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RSS订阅原创 R语言 并行处理
具体的不懂，只记录实现parallel packageR自带的包，可以实现并行处理。library(parallel)detectCores(logical = F) #获得实际核数cl <- makeCluster(getOption("cl.cores", 4)) # 设置并行核数为4clusterExport(cl=cl, varlist=c("text.var", "ntv", "
2015-06-17 18:12:58
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原创 R语言神器
R pacakgedplyr数据处理神器， plyr的升级版，主要用于数据框，可以实现与数据库的快速交互。data.table读取文件，处理数据，速度比python，dplyr还要快。 就是语法上有些凌乱。reshape2， tidyr揉数据的法宝，将数据以不同的形式展现，列数由多变少， tidyr 是 reshape2 的升级版，主要用于数据框。readr2015-04-09 readr 发布，同
2015-06-17 18:10:54
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原创 R语言与统计笔记
正态性检验Shapiro-Wilk Normality Test样本量在3-5000时使用 shapiro.test(x) x a numeric vector of data values. Missing values are allowed, but the number of non-missing values must be between 3 and 5000.## ## shp
2015-06-17 18:09:38
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原创 R语言常用函数集合
meltmelt(data, id.vars, measure.vars, variable.name = "variable", ..., na.rm = FALSE, value.name = "value", factorsAsStrings = TRUE)id.vars 表示固定不变的列 measure.vars 控制变量,需要处理的列，将这些列名作为某一列的数值 variabl
2015-06-17 18:08:05
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原创 XML包使用
最近更新请参照 http://cangfengzhe.github.comhtmlParse(url)解析网页，或XMLxml 转换成data.frame“`r library(XML) library(plyr) url_path_pre <- ‘http://www.rcsb.org/pdb/rest/describePDB?structureId=4hhb,1hhb’ query
2015-06-17 18:05:57
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原创 ggplot2 学习
theme(axis.text.x=element_text(angle=90, size=8, vjust=0.8)) 旋转x轴标题theme(plot.margin = unit(c(0.1, 0, 0, 0),"cm")) 为图片设置margin， 顺序遵循 上右下左library(gridExtra)grid.arrange(g1, g2, g3, g4, main, sub, lef
2015-06-17 18:01:20
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原创 mysql 学习总结
mysql 查询结果建立新表create table table_name select * from tab1;txt导入mysqlload data infile ‘D:\DeskTop\abc.txt’ into table tab2 fields terminated by ‘;’
2015-06-17 17:56:09
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原创 利用R语言对RNA-Seq进行探索分析与差异表达分析
介绍本文参考 bioconductor 中RNA-Seq workflow: gene-level exploratory analysis and differential expression并对其根据需要进行了增减。 更多细节还请参考 http://www.bioconductor.org/help/workflows/rnaseqGene/试验数据数据来源 Himes BE, Ji
2015-06-17 17:51:48
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linux非root安装软件设置
2016-04-13
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