下面内容摘录自《用R探索医药数据科学》专栏文章的部分内容。栏目后续章节的文章将深入概括R语言在临床研究和新药创新领域的应用,填补了国内R教材中尚未广泛覆盖的部分内容。
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二、R语言的发展壮大
1. R语言的早期发展
R语言的开发工作始于1992年,最初的目标是为统计计算和数据分析提供一个灵活且功能强大的编程环境。Ihaka和Gentleman在设计R语言时,参考了S语言的许多设计理念,特别是在处理数据框(data frames)、向量化运算(vectorized operations)和函数式编程(functional programming)等方面。
1993年,Ihaka和Gentleman发布了R语言的早期版本。这个版本的R语言还非常简陋,只包括了一些基础的统计功能和简单的图形能力。然而,即便如此,R语言很快吸引了统计学界和数据科学家的注意。其免费开源的特性以及S语言的兼容性,使得R语言在学术界尤其是统计学和生物统计学领域迅速流行开来。
1995年,R语言正式以GNU通用公共许可证(GNU General Public License, GPL)发布,这意味着任何人都可以自由使用、修改和分发R语言的源代码。这一决定极大地促进了R语言的传播和发展,R语言社区也逐渐壮大起来。
例如,学术研究人员可以根据自己的特定需求修改 R 语言的源代码来实现独特的数据分析方法。企业中的数据科学家也能够对其进行定制,以适应特定的业务逻辑和数据处理要求。
GNU通用公共许可证(GPL)是一种广泛使用的自由软件许可证,它保障了终端用户运行、研究、共享和修改软件的自由。作为一种“copyleft”许可证,GPL要求任何衍生作品都必须以相同或等同的许可证条款分发,确保软件对所有用户保持自由。GPL允许用户为任何目的运行软件,修改软件,并分享原始或修改后的版本,而分发者不能施加超出GPL条款的额外限制。GPL被用于许多著名的自由和开源软件中,如Linux内核和GNU编译器集合,并且在Linux系统的成功中起到了关键作用。
R语言采用GNU通用公共许可证(GPL)进行授权,具体为GPL版本2(GPL-2)或GPL版本3(GPL-3)。这种授权框架是R语言分发和使用的重要方面,影响着用户与该软件的交互方式。
2. R语言社区的形成与发展
R语言的快速发展离不开其强大的开源社区。R语言的早期用户大多是学术界的统计学家和研究人员,他们不仅使用R语言进行数据分析,还积极参与到R语言的开发和扩展中来。随着R语言的普及,越来越多的贡献者开始为R语言开发新的功能、编写文档和提供技术支持。
1997年,R语言的开发团队成立了R核心团队(R Core Team),这个团队由最早的一批R语言开发者组成,包括Ross Ihaka、Robert Gentleman以及其他一些为R语言做出重大贡献的学者。R核心团队的职责包括修改R源代码、管理社区贡献、整合新功能、修复错误,并确保软件的整体质量和稳定性。该团队的成立对R语言的有序发展至关重要,使其在统计计算和数据分析领域得到广泛应用。
R语言社区的另一大贡献是综合R档案网络(Comprehensive R Archive Network,CRAN)的建立。CRAN由全球多个服务器组成,存储着相同的、最新版本的R代码和文档。CRAN的主要特点包括:作为中央存储库,CRAN托管了全球用户和贡献者开发的数万个R软件包(下图),便于用户下载和安装,增强R在统计计算和数据分析方面的功能;CRAN对软件包提交有严格的质量保证,每个软件包都经过严格审查,确保符合文档和功能标准,用户可以信赖CRAN上的软件包;CRAN还提供版本管理功能,使用户可以安装特定版本的软件包,确保数据分析的可重复性;此外,CRAN支持涵盖各种领域的广泛软件包,从统计建模、机器学习到数据可视化,满足不同用户的需求;开发者可以通过提交新软件包或更新来贡献于CRAN,遵守严格的质量和功能标准。
The Comprehensive R Archive Network
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