下面内容摘录自《用R探索医药数据科学》专栏文章的部分内容。栏目后续章节的文章将深入概括R语言在临床研究和新药创新领域的应用,填补了国内R教材中尚未广泛覆盖的部分内容。
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一、Source区(左上角1区,文本编辑框)
二、Console, Terminal, Jobs区(右上角2区,控制台)
三、Environment, History, Connections,Tutorial区(左下角3区,环境变量框)
四、Files, Plots, Packages, Help, Viewer和Presentation区(左下角4区,应用框)
上图,Files 面板用于文件管理,Plots 面板显示和导出图形,Packages 面板管理 R 包,Help 面板提供帮助文档,Viewer 面板展示网页内容和 R Markdown 输出,Presentation 面板创建和展示演示文稿。这些面板使得 R 编程、数据分析和结果展示更加高效便捷。
4.1 Files 区
Files 区提供了一个文件浏览器,用户可以在其中管理 RStudio 项目目录及其文件。它的主要功能包括:1)浏览文件:可以查看当前工作目录中的文件和文件夹。2)文件操作:支持创建新文件或文件夹、重命名、删除、移动以及上传和下载文件。3)设置工作目录:用户可以通过点击“More”按钮来设置新的工作目录。
如上图,Files 区使得文件管理变得简单直观,用户无需离开 RStudio 即可完成大部分文件操作。通过这个区域,用户可以方便地浏览当前工作目录中的所有文件和文件夹,进行诸如创建新文件或文件夹、重命名、删除和移动文件等基本操作。此外,Files 区还支持文件的上传和下载功能,使得在不同设备之间同步文件变得更加便捷。用户还可以通过该区域轻松设置新的工作目录,只需点击“More”按钮并选择“Set As Working Directory”即可。工作目录是 R 会话默认读取和保存文件的地方。设置工作目录后,R 会将该目录作为所有文件操作(如读取数据文件或保存输出文件)的默认路径。这样,用户可以避免在代码中频繁指定文件的完整路径,只需使用相对路径即可。
4.2 Plots 区
Plots 区用于显示 R 生成的图形。它的主要功能包括:1)显示图形:所有通过 R 代码生成的图形都会显示在 Plots 区中。2)导航图形历史:用户可以通过箭头按钮浏览之前生成的图形。3)导出图形:可以将图形保存为多种格式(如 PNG、PDF 等)或者复制到剪贴板。4)缩放图形:可以放大或缩小图形,以便更好地查看细节。
上图,Plots 区支持将图形导出为多种格式,如 PNG 和 PDF,也可以将图形复制到剪贴板以便在其他文档中使用。通过左边Zoom的缩放功能,用户可以放大或缩小图形,详细查看数据的各个细节。Plots 区不仅是数据可视化的展示窗口,也是用户管理和导出图形结果的重要工具。
4.3 Packages 区
Packages 区显示了当前 R 环境中安装的所有 R 包,并提供包管理功能。主要功能包括:
- 查看已安装的包:列出所有已安装的 R 包,并显示其版本信息。
- 安装新包:可以搜索和安装 CRAN、Bioconductor 或其他来源的 R 包。
- 加载和卸载包:可以通过复选框来加载或卸载特定的 R 包。
- 更新包:可以检查并更新已安装的 R 包到最新版本。
Packages 区使得包管理变得方便快捷,用户可以轻松安装、加载和更新 R 包。
Packages 区是 RStudio 中专门用于管理 R 包的区域。它列出了当前 R 环境中安装的所有 R 包,并显示每个包的详细信息,包括版本号。用户可以通过这个区域轻松安装新包,搜索和安装来自 CRAN、Bioconductor 或其他来源的 R 包,只需输入包名并点击“Install”按钮即可。此外,Packages 区还提供加载和卸载包的功能,用户可以通过勾选复选框来加载需要的包,或者取消勾选来卸载不需要的包。为了保持包的最新状态,用户还可以使用更新功能,检查并更新已安装的 R 包到最新版本。Packages 区使得 R 包的管理变得更加直观和便捷,是 RStudio 用户不可或缺的工具之一。
4.4 Help 区
Help 区提供了对 R 帮助文档的访问,用户可以查找和阅读 R 及其包的文档。主要功能包括:1)搜索帮助文档:用户可以输入关键字搜索函数、包或主题的帮助文档。2)查看函数文档:显示函数的用法、参数说明、示例代码等详细信息。3)浏览帮助目录:可以按照主题浏览 R 文档,查看特定包的帮助信息。
上图,用来Help 区来学习和参考 ggplot2包。
4.5 Viewer 区
Viewer 区用于显示 HTML 报告、Shiny 应用、R Markdown 文档以及其他网页内容。主要功能包括:1)展示网页内容:可以直接在 RStudio 中查看生成的 HTML 文件和网页。2)与 Shiny 集成:运行 Shiny 应用并在 Viewer 区中展示结果。3)显示 R Markdown 输出:在 R Markdown 中生成的 HTML 报告可以在此查看。
4.6 Presentation 区
Presentation 区是 RStudio 中一个用于制作和展示演示文稿的工具。主要功能包括:1)创建演示文稿:用户可以使用 R Markdown 创建包含 R 代码和输出的演示文稿。2)实时预览:可以实时预览演示文稿的效果,并进行编辑和调整。3)演示模式:提供全屏演示模式,便于在会议或讲座中展示演示文稿。
