UVA - 1368 DNA Consensus String

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题目大意:输入 m 个长度均为 n 的 DNA 序列,求一个 Hamming 距离最小的序列,即最相似的序列,多解要求字典序最小。并输出距离。Hamming 距离等于字符不同的位置个数。

解题思路:统计所有 DNA 序列中每个位置出现各个字符的次数,记录出现最多的字符与次数,将这些字符连接起来就是所求序列,每个位置的 Hamming 距离为 DNA 序列个数减去最大次数,各位置相加即可。
卡了比较久,因为把样例复制到文件的时候忘记删除每行末尾的空格,导致多了一个 getchar(); 但提交后并不需要所以一直WA,坑,下次注意。

#include<iostream>
#include<cstdio>
#include<string.h>
using namespace std;
char DNA[55][1005]; 
int num[5][1005];
int max_[1005];
int str[1005];
int main() {
    int T;
    scanf("%d", &T);
    while (T--) {
        memset (DNA, '0', sizeof(DNA));
        memset (num, 0, sizeof(num));
        memset (max_, 0, sizeof(max_));
        memset (str, 0, sizeof(str));       
        int m, n;
        scanf("%d%d", &m, &n);
        getchar();
        for (int i = 0; i < m; i++)
            gets(DNA[i]);
        for (int i = 0; i < m; i++)
            for (int j = 0; j < n; j++) {
                if (DNA[i][j] == 'A') num[0][j]++;
                if (DNA[i][j] == 'C') num[1][j]++;
                if (DNA[i][j] == 'G') num[2][j]++;
                if (DNA[i][j] == 'T') num[3][j]++;
            }           
        for (int i = 0; i < n; i++)
            for (int j = 0; j < 4; j++)
                if (num[j][i] > max_[i]) {
                    max_[i] = num[j][i];
                    str[i] = j;
                }
        int sum = 0;
        for (int i = 0; i < n; i++){
            sum += m - max_[i];
            if (str[i] == 0) printf("A");
            if (str[i] == 1) printf("C");
            if (str[i] == 2) printf("G");
            if (str[i] == 3) printf("T");
        }
        printf("\n%d\n", sum); 
    } 
return 0;
}
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