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转载 从决策树学习谈到贝叶斯分类算法、EM、HMM
第一篇:从决策树学习谈到贝叶斯分类算法、EM、HMM (Machine Learning & Data Mining交流群:8986884)引言 最近在面试中,除了基础 & 算法 & 项目之外,经常被问到或被要求介绍和描述下自己所知道的几种分类或聚类算法(当然,这完全不代表你将来的
2014-02-28 09:33:38 1467
转载 基因芯片(Affymetrix)分析3:获取差异表达基因
芯片质量分析芯片数据预处理获取差异表达基因GO和KEGG分析聚类分析(本文于2013.09.04更新)“差异”是个统计学概念,获取差异表达基因就要用统计方法,R的统计功能很强大,适合做这样的事情。 用前面的方法读取数据:library(affy)library(tcltk)filters matrix(c("CEL file", ".[Cc][Ee][Ll]",
2014-02-24 20:33:08 2233
转载 基因芯片(Affymetrix)分析2:芯片数据预处理
芯片质量分析芯片数据预处理获取差异表达基因GO和KEGG分析聚类分析(本文于2013.09.04更新)基因芯片技术的特点是使用寡聚核苷酸探针检测基因。前一节使用ReadAffy函数读取CEL文件获得的数据是探针水平的(probe level),即杂交信号,而芯片数据预处理的目的是将杂交信号转成表达数据(即表达水平数据,expression level data)。存储探针水平数据的
2014-02-24 10:17:30 1908
转载 偏相关系数
在多元相关分析中,简单相关系数可能不能够真实的反映出变量X和Y之间的相关性,因为变量之间的关系很复杂,它们可能受到不止一个变量的影响。这个时候偏相关系数是一个更好的选择。偏相关系数是在排除了其他变量的影响下计算变量间的相关系数。假设我们需要计算X和Y之间的相关性,Z代表其他所有的变量,X和Y的偏相关系数可以认为是X和Z线性回归得到的残差Rx与Y和Z线性回归得到的残差Ry之间的简单相关系数,
2014-02-19 09:24:22 8705
转载 R入门
基础ls()显示内存中的对象rm()删除内存中对象,rm(list=ls())删除全部?lm显示帮助help(lm)帮助getwd()获取当前工作目录setwd("C:/data")改变工作目录从外部文件中读取数据mydatascan()返回一个数值型向量read.fwf()用于读取固定宽度格式的数据存储数据
2014-02-12 10:50:25 747
转载 R语言编程入门--replicate()函数比较有意思!
I. 导论简单来讲,编程是借助计算机来解决某个问题。学习编程的就是训练我们解决问题的能力。有这样一种说法:在未来,不会编程的人即是文盲。1 为什么要学习R编程大部分情况下解决某些问题还需要依赖一些事实或数据,结合数据分析的框架和计算工具来帮助我们决策和判断。这时候R语言编程就会派上用场。例如从大的方面来看,投资方要决定在何处建立风力发电场,就需要采集天气数据加以建模分析
2014-02-12 10:49:44 13048
R for Beginners
2013-06-20
空空如也
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