2010年06月_生信宝典

11月 08月 07月 06月

转载详细讲述CV的创作与包装

这里我想与各位虫友分享一下我个人在CV写作上的经验与心得，这里用了一个比较醒目的标题“创作与包装”，之所以这么写，只是想一改传统CV写作的枯燥与陈腐，给大家带来一股清新的写作风格。当然，这个说起来容易，却不容易做到。这里，我将会毫无保留地与大家交流下我个人的想法与体会。 首先，根据我个人的感觉，CV比PS重要！不仅更重要，而且是首要的。 对于绝大多数教授而言，首先入目的都一定是你的CV，而绝不是PS。我为什么这么说呢？因为我告诉你我在什么情况才下会出示

2010-06-26 16:08:00 885

转载 PS（留学动机）的妙用——扭转你的劣势

前面我已经谈了，CV先于PS，教授先看CV，后看PS。在某种程度上，PS就是对你的CV进行必要的说明与扩展。这里，请允许我用强调的语气：CV的价值与要义就在于你要尽一切可能避免你的申请在最初的审查中就被刷掉！如果你做到了，那么恭喜你，在接下来，你需要快速转动你的右脑，因为在某种程度上，你已经进入了一个谈判环节。尤其对于那些手持CSC重要砝码的同学，已经占有了一定的先机。 在CV篇我已经讲过了，只要你足够Tricky，通过最初的简历审查并不难，但前提是你得自己先确定你对教授

2010-06-26 16:06:00 2618

转载【毕业前夕，畅谈科研】一个清华土著的科研感想

很感谢小木虫网站，三年前，当我还没有一篇文章的时候，是这里让我起航，插上放飞的翅膀！现在讲讲我的一些科研感受，和同学们分享一下。 从清华本科毕业的时候，出于对科研的热爱和相信国内同样可以做出成绩的信念，选择了在本校读工学直博士，而今已经4个年头，再过一年就要毕业了。目前已发表的SCI源刊有10篇，影响因子大约30，此外有一些专利，刚被一个高水平的国际大会邀请作特邀报告。下面主要是对低年级同学们的建议，当然希望对科研能力已经较强的高年级同学也有些帮助吧。 1. 方

2010-06-26 15:40:00 738

转载生活不是拍电影，不会在关键时刻有个人来救你。

1. 永远记住，你的胳膊肘是你身上最强壮的地方。如果能用，一定要用。 2. 如果强匪问你要钱包，不要递给他。拿起钱包向远处丢。一般情况下，他会对你的钱包比对你更有兴趣。等他往那个方向转的时候，你要向相反的方向拼命地跑。 3. 强匪抢包的时候，你不要舍不得。你包里再贵的东西都可以再买一次。但是你的生命买不来。 4. 强匪入家门抢东西，你最好不要废话罗嗦。保持清醒。不要想和他说话分散他的注意力。他知道你想干什么。

2010-06-16 08:27:00 1383 1

转载 xming+putty在windows下远程linux主机图形界面程序及putty乱码解决

一、原理 Linux/Unix的X Window具有网络透明性。X Window系统里有一个统一的Server来负责各个程序与显示器、键盘和鼠标等输入输出设备的交互，每个有GUI的应用程序都通过网络协议与Server进行交互。所以对于任何一个应用程序，本地运行和远程运行的差别仅仅是X Server的地址不同，别的没有差别。所以在Windows运行一个X Server，就可以很方便的远程运行有GUI的Linux应用了。同时，OpenSSH具有X转发功能，可以将Linux主机的X程序通过S

2010-06-13 13:57:00 5692

转载 BASH 比较运算小结［转载小蜗牛五二］

版权声明：原创作品，允许转载，转载时请务必以超链接形式标明文章原始出处、作者信息和本声明。否则将追究法律责任。http://snailwarrior.blog.51cto.com/680306/154788【小蜗牛五二无聊之作】网络上能找到的相关资料太多了，也太繁杂，但有些人还整理得不错，下面根据自己的偏好再梳理一下，有些是自己对照着man手册翻译的，下面的例子都是自己编造自己测试OK，都是比较实用的东西，方便自己日后参考。 1、算术运算比较运算符(bash自身不能比

2010-06-13 08:44:00 546

转载玩转lib-notify （转自PT牛的博客）

玩转libnotify分类： Unix/Linux 发布于： 2009.05.22 星期五Ubuntu 9.04一个特性就是新的通知机制Notify OSD，让人一眼看上去很酷的样子，其实只是基于libnotify的调用，别看又DBUS又OSD那么复杂，其实一点都不神秘，跟PT来：12345678#!/usr/bin/python#coding:utf-8import pynotifypynotify.init("PT-Title")n = pynotify.N

