2011年06月_zhuliting

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原创深腾7000上用bsub命令提交MPI作业

小规模作业运行在厚节点队列上，配置：这三个队列节点都一样，16路4核共64核 Xeon X7350 2.93GHz, 512G内存x64_small 共2个节点 1－8核 6小时x64_3950 共5个节点 1－64核 6小时x64_3950_long 共11个节点 1－64核 144小时 x64_small就是用来给小作业运行的。如果需要运行稍大作业的话，不妨用x64_3950或x64_395

2011-06-27 17:35:00 8114 4

原创 MPI程序调试--笔记

有一个不优美但实用的方法，就是在程序中添加如下一段代码： tmp = 0do while(tmp.eq.0)call sleep(2)enddo 其功能就相当于插入一个断点，在MPI程序调试中，还可以用来判断该断点之前的程序是否出现导致程序崩溃退出的错误，个人觉得很好用。[root@c0109 zlt]# cat hello.F program hello implic

2011-06-19 09:03:00 4786

原创 MPI调试--出错信息整理

如果是用FORTRAN写程序，建议加上implicit none，特别是代码比较多时，可以检查出编译过程中的很多问题。1、[root@c0108 parallel]# mpiexec -n 5 ./simpleaborting job:Fatal error in MPI_Irecv: Invalid rank, error stack:MPI_Irecv(

2011-06-18 18:29:00 26627 1

原创 FORTRAN “ multiple definition of `MAIN__'”

编译FORTRAN程序时，出现错误信息：“ multiple definition of `MAIN__” [root@c0108 parallel]# mpif90 -o simple stagsimple.F solveuss.F solvevss.F solvewss.F ppoisson.F tdma.F/tmp/ccMt8rzo.o: In function `M

2011-06-18 14:57:00 4435

原创编译FORTRAN程序提示：“编译器内部错误：段错误请提交一份完整的错误报告”

[root@c0108 parallel]# mpif90 -o simple stagsimple.F solveuss.F solvevss.F solvewss.F ppoisson.F tdma.F 在文件 tdma.F:43 call CarculateBlock(i,MIN(i+tx,ie),j,MIN(j+ty,je),k,

2011-06-18 09:12:00 3665

原创 MPI + FORTRAN 的子例行子程序测试

用MPI实现一个简单的标准发送接收操作，如下，0进程将一个数据发送给1号进程，1号进程接收从0进程发送的数据。 program main implicit none include mpif.h integer myid, ierr,status(MPI_STATUS_SIZE) real(kind=8) i, j i = 3.14159 j = 4.22222

2011-06-17 22:05:00 12671

原创 MPI_Bcast广播操作的通信开销测试

#include "mpi.h"#include #include #include #include int main(int argc, char **argv){ int i, myid, other, numprocs; double start, end; MPI_Status status; MPI_Init(&argc, &argv); MPI_Comm_

2011-06-10 22:18:00 3152

原创 MATLAB用regress作多元非线性回归

在回归分析中，如果有两个或两个以上的自变量，就称为多元回归。事实上，一种现象常常是与多个因素相联系的，由多个自变量的最优组合共同来预测或估计因变量，比只用一个自变量进行预测或估计更有效，更符合实际。因此多元线性回归比一元线性回归的实用意义更大。很久没有用MATLAB了，今天在http://www.mathworks.com/help/toolbox/stats/regress.html

2011-06-09 09:53:00 70047 8

原创 OpenMP程序 for 循环并行的效率

#pragma omp parallel for 这条语句是用来指定后面的for循环语句变成并行执行的,将for循环里的语句变成并行执行后效率会不会提高呢?还是测试一下吧，测试的时候，循环最好大一些，增加计算量，不然程序耗时太短，很难区分。#include #include #include void test() { int a = 0; for(int i = 0;

2011-06-05 12:54:00 5007

原创 nohup命令后台运行程序

如果你正在运行一个进程，而且你觉得在退出帐户时该进程还不会结束，那么可以使用nohup命令。该命令可以在你退出帐户/关闭终端之后继续运行相应的进程。nohup就是不挂起的意思(no hang up)。该命令的一般形式为：nohup command &使用nohup命令提交作业，在缺省情况下该作业的输出被重定向到一个名为nohup.out的文件中。nohup command >

2011-06-03 16:11:00 1056

绘制一幅正弦曲线：%adjust default figure properties to improve qualityfigure;set(gcf,... 'DefaultLineLineWidth',1,'DefaultAxesLineWidth',.5,... 'DefaultAxesFontName','Helvetica',... 'DefaultAxesFontSize',20,... 'DefaultAxesTickLength',[0.02,

2011-06-02 09:29:00 935