CentOS6.5安装配置caffe

安装好CentOS6.5操作系统，选择带Desktop的。

安装前必读

1.caffe官网installation tutorial，http://caffe.berkeleyvision.org/installation.html
2.cuda官网installation tutorial，http://docs.nvidia.com/cuda/cuda-installation-guide-linux/#axzztXgfVMJ8

官网的教程是最应该的读的安装教程。

假如从https://github.com/BVLC/caffe上下载的是caffe-master.zip文件。

开始安装

1.安装gcc和g++。

版本要求是能支持c++11，如果装MATLAB，不能超过gcc-4.7。
安装gcc-4.7.0，参考：http://blog.csdn.net/chieryu/article/details/50218597
安装完后，确认版本：

#gcc --version
#g++ --version

2.安装cuda。

这步比较费时间，具体，参考：http://blog.csdn.net/chieryu/article/details/50218597

3.安装一些依赖库。

# yum install atlas-devel snappy-devel boost-devel leveldb leveldb-devel hdf5 hdf5-devel  glog glog-devel gflags gflags-devel protobuf protobuf-devel opencv opencv-devel lmdb lmdb-devel

采用yum从repository中安装这些依赖，是因为简单方便且版本大都符合要求。

确保boost的版本大于1.55，如果boost版本不满足要求，则可以单独编译自己的boost。我的CentOS6.5中默认安装的包如下：

官网要求和经验得出，图中用黑框框出来的包都是不符合要求的。

4.安装boost。

下载boost_1_59_0.tar.gz文件，执行以下过程。

#yum remove boost boost-devel
#tar -xvf boost_1_59_0.tar.gz
#cd boost_1_59_0
#./bootstrap.sh --prefix=/usr/local
#./b2
#./b2 install

boost的编译要些时间。

5.安装cmake。

下载cmake，为下一步编译OpenCV做准备，gitHub有人写的自动编译OpenCV的脚本，但是在我的机器上执行出错了。因此，我需要自己编译OpenCV。
从网站https://cmake.org/download/下载：cmake-3.4.1-Linux-x86_64.sh

#sudo sh cmake-3.4.1-Linux-x86_64.sh

这个会自动下载cmake-3.4.1的release文件到当前目录下的cmake-3.4.1-Linux-x86_64文件夹中。

6.安装opencv-2.4.9。

下载opencv-2.4.9。建议用浏览器下载，因为它比wget要快。下载地址：https://github.com/Itseez/opencv/tree/2.4.9

#yum remove opencv opencv-devel
#unzip opencv-2.4.9.zip
#./cmake-3.4.1-Linux-x86_64/bin/cmake-gui

得到如下情况，设置好where is the source code和where is the binaries。
然后将gpu和cuda选项去掉。

configure 2次，并generate之后，在执行：

#cd opencv-2.4.9
#make -j16
#make install

经过10分钟左右就安装好了opencv了。

7.安装protobuf。

从gitHub https://github.com/google/protobuf/tree/v2.6.1下载protobuf-2.6.1或从其他地方下载protobuf-2.6.1.tar.gz。
认真阅读gitHub上给出的安装教程。

#yum remove protobuf protobuf-devel
#./autogen.sh
#./configure --prefix=/usr
#make -j16
#make check -j16
#make install

没有出现问题，那么protobuf-2.6.1就安装好了。

8.安装caffe了。

从gitHub https://github.com/BVLC/caffe 上下载caffe-master.zip文件。

#unzip caffe-master.zip
#mv caffe-master ../
#cd ../caffe-master
#make all -j16
#make test -j16
#make runtest -j16

如果没有出错，到目前为止，就算caffe暂时成功了。

问题和错误

我的安装过程中出现的问题和错误比较多，都是血的教训啊，记录如下：

1. 安装完驱动后，开机不了。

原因是安装的驱动不适合我的显卡，而我又把nouveau驱动禁止了。我的解决办法就是重装系统后安装合适的驱动。由于之前备份过initramfs，此处应该可以修改grub.conf文件的，但是比较菜，觉得重装系统更快些。

1. 执行./deviceQuery的时候，FATAL:MODULE nvidia not found.cudaGetDevicecount
   returned 38.
   驱动不适合，安装驱动失败。解决办法是安装NVIDIA-Linux-x86_64-358.16.run