2010-06-13 08:12:00 2797

原创 ubuntu下gvim启动出现gtk warning Invalid input string

问题： 安装 Ubuntu 10.04 Lucid Lynx后，GVim无法正常显示中文菜单。 错误信息： 引用:Gtk-WARNING **: Invalid input string 原因： Ubuntu 10.04 Lucid Lynx默认安装将会把中文区域设置为zh_CN.utf8，而GVim能识别的中文区域设置为zh_CN.UTF-8。因此GVim会

2010-06-12 10:52:00 1899

转载 IPV6资源

IPv6资源 校内资源： 支持IPv6的视频点播 碧海青天bbs站（telnet需要客户端支持IPv6） CERNET2资源： WEB资源： CERNET2: www.cernet2.edu.cn 上海交通大学 IPv6论坛 清华大学IPv6 ipv6.tsinghua.edu.cn 上海交通大学IPv6实验站 ipv6.sjtu.edu.cn 北京大学

2010-06-11 19:30:00 1789

转载 CentOS 5安装mplayer

编译安装MPlayer好麻烦.其实centos也可以用yum安装 MPlayer. (rhel也可用) 看一下centos 5的部分: CentOS 5 首先确定你安装了ProtectBase .Protectbaseyum-protectbase在CentOS 5包仓库里面有提供:#yum install yum-protectbase 在CentOS 5里面这个插件默认启动 . 编辑/etc/yum.repos.d

2010-06-11 19:26:00 608

原创 UBuntu安装后配置

#!/bin/bashset -x##安装之后先更新updatesudo apt-get updatesudo apt-get upgrade##这是系统升级所用#sudo apt-get dist-upgrade#sudo apt-get -f install##安装压缩工具rar, 7zipsudo apt-get install p7zipsudo apt-get install rar unrarsudo ln -fs /usr/bin/rar /usr/

2010-06-11 15:07:00 635

转载 ubuntu10.04的源

#----------10.4------------------------------- deb http://mirror.bjtu.edu.cn/ubuntu/ lucid main restricted universe multiverse deb http://mirror.bjtu.edu.cn/ubuntu/ lucid-backports main restricted universe multiverse deb http://m

2010-06-11 14:01:00 418

原创常用命令别称脚本

#!/bin/bashif test -e ${HOME}/.bashrcthen cp ${HOME}/.bashrc ${HOME}/.bashrc.bakficat <<EOF >>${HOME}/.bashrcalias cp='cp -pi'alias rm='rm -i'alias mv='mv -i'alias grep='grep --color'alias ssh='ssh -Y'alias man="TERMINFO=

2010-06-11 14:00:00 602

转载 Ubuntu的简单远程控制和远程桌面

安全方便的简单控制-ssh 安装服务器：apt-get ssh，服务器基本不用怎么配置就可以使用。客户端一版不用安装，Linux都自带了，windows平台下可以使用putty，非常好用。 操作命令：ssh username@host_address ssh登录之后就像本机使用命令行登录是一样的，虽然只能使用字符界面，但基本上能够完成大部分管理工作了。有人说配合screen是十分好用的，不过我还没有仔细研究过screen。 最省事儿的X转发

2010-06-11 13:29:00 627

转载 Ubuntu 命令技巧

源地址：http://wiki.ubuntu.org.cn/UbuntuSkills 目录[隐藏]1前言2安装升级2.1查看软件xxx安装内容2.2查找软件库中的软件2.3显示系统安装包的统计信息2.4显示系统全部可用包的名称2.5显示包的信息2.6查找文件属于哪个包2.7查看已经安装了哪些包2.8查询软件xxx依赖哪些包2.9查询软件xxx被哪些包依赖2.10增加一个光盘源2.11系统升级2.12清除所有已删除包的残馀配置文件2.13编译时缺少h文件的自动处理2.14查看安装软件

2010-06-11 10:04:00 866

转载 Ubuntu 命令技巧

2010-06-11 09:52:00 1108

原创 Ubuntu删除和新建用户

1）新建用户：sudo useradd -m newuser 可创建家目录，但是显示有问题，而且不能命令回顾。 2）删除用户：sudo userdel -r uewuser. 彻底删除，在删除用户的同时一起把这个用户的宿主目录和邮件目录删除。 3）新建用户：sudo adduser newuser OK