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第一章:认识数据科学和R
1章1节:数据科学的发展历程,何 R 备受青睐及我们专栏的独特之处(更新20240822)-CSDN博客
1章2节:关于人工智能、机器学习、统计学连和机器学习、R 与 ChatGPT 的探究 (更新20240814)-CSDN博客
1章3节:R 语言的产生与发展轨迹(更新2024/08/14)-CSDN博客
1章4节:数据可视化, R 语言的静态绘图和 Shiny 的交互可视化演示(更新20240814)-CSDN博客
第二章:R的安装和数据读取
2章1节:R和RStudio的下载和安装(Windows 和 Mac)_rst语言选择哪个镜像-CSDN博客
2章2节:RStudio 四大区应用全解,兼谈 R 的代码规范与相关文件展示_rstudio的console和terminal-CSDN博客
2章3节:RStudio的高效使用技巧,自定义RStudio环境(更新20240823)_rstudio如何使用-CSDN博客
2章4节:用RStudio做项目管理,静态图和动态图的演示,感受ggplot2的魅力-CSDN博客
2章5节:认识和安装R的扩展包,什么是模糊搜索安装,工作目录和空间的区别与设置(更新20240807 )-CSDN博客
2章6节:R的数据集读取和利用,如何高效地直接复制黏贴数据到R(更新20240807 )_r语言 复制数据集-CSDN博客
2章7节:读写RDS,CSV,TXT,Excel,SPSS、SAS、Stata、Minitab等的数据文件(更新20240807)_r语言读取rds文件-CSDN博客
2章8节:一文学会 R Markdown 的文档核心操作,切记文末有R资源的分享_r markdown文件(.rmd)-CSDN博客
2章9节:认识R与数据库连接和网络爬虫,学会在R中使用SQL语言_sql和r语言-CSDN博客
2章10节:用 R 直接下载并分析 NHANES 数据库的数据,文末示例自创便捷下载函数(更新20240807)_nhanes数据分析-CSDN博客
第三章:认识数据
3章1节:数据的基本概念以及 R 中的数据结构、向量与矩阵的创建及运算-CSDN博客
3章2节:继续讲R的数据结构,数组、数据框和列表-CSDN博客
3章3节:R的赋值操作与算术运算_r里面的赋值-CSDN博客
第四章:数据的预处理
4章1节:全面了解 R 中的数据预处理,通过 R 基本函数实施数据查阅_r数据预处理-CSDN博客
4章2节:从排序到分组和筛选,通过 R 的 dplyr 扩展包来操作-CSDN博客
4章3节:处理医学类原始数据的重要技巧,R语言中的宽长数据转换,tidyr包的使用指南-CSDN博客
4章4节:临床数据科学中如何用R来进行缺失值的处理_临床生存分析缺失值r语言-CSDN博客
4章5节:数据科学中的缺失值的处理,删除和填补的选择,K最近邻填补法-CSDN博客
4章6节:R的多重填补法中随机回归填补法的应用,MICE包的实际应用和统计与可视化评估-CSDN博客
4章7节:用R做数据重塑,数据去重和数据的匹配-CSDN博客
4章8节:用R做数据重塑,行列命名和数据类型转换-CSDN博客
4章9节:用R做数据重塑,增加变量和赋值修改,和mutate()函数的复杂用法_r语言如何在数据集中添加变量-CSDN博客
4章10节:用R做数据重塑,变体函数应用详解和可视化的数据预处理介绍-CSDN博客
4章11节:用R做数据重塑,数据的特征缩放和特征可视化-CSDN博客
4章12节:R语言中字符串的处理,正则表达式的基础要点和特殊字符-CSDN博客
4章13节:R语言中Stringr扩展包进行字符串的查阅、大小转换和排序-CSDN博客
4章14节:R语言中字符串的处理,提取替换,分割连接和填充插值_r语言替换字符串-CSDN博客
4章15节:字符串处理,提取匹配的相关操作扩展,和Stringr包不同函数的重点介绍和举例-CSDN博客
4章16节:R 语言中日期时间数据的关键处理要点_r语言 时刻数据-CSDN博客
第五章:定量数据的统计描述
5章1节:用R语言进行定量数据的统计描述,文末有众数的自定义函数-CSDN博客
5章2节:离散趋势的描述,文末1个简单函数同时搞定20个结果-CSDN博客
5章3节:在R语言中,从实际应用的角度认识假设检验-CSDN博客
5章4节:从R语言的角度认识正态分布与正态性检验-CSDN博客
5章5节:认识方差和方差齐性检验(三种方法全覆盖)-CSDN博客
5章9节:组间差异的非参数检验,Wilcoxon秩和检验和Kruskal-Wallis检验-CSDN博客
第六章:定性数据的统计描述
6章1节:定性数据的统计描述之列联表,文末有优势比计算介绍-CSDN博客
6章2节:认识birthwt数据集,EpiDisplay和Gmodels扩展包的应用-CSDN博客
6章3节:独立性检验,卡方检验,费希尔精确概率检验和Cochran-Mantel-Haenszel检验-CSDN博客
6章4节:相关关系和连续型变量的Pearson相关分析-CSDN博客
6章5节:分类型变量的Spearman相关分析,偏相关分析和相关图分析-CSDN博客
6章6节:相关图的GGally扩展包,和制表的Tableone扩展包-CSDN博客