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RSS订阅原创 Algorithms for Detecting Significantly Mutated Pathways in Cancer
本文是对《Algorithms for Detecting Significantly Mutated Pathways in Cancer》（2011年）的学习笔记摘要：近期基因组测序的研究表明导致癌症发展的体细胞突变分布在大量的基因中。这种变异的异质性使得努力从分散的乘客突变区分功能性突变变得复杂。假如癌症变异目标在细胞信号相对少且正常的路径上，则常规做法是估计是否已知路径涵盖了突变基因。我们介绍一种可供选择的方法在全基因组范围的基因相互作用网络中去检测突变基因。我们介绍一种计算高效的策略，该策略重
2016-07-24 18:52:49
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原创 similarity network fusion for aggregating data types on a genomic scale
基因组规模上的聚合数据类型的相似性网络融合摘要： 近期的技术已经使收集不同类型的全基因组数据十分划算，结合这些数据去创建一个给定的疾病或生物过程的一个全面视图的计算方法是有必要的。相似网络融合（SNF:similarity network fusion）通过创建每一个可利用的数据类型的样本（如，患者）的网络可以解决这个问题。例如，创建一个给定一群患者疾病的全面视图，SNF计算
2016-07-22 20:07:59
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原创 the procedure of construction of LFR benchmark graphs
this is my study note of some literature about LFR benchmark.LFR benchmark is a artificial network in order to imitate real network,but LFR benchmark,actually in my opinion,is not only a network,al
2016-03-05 10:26:10
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原创 基于快速搜索与寻找密度峰值的聚类方法
该文章是我对于《Clustering by fast search and find of density peaks》的学习笔记，原论文链接我将在文后发出。一、模型对象：需要分类的点集(node set)二、模型目的：以每一个节点(node)的密度(density)为模型基础，将待分类的点集进行聚类(cluster)三、模型方法与注释：step1.计算所有节点(n
2016-03-03 20:43:23
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空空如也
空空如也
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