2010-06-11 09:50:00 2832

转载 IT行业培训必读：优秀程序员的十个习惯

在这个世界上，有数百万的人热衷于软件开发，他们有很多名字，如：软件工程师（Software Engineer），程序员（Programmer），编码人（Coder），开发人员（Developer）。　　经过一段时间后，这些人能够成为一个优秀的编码人员，他们非常熟悉如何用计算机语言来完成自己的工作。但是，如果你要成为一个优秀的程序员，你还可以需要有几件事你需要注意，如果你能让下面十个条目成为你的习惯，那么你才能真正算得上是优秀程序员。　1. 学无止境　　就算是你有了10年以上的程序员经历，你也得要使劲地学习，

2010-06-11 07:25:00 687

转载乔布斯演讲

http://v.youku.com/v_show/id_XODgxOTMzNTI=.html I'm convinced that the only thing that kept me going was that I loved what I did. 我坚信让我一往无前的唯一力量就是我热爱我所做的一切 You've got to find what you love, and

2010-06-08 11:22:00 618

原创转换文件名中空格为下划线（借鉴他人经验）

#!/bin/bashfind . -name "* *" |while read name; do na=$(echo $name | tr ' ' '_') mv "$name" $nadone#!/bin/bash#Replace all spaces in the files in current directory and subfolder with#underline.for x in `ls -R`; do mv "$x" `echo -n $x

2010-06-06 13:55:00 3303

转载 [Perl] Python 与 Perl 合并，打造史上最牛语言 Parrot

本文链接: http://www.php-oa.com/2010/04/01/python-perl-parrot.html 据Perl官方网站的消息，Perl之父Larry Wall和Python之父Guido van Rossum 4月1日联合宣布，经过一年的酝酿，决定合并两大技术社区，吸收两大语言的优势，开发出史上最牛编程语言，这种语言的名字将是Parrot（鹦鹉）。 Guido van Rossum在采访中表示，之所以取这个名字，首先是要保持以P开头。而Lar

2010-06-05 21:50:00 1321

转载 [perl]perl界大牛唐凤传说

转载本站文章请注明，转载自：扶凯[http://www.php-oa.com] 本文链接: http://www.php-oa.com/2009/11/11/perl-audrey-tang.html 上次2009 Beijing Perl Workshop(bjpw2009) 的大全中，一直想见到这个人，可惜因为身体不舒服没有来北京。就象别人讲的”我想了解唐凤工作的方式的爱好者都不难想象，以她那样的工作方式，迟早会累垮的，结果真的积劳成疾，累倒了。”

2010-06-05 21:48:00 7709

原创 MPI安装脚本

#!/bin/bashset -xwget urltar zxvf ~/mpich2*cd ~/mpich2*./configure --prefix=/usr/local/mpich2 --enable-sharedlibs=gcc nake#make 2>&1 | tee m.txtsudo make install#/usr/local/bin/sbin/mpeuninstall may be used to remove the installationech

2010-06-05 20:48:00 1144 1

原创并行计算部分总结

1。计算机的峰值为主频x4。2。计算机读取数组时，一次会读入一行，要最大限度的利用已读入的数据，减少频繁读写的次数。3。多线程内存共享，多进程需要消息传递来交换变量。4。利用管道在不同程序之间传递内容（可以是管道符｜或mkfifo mypipe）5。平均不同节点的计算量，尽量做到负载平衡。6。数据分块是每块大小尽可能为cache的1/3。7。MPI_CHAR 为一个字符，但不一定是一个字节。8。在MPI_Init()之后再处理命令行参数。9。MPI_Recive()出现在MP

2010-06-05 17:48:00 4747

原创自己常用的LINUX命令（20100605更新）

<2.为了知道你的系统所支持的语言列表，可以查看以下的路径 (针对 Unix)： /usr/lib/locale /usr/share/locale3.配置虚拟地址ifconfig eth0:2 192.168.0.1 netmask 255.255.255.0 up4.valgrind --tool=memcheck myc >&~/tmp（可用于检查程序的内存问题）valgrind

2010-06-05 14:42:00 901

原创 Python跨文件引用模块

想作一个python模块库，自己时时调用。 文件层级结构 ~/bin: ---pylib pybin ~bin/pylib: ---notify __init__.py ~bin//pybin: ---ct_weather.py ~/bin/pylib/notify ---ct_notifyGTK.py __init__.py ~bin/pylib/__init__.py import

