Circular RNA的产生机制、功能及RNA-seq数据鉴定方法

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【Circular RNA的产生机制】

Circular RNA，缩写为circRNA，中文名为环状RNA，属于非编码RNA，是近年的一个重要研究热点。

CircRNA主要是通过backsplicing的方式产生，明显不同于线性RNA（linear RNA）经典的5′–3′的模式。因此，circRNA不含有线性RNA的经典结构，如5′端加帽，3′端有poly A尾巴等，而是形成了一个环状。

CircRNA按照含有的外显子和内含子模式，主要可以分为以下四类：

1）单外显子circRNA，single exon circRNA；

2）多外显子circRNA，multi-exon circRNA；

3）外显子和内含子共存的circRNA，exon-intron circRNA；

4）内含子circRNA，intronic circRNA；

具体如下图所示：

CircRNA的四种主要类型示意图（图片来源：Greene et al. Frontiers in Molecular Biosciences, 2017）


CircRNA的表达模式多样且复杂（具体如下图所示）。比如GCN1L1基因产生的circRNA在人类中明显表达，但在小鼠中却很少表达（如下图B所示）。而且，circRNA的剪接模式多样，其中，alternative bac