FSL安装

原创 2015年11月18日 12:14:56

windows安装FSL,
首先到http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FslInstallation选择Download FSL,然后选择下载windows 7下的FLSVm6_64.zip,大小约为1.5G,是centos6.5虚拟机


这里写图片描述

解压后用VMware打开fslvm6_64.vmx,运行虚拟机,密码fsluser。
桌面有fslinstaller.py,输入 python fslinstaller.py 即可自动安装FSL,下载大小为2G,速度很慢。
python fslinstaller.py运行时可能会报错,可以在网站单独下载fslinstaller.py再运行,推荐windows中下载fsl软件fsl-5.0.9-centos6_64.tar.gz,http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsldownloads/fsl-5.0.9-centos6_64.tar.gz,将它拷到虚拟机中,解压到/usr/local/。

修改~/.bashrc文件,添加以下内容并保存:

FSLDIR=/usr/local/fsl
. ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh
PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH}
export FSLDIR PATH

运行程序在/usr/local/fsl/bin fsl
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