2010-06-05 14:14:00 5192

原创一个可用的MakeFile模板［综合别人的经验］

cc=gccCFLAGS= -g -Wall LINK=-lmLIBS=-I/home/ct/clibOBJECTS = ct_main.oSOURCES = ct_main.c.c.o: $(cc) $(CFLAGS) -c -o $@ $ $@.$$$$; / sed 's,/($*/)/.o[ :]*,/1.o $@ : ,g' $@; / rm -f $@.$$$$ include $(SOURCES:.c=.d)main:$(OBJECTS) $(

2010-06-05 14:01:00 594

转载什么更重要。。。

NO.1 方向比努力重要　　现在是讲究绩效的时代，公司、企业、政府，需要的是有能力且能与企业方向共同发展的人，而不是一味努力但却南辕北辙的人。自己适合哪些行业，哪些职业，有很多东西是先天决定的，只有充分地发掘自己的潜力，而不是总与自己的弱点对抗，一个人才能出人头地，就像现在很多企业招聘的时候，他们相信通过培训和教育可以让火鸡学会爬树，但是还是觉得选个松鼠方便一些。方向不对，再努力、再辛苦，你也很难成为你想成为的那种人。　　NO.3 能力比知识重要　　知识在一个人的构架里只

2010-06-04 19:13:00 551

转载转：用人单位给计算机系学生的一封信

转：用人单位给计算机系学生的一封信作者：feique123 提交日期：2008-7-30 13:00:00 | 分类: | 访问量：69 　　　　今天上午又去招聘了，加上前面一段时间的招聘经验，有些话不吐不快。　　　　我们希望找到能干活的人，就是能编程序的人，但是我感觉现在刚毕业的人里面，包括名校的，能干活的人比例非常的低，大概不超过百分之一。　　　　很多人都说，没有参加过实际的项目，没有经验，希望能够在工作过程中学习等等，开始的时候我也这样认为，随着面试的

2010-06-04 16:46:00 511

转载 C/C++传递二维数组［转载］

#include void func(int n, char str[][5]){ int i; for (i = 0; i void func(int n, char (*str)[5]){ int i; for (i = 0; i

2010-06-04 15:21:00 392

Masterminds of programming

　　Description 　　 Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. Think along with Adin D. Falkoff (APL), James Gosling (Java), Bjarne Stroustrup (C++), and others whose vision and hard work helped shape the computer industry. You'll find advice you can apply to systems you're developing, even if you don't use the specific languages being discussed. 　　Full Description 　　Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. In this unique collection, you'll learn about the processes that led to specific design decisions, including the goals they had in mind, the trade-offs they had to make, and how their experiences have left an impact on programming today. Masterminds of Programming includes individual interviews with: 　　* Adin D. Falkoff: APL 　　* Thomas E. Kurtz: BASIC 　　* Charles H. Moore: FORTH 　　* Robin Milner: ML 　　* Donald D. Chamberlin: SQL 　　* Alfred Aho, Peter Weinberger, and Brian Kernighan: AWK 　　* Charles Geschke and John Warnock: PostScript 　　* Bjarne Stroustrup: C++ 　　* Bertrand Meyer: Eiffel 　　* Brad Cox and Tom Love: Objective-C 　　* Larry Wall: Perl 　　* Simon Peyton Jones, Paul Hudak, Philip Wadler, and John Hughes: Haskell 　　* Guido van Rossum: Python 　　* Luiz Henrique de Figueiredo and Roberto Ierusalimschy: Lua 　　* James Gosling: Java 　　* Grady Booch, Ivar Jacobson, and James Rumbaugh: UML 　　* Anders Hejlsberg: Delphi inventor and lead developer of C# 　　If you're interested in the people whose vision and hard work helped shape the computer industry, you'll find Masterminds of Programming fascinating.　　

