3Dslicer1:入门及基本控制

1.用户环境



  • 模块面板:显示模块界面,Slicer中功能通过模块化的方式实现;
  • 切片窗口:显示三个切片分量,冠状面R、矢状面Y、水平面G;
  • 数据探针:用于显示鼠标在切片视图中移动时的实时坐标信息。

1.1 系统主菜单

1.File-文件管理功能

  • Add Data:添加Slicer数据,可以是一般的Slicer场景;
  • DICOM:添加DCM数据文件;
  • DownSampleData:下载样本数据;
  • Save:保存文件;
  • RecentlyLoaded:最近加载文件;
  • CloseScene:关闭当前场景。

2.Edit-编辑功能
  • Application Setting:应用程序设置,打开应用程序设置面板,该界面允许用户定制已安装的软件:设置各种类型的Slicer模块加载或不加载;Python交互器的显示与否;选择自定义字体,指定一个临时目录,以及一些其他的自定义选项。
  • Cut:剪切。
  • Copy:复制。
  • Paste:粘贴。
  • Record Macro:录制宏。
  • Play Macro:播放宏。默认情况下,菜单项“录制宏”和“播放宏”是不显示的,要启用它必须通过应用程序设置界面的“QTtesting”选项卡中的设置。

3.View-交互器 GUI
  • PythonInteractor:Python交互器,打开Python交互器窗口,在该窗口中进行Python代码的写入和执行。3D Slicer内置Python解析器,可以对Python代码进行解析执行,方便熟悉Python脚本语言的使用者和开发人员进行功能的使用以及开发;
  • ExtensionManager:扩展管理工具,打开扩展管理窗口,下载,安装扩展功能模块;
  • ModulePanel:显示模块控制面板;
  • ToolBar:管理界面上显示的工具;
  • Layout:显示窗口的多样显示;
  • ErrorLog:错误日志,用于显示程序在运行过程中出现的错误;

4.Help-帮助说明
  • KeyboardShortcut:键盘快捷方式;
  • InterfaceDocumentation:通过浏览器访问3DSlicer主页面;
  • Browsetutorials:通过浏览器访问3DSlicer培训页面;
  • SlicerPublications:通过浏览器访问3DSlicer相关论文;
  • VisualBlog:通过浏览器浏览3DSlicer官方图像资料;
  • ReportABug:报告一个Bug;
  • About3DSlicer:关于3DSlicer的资料;

1.2 工具栏


1.3 应用程序设置



  • General:设置程序的字体,提示消息等;
  • Modules:关于模块加载的设置;
  • Extensions:关于扩展功能的设置;
  • Cache:该选项卡提供软件下载数据时的缓存有关的设置和功能;
  • Internationalization:启用/关闭国际化功能设置,如果启用国际化,那么在常规设置面板上会出现语言选择的下拉菜单,由于3D Slicer4.2版本未能支持国际化,该功能仅可用作开发人员测试使用;
  • Slicer宏设置(QTtesting):显示/隐藏Slicer宏功能菜单;
  • Python设置:用于Python交互窗口中的设置,例如文字颜色,字体等;
  • Volume  rendering:用于设置渲染方式,显存等;
1.4 3D视图窗口

1.5 切片视图控制


2.3DSlicer图像控制简述

2.1 窗宽-窗位调节(Window/Level,W/L)


W/L值既可以通过使用左键单击W/L工具条并拖动鼠标进行调整,也可以通过垂直移动鼠标调整Level值,水平移动鼠标调整Window值。此外,Slicer的体数据模块提供了一个接口界面提供更精确的调整。

2.2 不透明度调整

长按Ctrl键并单击鼠标左键进行拖动,可以在一个Slicer视图中拖动调整不透明度。垂直移动鼠标调整前景的不透明度,水平移动鼠标调整标签不透明度。此外,Slicer的体数据模块提供了一个接口界面提供更精确的调整。

2.3 拖动对象

当图像显示的比例较大时,图像窗口不能完全显示整个图像,这时需要通过抓手工具来拖动画面,以显示图像的不同部位,鼠标悬停在任何的“可选取”对象上,Slicer的视图将使得光标从一个“指针”改变成“手”。当光标显示“手”的时候,左键单击并拖动鼠标将选择和操纵的对象。释放鼠标按钮将取消选择的对象。

2.4 操作关联

在任何Slicer视图中按住Shift键的同时移动鼠标,会导致其他Slicer视图交互方式滚动到相同的RAS鼠标的索引位置。当进行多配准的研究时,此功能非常有用。

2.5 视图的缩放、平移与旋转

缩放 :鼠标滚轮操作或长按鼠标右键上下移动
平移:长按Shift + 长按鼠标左键拖拽
旋转:长按鼠标左键并拖拽
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3D Slicer是一个开源的医学图像处理软件,用于分析和可视化医学图像数据。它提供了丰富的特征提取工具,使用户能够从医学图像中提取有用的特征,并进行进一步的分析和解释。 首先,3D Slicer通过提供各种滤波器和增强算法来增强医学图像的质量。这些滤波器可以去除图像中的噪声和伪影,并提高图像的清晰度和对比度。通过使用这些工具,用户可以获得更准确、更可靠的特征提取结果。 其次,3D Slicer还提供了多种特征提取算法,用于从医学图像中提取各种形状、边缘、纹理等特征。例如,用户可以使用SIFT算法提取图像中的关键点和局部特征描述子,用于图像配准和对象识别。此外,用户还可以使用形态学处理工具提取图像中的血管、肿瘤等结构的形状和尺寸信息,为医学诊断和治疗提供参考依据。 最后,3D Slicer还提供了强大的可视化工具,用于解释提取到的特征。用户可以通过3D重建、投影等方法将提取到的特征可视化,从而更直观地理解和解释医学图像中的信息。例如,用户可以将提取到的血管结构可视化为三维模型,帮助医生定位血管狭窄或血栓的位置。 总之,3D Slicer提供了丰富的特征提取工具,用户可以通过这些工具从医学图像中提取各种有用的特征,并利用这些特征进行分析和解释。这使得医学图像处理和分析变得更加方便和高效,为医学研究和临床实践提供了重要的工具和支持。

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