2301_78630677的博客

这篇博客是对重测序数据处理得到vcf文件的补充，记录了重测序数据处理的理论以及其它相关了解内容重测序专题（一）| 一文了解测序技术的发展百度百科全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序，并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。全基因组重测序的个体，通过序列比对，可以找到大量的单核苷酸多态性位点（SNP），插入缺失位点（InDel）和结构变异位点（SV）等信息.本文主要记录了重测序数据中的一些数据文件以及使用分析软件。

2024/1/21主要做了对vcf原文件进行处理，然后筛选出位点2024/7/22 更新：重测序数据处理得到vcf文件。

第二天2024/7/9所属目录：科研训练课程创建时间：2024/7/9作者：星云更新时间：xxx今天主要学习了如何修改论文格式，并且也对自己之前的综述进行了格式的修改；同时也补充了endnote的安装与使用。又是收获满满的一天还剩6天课程2024/7/9。

本系列笔记为记录大二暑期学校课程—— 科研训练与写作，记录一下每天了解了什么吧（苦逼又无聊的学习生涯又开始了。才刚结束啊）在’亲爱‘的大学想念我那远方的家的第一天（成功度过 (￣ω￣) ）所属目录：科研训练课程创建时间：2024/7/8作者：星云更新时间：xxx本文主要了解了用LetPub去查询论文所属期刊的影响因子等信息；以及用web of science 来对论文进行查询。哎，又是收获满满的一天这是第一天上课，还有整整七天，距离回家还有…2024/7/8。

群体遗传学利用数学统计的方法研究群体中基因频率和基因型频率以及影响这些频率的因素，了解物种群体内(间) 的遗传交流情况，进而探索物种形成和物种进化的动态机制究其本质 群体遗传学研究的中心就是基 , ,因频率变化的动力学[1]。尽管群体的遗传差异和多形态特征显而易见，但定量估计遗传变异则在 世纪 年代 20 60当蛋白电泳被引入群体遗传学研究后才成为可能[4, 5]。这项技术能够检测到蛋白质的电荷变化，其应用揭示了自然界大多数群体中存在着大量遗传差异，从而促进了群体遗传学研究的发展[6]

学习文献里的方法，初步了解一下什么是ENM模拟文献名称：《基于MaxEnt模型和ArcGIS预测多肋藻在中国海域的适生分布特征》

软件、代码、地图：链接：https://pan.baidu.com/s/1eqT7axtpTVc2I4wAwOjYvA?pwd=1wht提取码：1wht–来自百度网盘超级会员V4的分享。

细胞膜的渗透性、细胞活性检测人生天地间,忽如远行客。–2023-10-10 生物技术篇。

细胞骨架的观察、细胞内DNA及RNA的显示上德不德，是以有德；下德不失德，是以无德。–2023-10-10 生物技术篇。

在学习生物的过程中，熟练掌握各种生物实验方法是必须的，本系列文章，将主要记录做微生物学实验的笔记，便于以后的再度查看。显微镜油镜的使用以及细菌的简单染色法细菌的革兰氏染色以及芽孢染色法主要学习了细菌的集中染色方法，通过显微油镜观察等。。。。林花谢了春红，太匆匆，无奈朝来寒雨晚来风。胭脂泪…–2023-10-6 生物技术篇。

在学习生物的过程中，熟练掌握各种生物实验方法是必须的，本系列文章，将主要记录做细胞生物学实验的笔记，便于以后的再度查看。本章主要讲述两个实验：1. 细胞的基本形态结构和显微测量2. 叶绿体的提取与观察本次的实验基本了解了一下如何观察细胞大小，并且如何对叶绿体进行提取并用荧光显微镜观察。朝辞白帝彩云间，千里江陵一日还。--2023-9-27 生物技术篇

这个作业就这样应付完成了，了解了一下”分子机器“这个事物，科学家们通过对生物的分子层面的研究，发现了”分子芯片“相对于硅基芯片的优秀，这为通过分子机器来构建”分子计算机“的实现开了一个重要的研究方向。最后期待**分子计算机的早日实现，为人类带来更强大的计算能力和创新的可能性**，同时助力生物学的新发现。南风知我意，吹梦到西州。--2023-9-18 生物技术篇

这一系列文章主要是对于在暑期，老师每周教导的生信方面的课程的课后学习笔记的总结，希望用此方法来巩固我的所学。本文的R篇主要讲述了使用which()返回索引来进行数据筛选，以及一些字符串处理函数： paste() 、nchar() 、gsub() 、chartr() 等。而生信篇则主要讲述了在基因家族分析中的一些分析。山一程，水一程，身向榆关那畔行，夜深千帐灯。–2023-8-28 笔记篇。

这一系列文章主要是对于在暑期，老师每周教导的生信方面的课程的课后学习笔记的总结，希望用此方法来巩固我的所学。本文的R篇主要讲了unname（）、duplicated（）、因子分组等。生信篇则介绍了一些在Linux中的简单操作命令。同时也学会了根据mamba管理器来下载所需软件，如用于hmm鉴定的hmmer软件等。两情若是久长时，又岂在朝朝暮暮。–2023-8-15

这一系列文章主要是对于在暑期，老师每周教导的生信方面的课程的课后学习笔记的总结，希望用此方法来巩固我的所学。本次主要介绍了有关基因以及基因家族的一些概念，还有基因组注释文件gff3的详细介绍，以及HMM搜索和hmm模型的下载。受益良多。锦瑟无端五十弦，一弦一柱思华年。–2023-7-30 筑基篇。

这一系列文章主要是对于在暑期，老师每周教导的生信方面的课程的课后学习笔记的总结，希望用此方法来巩固我的所学。R语言篇主要介绍了R语言的历史、R以及其集成开发环境Rstudio的安装和界面介绍、R包的管理。生信篇主要介绍了生信分析是什么，各种数据库，以及Geneious软件。差不多就这些了，期待下一次的讲课。中通外直，不蔓不枝--2023-7-22 笔记篇

在这一系列文章中，主要是对相对应的生信分析篇的博文中的生物知识进行注解。以巩固生物知识。(故主要是以笔记为主，排版会较粗糙)，本章为 实验篇——基因家族成员鉴定（一) 的注解在生物这条道路上，我也只是一个学徒，有许多知识等着我去学习，而我也希望一这种方式促进我的学习。ok,笔记总结完毕。不以物喜，不以己悲–时23年7月15日 笔记篇。