转机制。

分泌蛋白质大多是以翻译-运转同步机制运输的。在细胞器发育过程中,由细胞质进入细胞器的蛋白质大多是以翻译后运转机制运输的。而参与生物膜形成的蛋白质,则依赖于上述两种不同的运转机制镶入膜内。
#casularm 发表于2007-01-16 12:05:02  IP:
信号肽假说:
一般认为,蛋白质定位的信息存在于该蛋白质自身结构中,并且通过与膜上特殊受体的相互作用得以表达,这就是信号肽假说的基础。这一假说认为ie,蛋白质跨膜运转信号也是由mRNA编码的。在起始密码子后,有一段编码疏水性氨基酸序列的RNA区域,这个氨基酸序列就被称为信号序列。信号序列在结合核糖体上合成后便与膜上特定受体相互作用,产生通道,允许这段多肽在延长的同时穿过膜结构,因此,这种方式是边翻译便跨膜运转。
#casularm 发表于2007-01-16 23:29:02  IP: 211.162.10.*
信号肽试验结论:
1、完整的信号肽是保证带白质运转的必要条件
2、仅有信号肽还不足以保证蛋白质运转的发生
3、信号序列的切除并不是运转所必需的
4、并非所有的运转蛋白质都有可降解的信号肽

信号肽定义为:能启动蛋白质运转的任何一段多肽。
#casularm 发表于2007-02-08 23:47:58  IP: 211.162.10.*
基因工程是指在体外将核酸分子插入病毒、质粒或其他载体分子中,构成遗传物质的新组合。使之进入原先没有这类分子的寄主细胞内并进行持续稳定的繁殖和表达。
#casularm 发表于2007-02-08 23:50:29  IP: 211.162.10.*
重组DNA的核心是用限制性核算内切酶(restriction endonuclease)和DNA连接酶对DNA分子进行体外切割与连接。
#casularm 发表于2007-02-08 23:54:26  IP: 211.162.10.*
具备自主复制能力的DNA分子就是所谓分子克隆的载体(vector),病毒、噬菌体和质粒等小分子量复制子都可以作为基因导入的载体。
获得了用外源DNA片段和载体分子重组而成的杂种DNA分子后,还必须通过一个被称为细菌转化的过程将其重新导入到寄主细胞中,才能保证重组DNA分子的增殖。
#casularm 发表于2007-02-08 23:59:45  IP:
将带有互补的特定核苷酸序列的单链DNA或RNA混合在一起,其性应的同源区段就会退火形成双链结构。如果退火的核酸来自不同的生物有机体,所形成的双链分子就被称为杂种核算分子。
DNA/DNA的杂交作用,可以用来监测特定生物有机体之间是否存在着亲缘关系,而形成DNA/RNA间杂种分子的能力可被用来揭示核酸片段中某一特定基因的位置。
#casularm 发表于2007-02-09 00:15:17  IP:
细菌转化是指一种细菌菌株由于捕获了来自另一种细菌菌株的DNA而导致性状特征发生遗传改变的生命过程。提供转化DNA的菌株叫做供体菌株,接受转化DNA的细菌菌株则被称为受体菌株。
#casularm 发表于2007-02-10 20:51:41  IP: 211.162.10.*
DNA聚合酶所具有的两种酶催反应的特性:
1、DNA聚合酶能够利用单链的DNA作模板,合成出准确的DNA互补链;
2、DNA聚合酶能够利用2',3'-双脱氧核苷三磷酸作底物,将其掺入到寡核苷酸链的3'-末端,从而终止DNA链的生长。
#casularm 发表于2007-02-10 20:54:26  IP: 211.162.10.*
DNA杂交测序实质上包括两个主要的步骤,首先是将待测定的靶DNA分子同一组已知其核苷酸顺序的寡核苷酸探针进行杂交,然后与那些能够同靶DNA形成完全的双链杂合分子的寡核苷酸探针作比较分析,并据此推算出靶DNA的核苷酸序列。
#casularm 发表于2007-02-10 21:00:21  IP: 211.162.10.*
聚合酶链式反应(PCR技术)是一种在体外快速扩增特定基因或DNA序列的方法,故又称为基因的体外扩增法。首先将双链DNA分子在临近沸点的温度下加热分离成两条单链DNA分子,DNA聚合酶以单链DNA为模板并利用反应混合物中的四种脱氧核苷酸三磷酸合成新生的DNA互补链。因为DNA聚合酶需要有一小段双链DNA来启动(“引导”)新链的合成,所以,新合成的DNA链的起点,事实上是由加入到反应混合物中的一对寡核苷酸引物在模板DNA链两端的退火位点决定的。
#casularm 发表于2007-02-10 21:09:12  IP: 211.162.10.*
细菌质粒是存在于细胞质中的一类独立于染色体并能自主复制的遗传成分,虽然已发现有线性质粒,但已知的绝大多数的质粒都是由环形双链DNA组成的复制子。
除了酵母的杀伤质粒是RNA质粒之外,迄今已知的其他质粒都属于这种类型的DNA分子。
质粒DNA分子可以持续稳定地处于染色体外的游离状态,也可能在一定的条件下被可逆性整合到寄主染色体上,随着染色体的复制而复制,并通过细胞分裂传递到后代。
#casularm 发表于2007-03-06 16:25:45  IP: 218.104.71.*
基因表达调控主要表现在以下两方面:
1、转录水平上的调控(transcriptional regulation)
2、转录后水平上的调控(post-transcriptional regulation),包括mRNA加工成熟水平上的调控(differential processing of RNA transcript)和翻译水平上的调控(differential translation of mRNA)。
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