2010-12-26

Python在Unix和Linux系统管理中的应用

作者：Noah Gift,Jeremy M. Jones 出版日期：2009年4月出版社：O'Reilly 页数：433 ISBN：978-7-80205-738-8 文件格式：PDF 《Python在Unix和Linux系统管理中的应用》展示了Python语言如何提供一种更加高效的方式来处理Unix和Linux服务器管理工作中的各种任务。本书的每一章都会提出一个特定的管理问题，例如并发或数据备份，然后通过实际的例子提供基于Python的解决方案。你将学习使用 Python开发一套属于自己的命令行工具，并用来解决一系列范围很广的问题。本书作者们还构建了一个可以免费下载的Ubuntu虚拟机。该虚拟机包含了这本书的源代码，还可以用来运行书中的实例，包括SNMP、IPython、SQLAlchemy和许多其他工具。通过这本书，你将发现Python是怎样帮助你： * 读入文本文件并提取信息 * 使用线程和派生子进程的选项并发地运行多个任务 * 使用网络工具从一个进程传送信息到另一个进程 * 创建更易互动的可点击图形界面工具 * 通过与SNMP交互来用程序监控大型多个集群机器 * 掌握IPython的命令环境来替代或增强Bash、Korn或Z-Shell的功能 * 将云计算集成到基础架构中并编写一个基于谷歌应用程序引擎的应用 * 利用定制脚本来解决特殊的数据备份的挑战 * 使用Django、SQLAlchemy和Storm对象关系模型来与数据库交互通过本书及其辅助虚拟机，你将学习如何打包并部署Python应用程序和库文件，以及如何编写在多个Unix和Linux平台下都运行良好的代码。 “这本书适用于Python新手，不管他们是否具有命令环境脚本编写的经验或者总体上相对而言就是编程初学者。Jeremy和Noah都很注意为自己的理由给出支持材料，并且解释这些代码实例在实际中的运用。与许多轻易就让新手不堪重负的编程书籍不同，本书尽一切努力来让这些新手们获得自信和成功。” ——Ruth Suehle和Bascha Harris，Red Hat杂志 Noah Gift在加州理工学院、迪斯尼、Feature Animation和Turner Studios具有十年以上的Unix和Linux开发经验。他是Giftcs和Cloud Seed软件公司的合伙人。 Jeremy M.Jones是Predictix公司的软件工程师，同时也是开源项目Munkware、ediplex和podgrabber的作者。

2010-12-18

gvim常用插件及其配置文件配置（下载解压即可使用）

gvim常用插件及其配置文件支持c，perl，python，latex。需要自己安装ctags .vim: after compiler doc indent ltags perl-support skeleton syntax autoload c-support ftdetect keymap Makefile plugin snipMate.vim.ct tools colors CVIMSYN ftplugin latextags Makefile.in README.csupport snippets .vim/after: ftplugin plugin syntax .vim/after/ftplugin: c_snippets.vim java_snippets.vim python_pydiction.vim python_snippets.vim sh_snippets.vim .vim/after/plugin: .vim/after/syntax: cpp.vim c.vim java.vim .vim/autoload: acp.vim perlsupportgui.vim perlsupportprofiling.vim perlsupportregex.vim snipMate.vim .vim/colors: desertEx.vim peachpuff.vim zenburn.vim .vim/compiler: tex.vim .vim/c-support: codesnippets doc rc scripts templates wordlists .vim/c-support/codesnippets: calloc_double_matrix.c main.cc print_array.cc.noindent calloc_int_matrix.c Makefile print_double_array.c.noindent main.c Makefile.multi-target.template print_int_array.c.noindent .vim/c-support/doc: ChangeLog c-hotkeys.pdf c-hotkeys.tex .vim/c-support/rc: customization.ctags customization.gvimrc customization.indent.pro customization.vimrc .vim/c-support/scripts: wrapper.sh .vim/c-support/templates: c.comments.template cpp.comments.template cpp.preprocessor.template c.statements.template c.cpp.template cpp.cpp.template cpp.statements.template Templates c.idioms.template cpp.idioms.template c.preprocessor.template Templates~ .vim/c-support/wordlists: c-c++-keywords.list c-c++-keywords.list.bak k+r.list stl_index.list .vim/CVIMSYN: engspchk.contraction engspchk.dialect engspchk.dict engspchk.match engspchk.proper engspchk.rare .vim/doc: acp.jax latexhelp.txt latex-suite-quickstart.css Makefile taglist.txt acp.txt latex-suite latex-suite-quickstart.html Makefile.in tags catalog.xml la

2010-08-17

Data Mining in Bioinformatics 生物信息中的数据挖掘

Jason T.L. Wang, Mohammed J. Zaki,Hannu T.T. Toivonen and Dennis Shasha (Eds) Summary The aim of this book is to introduce the reader to some of the best techniques for data mining in bioinformatics in the hope that the reader will build on them to make new discoveries on his or her own. The book contains twelve chapters in four parts, namely, overview, sequence and structure alignment, biological data mining, and biological data management.

2010-03-02

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition I. Clustering, II. Document retrieval and representation, III. Email surveillance and filtering, and IV. Anomaly detection. 著名大师Michael W. Berry的经典力作！

2010-03-02

比perl好的生物信息学语言python

比perl好的生物信息学语言python，简明教程！

2009-09-26

空空如也

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