R语言篇
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星 辉 浸 染 的 石 岩
星石传说
星 辉 浸 染 的 石 岩,镌 刻 那 古 老 的 传 说:
万 千 生 灵 信 仰 的 所 在
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百日筑基篇—— 方差分析(R语言初识十一)
当要比较不同组之间的差异性时,一般会考虑使用方差分析,它是一种实用的方法,它可以帮助比较不同组别之间的差异性,从而给实验提供可靠的统计依据,本章将会详细介绍方差分析。舞幽壑之潜蛟,泣孤舟之嫠妇--2023 -7-29 筑基篇原创 2023-08-03 11:04:14 · 477 阅读 · 0 评论 -
百日筑基篇——回归分析(R语言初识十)
本章着重介绍如何进行线性回归以及多元线性回归,并根据回归结果判断线性模型的可行性,经过调换,取得最佳线性模型。回归模型的得到要经过多次的回归诊断,根据回归结果以及图表可判断回归模型的可行性,再经过调整,以便取得最佳回归模型。耳得之而为声,目遇之而成色。–2023-7-29 筑基篇。原创 2023-08-02 10:21:59 · 171 阅读 · 0 评论 -
百日筑基篇—— 统计函数简介二(R语言初识别九)
在上一章中,我简单介绍了一下有关统计的一些函数。而本章则紧跟上章,继续介绍统计函数。一个完整的R函数需要包括函数名称、函数声明、函数参数、函数体。今天,简单介绍了一些统计函数:独立性检验函数、相关分析函数、绘图函数、自定义函数。随着不断的使用R语言,自定义函数是十分必要的,能帮助我们省去许多重复性的代码编写。好了,今天的总结就到这里了。落霞与孤鹜齐飞,秋水共长天一色。–2023-7-26 筑基篇。原创 2023-07-28 08:39:39 · 290 阅读 · 0 评论 -
百日筑基篇—— 统计函数简介一(R语言初识八)
在R语言中,各种各样的统计函数在帮助我们在数据分析中起到了十分重要的作用。下面我就简单介绍一下统计函数。今天,简单介绍了一下在R语言函数中的统计函数的一部分,有数学统计函数、概率密度函数、描述性统计函数以及频数统计函数。认识并合理运用这些函数有助于我们对数据进行分析,好了,就总结到这里了。秦时明月汉时关,万里长征人未还。–2023-7-25 筑基篇。原创 2023-07-27 09:26:47 · 607 阅读 · 0 评论 -
百日筑基篇——差异基因分析Limma包(R语言初识七)
Limma包是针对微阵列数据和RNA-seq数据开发的一个强大的R软件包,其提供了一套统计模型和工具来鉴定差异表达基因,是进行差异基因分析的常用方法之一。世上无难事,只要肯攀登-2023-7-9 筑基篇原创 2023-07-15 10:51:58 · 7918 阅读 · 6 评论 -
百日筑基篇——差异基因分析DESeq2包(R语言初识六)
今天,整理一下如何使用R语言进行基因差异分析。主要会讲述有关的几个扩展包以及可视化,希望以这种方式巩固所学。基因差异分析的学习,今天就到这里,理解这背后的统计学原理是十分必要的,同时要一开始就确定想要通过基因差异分析,分析出什么,目标明确。醉里挑灯看剑,梦回吹角连营。-2023-7-8 筑基篇。原创 2023-07-14 11:48:40 · 2165 阅读 · 4 评论 -
百日筑基篇—— ggplot2包介绍(R语言初识五)
推荐 https://blog.csdn.net/qazplm12_3/article/details/110252322 (生信宝典) 今天,主要简单的介绍了ggplot2 R包,在数据分析中,数据的可视化是必不可少的,故掌握一定的画图方法很有必要,使用该包可以很快上手。其图层叠加的思想是关键。天行健,君子以自强不息-2023-7-7 筑基篇。原创 2023-07-12 17:21:59 · 2321 阅读 · 1 评论 -
百日筑基篇——future.apply包介绍(R语言初识四)
future.apply包提供了一系列的函数,与R的apply家族函数类似,包括future_map()、future_apply()、future_lapply()、future_sapply()等。这些函数允许用户在数据集的每个元素上应用自定义的函数,并通过将计算任务分发到多个处理器来实现并行计算。如果您对apply系列函数有一定了解,那对于future.apply包的掌握就很容易;只要理解并行计算与串行计算的区别就行。能阻止你的追梦,只有你自己能放弃你的梦想。--2023-7-6 筑基篇原创 2023-07-12 17:17:06 · 690 阅读 · 1 评论 -
百日筑基篇——数据处理工具包dplyr(R语言初识三)
好了,今天的分享就到这里了,对dplyr包的掌握,有利于对数据进行处理,方便后续的操作。当然不仅仅只有使用dplyr包这一种方法。还有许多种实现方法,熟练多种方法,有利于更游刃有余的处理数据。大丈夫生于天地之间,当提三尺剑立不世之功– 2023-7-5 筑基篇。原创 2023-07-12 17:14:27 · 790 阅读 · 1 评论 -
百日筑基篇——R的数据结构与数据类型(R语言初识一)
作为一个生物专业的学生,对计算机编程语言有较多兴趣,在生信分析中,R语言的学习是必不可少的,作为一个萌新,希望以这种方式,对自己的学习不断进行复盘,同时希望多多指教!!今天,整理了R语言中的数据结构和数据类型,理清了其中的关联与区别。大体来说,数据结构提供了一种方式来在程序中组织和操纵数据,而数据类型则定义了数据在内存中的存储和表示方式。即后者为基础元素,前者为存储框架。昔我往矣,杨柳依依;今我来思,雨雪霏霏–2023-7-2 筑基篇。原创 2023-07-12 07:19:43 · 704 阅读 · 1 评论 -
百日筑基篇——数据的读取与处理(R语言初识二)
作为一个生物专业的学生,对计算机编程语言有较多兴趣,在生信分析中,R语言的学习是必不可少的,作为一个萌新,希望以这种方式,对自己的学习不断进行复盘,同时希望多多指教!!今天,整理了数据的读取与处理,引入数据进行处理,在对数据进行分析得到数据模型前,数据的预处理是十分重要的,保证了模型的正确性与精确度。对数据的处理并不是一成不变的,这要求对特定数据进行特定分析。OK,今天的总结到此为止。鱼在水中游,是尾也是头-2023-7-3 筑基篇。原创 2023-07-12 16:51:25 · 473 阅读 · 1 评论