pybel 可以使用的力场

pybel是一种常用的python库,提供化学信息学常用的功能,如转换SMILE编码,生成化学结构式,使用某种力场、算法进行初步结构优化,计算fingerprints等。


1. 安装

a. 首先安装openbabel (http://openbabel.org/docs/2.3.1/Installation/install.html)

如果是windows下,直接下载安装包http://sourceforge.net/projects/openbabel/files/openbabel/2.3.1/OpenBabel2.3.1_Windows_Installer.exe/download

如果是linux下,下载源码编译,见压缩包内介绍。需要使用cmake,如果系统没有,要事先安装。在编译时指明激活python库接口:

configure --prefix=/usr/local

cmake -DPYTHON_BINDINGS=ON -DCMAKE_BUILD_TYPE=DEBUG

make && make install


b. 安装pybel库

  • 1
    点赞
  • 5
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值