油条&豆浆
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学习过程中遇到的坑

2. 将两个 pdb 格式文件合并保存成一个 pdb 格式,如果使用 pymol 完成这一目的,保存的文件会有一定问题。比如,把蛋白文件和优化后的配体文件使用 pymol 合并保存成一个 PDB 格式文件,如果使用 PLIP(注:PDB 格式文件是 PDB_ID 为 5ANR 的配体 8RW,sdf 格式文件是该文件通过 openbabel 转换格式得到的,我使用的 RDKit 版本是 2019.03.4。转换格式,也可以试试 openbabel ,但是有的时候也会出错,识别不准芳香键,其他的倒还好。
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博文更新于 2023.11.24 ·
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8.1.1使用plot()绘制折线图

plot()函数主要用于绘制各类函数曲线,其原型如下。plot( [x] , y , [fmt] , data=none , **kwargs)其中各参数含义如下。(1)x : 横轴变量名(2)x : 纵轴变量名(3)fmt : 格式参数集合,可以使用关键字参数对单个属性赋值,如颜色,线的类型等(4)data: 参数可以使用所有可被索引的对象数据类型,如字典、Pandas中的DataFame或NumPy中的结构化数组等例一、绘制一条正弦曲线import matplotli.
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博文更新于 2021.11.15 ·
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