如何搭建一个网页版的BLAST服务器

如何搭建一个网页版的BLAST服务器

胖丫今天跟我说：“师兄，再来给我调调网络呗？公共BLAST服务器太慢了，半天刷新不出来！”我说：“我们这是百兆宽带到桌面，刷新慢不是网络的问题，是你离人家的服务器太远了！L”胖丫一脸委屈的说：“要不我去人家有服务器的实验室申请个博士读读？”。“……”

不知道大家平时用公共BLAST服务器时有没有遇到刷新慢的问题？或者想比对一些公共数据库中没有的个性化数据？今天，我们这里写一个简单教程，来教大家搭建一个网页版（图形界面）BLAST服务器，用来解决上述问题（当然，也可以解决胖丫读博士的问题）。在搭建BLAST服务器之前，你应该先准备一个Ubuntu（Linux）系统。至于Ubuntu系统的安装，网上有很多教程，大家可以自行搜索，比如https://jingyan.baidu.com/article/3c48dd348bc005e10be358eb.html。当然，你也可以将Ubuntu系统安装到自己电脑的虚拟机里。如果只是用来做BLAST服务器的话，对电脑硬件的要求着实不高，平时实验室用的台式机就好。

系统安装好之后，我们就可以开始安装BLAST服务器了，这类软件有wwwblast、viroBLAST和Sequenceserver (http://www.sequenceserver.com)。前面我们我们已经介绍过viroBLAST的安装及使用(本地网页版blast)，今天介绍Sequenceserver。Sequenceserver相当于NCBI-BLAST（ncbi-blast+）的前端图形交互界面，是用Ruby语言写的，因此在安装之前应该先安装Ruby、Ruby编译环境（ruby-dev）以及Rbuy的软件包管理系统（rubygems-integration）。大家可以在bash里面输入下面的命令（命令输入完毕后要按回车执行 #开头的行是命令说明）：

 
 
 

  
#安装依赖软件包
  
sudo apt install ncbi-blast+ ruby ruby-dev rubygems-integration