4.出现如下错误，Failed to restart LSB:Bring up/down netwroking：

这是因为我的台式机使用的是我的本基本MAC地址，MAC地址不一致导致的。解决办法是在/etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0文件中将ONBOOT=yes改成ONBOOT=no就可以了。

5.编译OpenCV时，出现

nvcc fatal : Unsupported gpu architecture ‘compute_11’
CMake Error at cuda_compile_generated_matrix_operations.cu.o.cmake:208 (message):
原因是驱动不合适，错在NVCC，重装驱动。
总之，安装驱动，我是笨笨地试了好几次。

5.编译OpenCV时，前面还比较快，可是到了79%的时候，开始出奇的慢，显示是在编译各种.cu文件，算了一下大概要15分钟才过1%。

解决办法是用cmake勾掉gpu和cuda，不让它编译cu文件。

6.编译caffe的时候，make all,make test,make runtest都提示：

make: warning: Clock skew detected. Your build may be incomplete.
make: Warning: File `/usr/local/cuda/include/cublas_v2.h’ has modification time 6.8e+03 s in the future

导致每次都要重新编译src下的一些.cpp文件，严重浪费了很多时间。

解决办法是：

#sudo date -s '13:49:00 2015-12-07'
#hwclock  （说明：写入BIOS,避免失效。）

7.在make runtest的时候出现下面的错误。

[----------] 9 tests from AdaGradSolverTest/3, where TypeParam = caffe::GPUDevice<double>
[ RUN      ] AdaGradSolverTest/3.TestAdaGradLeastSquaresUpdate
libprotobuf ERROR google/protobuf/text_format.cc:169] Error parsing text-format caffe.SolverParameter: 1:23: Expected identifier.
F1207 19:34:53.711594 12333 test_gradient_based_solver.cpp:54] Check failed: google::protobuf::TextFormat::ParseFromString(proto, &param) 
*** Check failure stack trace: ***
    @     0x7f7d952abe1d  google::LogMessage::Fail()
    @     0x7f7d952adbd3  google::LogMessage::SendToLog()
    @     0x7f7d952aba38  google::LogMessage::Flush()
    @     0x7f7d952ae42e  google::LogMessageFatal::~LogMessageFatal()
    @           0x7133a0  caffe::GradientBasedSolverTest<>::InitSolverFromProtoString()
    @           0x737603  caffe::GradientBasedSolverTest<>::RunLeastSquaresSolver()
    @           0x744da7  caffe::GradientBasedSolverTest<>::TestLeastSquaresUpdate()
    @           0x8dcada  testing::internal::HandleExceptionsInMethodIfSupported<>()
    @           0x8d2679  testing::Test::Run()
    @           0x8d2757  testing::TestInfo::Run()
    @           0x8d2895  testing::TestCase::Run()
    @           0x8d2c05  testing::internal::UnitTestImpl::RunAllTests()
    @           0x8dc65a  testing::internal::HandleExceptionsInMethodIfSupported<>()
    @           0x8d1ee1  testing::UnitTest::Run()
    @           0x4fd4f2  main
    @       0x36f8c1ed5d  (unknown)
    @           0x503f29  (unknown)
make: *** [runtest] Aborted (core dumped)

可知错误代码在InitSolverFromProtoString()这个函数里，进到函数里发现调用的是protobuf。
原因是caffe-master使用的protobuf版本是2.6.0及以上，而我yum install的protobuf是2.3.0，因此更新protobuf可以解决。

8.出现了下面的错误。

/opt/centos/devtoolset-1.0/root/usr/libexec/gcc/x86_64-redhat-linux/4.7.0/ld: cannot find -lcblas
/opt/centos/devtoolset-1.0/root/usr/libexec/gcc/x86_64-redhat-linux/4.7.0/ld: cannot find -latlas
collect2: error: ld returned 1 exit status
make: *** [.build_release/lib/libcaffe.so] Error 1

执行这个命令

#find / -name libcblas.so

并将路径加到环境变量中，仍不起作用。

解决办法是：打开caffe-master/Makefile，在文件中添加路径ATLAS_DIRS，修改结果如下：

INCLUDE_DIRS += $(BLAS_INCLUDE)
ATLAS_DIRS = /usr/lib64/atlas
LIBRARY_DIRS += $(BLAS_LIB)
LIBRARY_DIRS +=$(ATLAS_DIRS)

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