WRF-DA代码编译与安装(一)——依赖库的编译与安装

版权声明:本文为博主原创文章,遵循 CC 4.0 by-sa 版权协议,转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接:https://blog.csdn.net/ESA_DSQ/article/details/68954924

由于笔者的研究需要用到数据同化技术,所以开始学习WRF相关内容(主要是WRF-DA模块)。这里先解释下WRF是什么东西。

WRF全称Weather Research and Forecasting Model, 是一个天气研究与预报模型.可以用来进行精细尺度的天气模拟与预报。

二战后,由于计算机技术的迅猛发展,气象预报技术也随之突飞猛进。短短的几十年里,世界各地的气象研究机关开发出了各自的相对独立的气象模式。这些模式之间缺少互换性,对科研及业务上的交流极其不便。从上世纪90年代后半开始,美国对这种乱立的模式状况进行反省。最后由美国环境预测中心(NCEP),美国国家大气研究中心(NCAR)等美国的科研机构为中心开始着手开发一种统一的气象模式。终于于2000 年开发出了WRF模式。同时,为使研究成果能够迅速地应用到现实的天气预报当中去,WRF模式分为ARW(the Advanced Research WRF)和NMM(the Nonhydrostatic Mesoscale Model)两种,即研究用和业务用两种形式,分别由NCEP和NCAR管理维持着。
具体的可以见官网:

http://www2.mmm.ucar.edu/wrf/users/

WRF模拟系统主要包含WPS和WRF两部分模块: WPS模块全称为WRF Pre-processing System,即WRF预处理系统,用来为WRF模型准备输入数据;如果只是做理想实验(idealized modeling),就不需要用WPS处理真实数据。但是理想实验不在本文介绍范围内,本文介绍的是进行真实数据模拟的操作。 WRF模块就是数值求解的模块,它有两个版本:ARW(Advanced Research WRF) 和 NMM(Nonhydrostatic Mesoscale Model)。大多数研究者主要用的都是ARW版本,本文所有的介绍也都基于ARW版本。 除了WPS与WRF两大核心模块外,WRF系统还有很多附加模块:比如用于数据同化的WRF-DA,用于化学传输的WRF-chem,用于林火模拟的WRF-fire(该段文字引自xg1990的博客,具体地址文末贴出,感谢该位大神的分享)。
安装运行WRF模拟系统必须在Linux系统。而笔者又无法放弃windows系统,同时目前工作还处于前期测试阶段,故决定选择用VMware虚拟机搭建一个Linux系统来测试。
选用的VMware版本:12.5.2。
Linux系统:Ubuntu 16.04
具体安装过程不是本文重点。详情可见

https://jingyan.baidu.com/article/c275f6ba07e269e33d756714.html

此外附上Ubuntu官网链接

https://www.ubuntu.com/download/desktop

WRF-DA编译与安装主要参照官方提供的ppt和文档(地址文末会贴出)。
这里写图片描述

首先看下WRF-DA编译与安装的需求。
这里写图片描述
这里写图片描述
这里写图片描述

上面提到了需求如下:
1.Linux/Mac系统,基于Unix或Linux的系统
2.(3DVAR)三维变分的案例内存占用不大,大的(4DVAR)四维变分内存消耗较大。
3.支持C和Fortran的编译器(ifort/icc, gfortran/gcc,pgf90/pgcc)
4..需要的一些库,类似于WRF。包括:Zlib,netCDF C/Fortran,MPI(MPICH),BUFR,CRTM,RTTOV,HDF5。
系统已经安装完毕,而内存部分目前暂时不考虑。接下来看C和Fortran的编译器。
Ubuntu内置了gcc的编译器。可以通过命令来查看。

~$ gcc -v

结果如下:
这里写图片描述

接下来安装gfortran,也是通过命令进行安装。

~$ sudo apt-get install gfortran

通过命令查看是否安装成功。

~$ gfortran -v

这里写图片描述
接下来是几个库的下载与安装。
zlib:

http://www.zlib.net/

netCDF C/Fortran:

http://www.unidata.ucar.edu/downloads/netcdf/index.jsp

MPI(MPICH):

http://www.mpich.org/downloads/

BUFR:包含在WRF源代码中

CRTM:包含在WRF源代码中

RTTOV:

https://nwpsaf.eu/site/software/rttov/

需注册,最好自备梯子。

HDF5:

https://support.hdfgroup.org/HDF5/

将如上的几个库的安装包通过共享文件夹放入虚拟机中(mnt/hgfs/Share)。

zlib和hdf5和netCDF 4相关。具体安装步骤和教程借鉴了官方文档

http://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/docs/getting_and_building_netcdf.html#build_nc4_dap_from_source

1.zlib的安装:解压到/usr/下

$ cp -r zlib-1.2.11.tar.gz /usr/
$ tar zvf zlib-1.2.11.tar.gz

然后进入解压文件夹,并安装

$ ./configure --prefix=/usr/local/zlib
$ make check
$ make install

修改环境变量。

gedit ~/.bashrc
# for zlib  
export ZLIB_HOME=/usr/local/zlib  export
LD_LIBRARY_PATH=$ZLIB_HOME/lib:$LD_LIBRARY_PATH

2.HDF5的安装:解压到/usr/下

$ tar -xvf hdf5-1.8.18.tar

然后进入解压文件夹,并安装

$ ./configure --with-zlib=/usr/local --prefix=/usr/local/hdf5
$ make 
$ make check
$ make install

HDF5的安装和检验参照:

./configure --prefix=/usr/local/hdf5 --with-zlib=/usr/local/zlib 

http://blog.csdn.net/luoying_1993/article/details/53228473

HDF5还需配置一个环境变量,避免下面的netCDF C安装报错。

$ gedit ~/.bashrc
#for hd5
export CPPFLAGS=-I$PRO_PATH/usr/local/hdf5/include 
export LDFLAGS=-L$PRO_PATH/usr/local/hdf5/lib 
export LD_LIBRARY_PATH=$PRO_PATH/usr/local/hdf5/lib
$ source ~/.bashrc

3.netCDF C/Fortran安装
先装netCDF C:

$ export CPPFLAGS=-I$PRO_PATH/usr/local/hdf5/include 
$ export LDFLAGS=-L$PRO_PATH/usr/local/hdf5/lib 
$ export LD_LIBRARY_PATH=$PRO_PATH/usr/local/hdf5/lib
$ ./configure --prefix=/usr/local/NETCDF --enable-netcdf-4
$ make 
$ make check
$ make install

接着装netCDF Fortran:
先声明环境变量:

$ export CPPFLAGS=-I/usr/local/NETCDF/include
$ export LDFLAGS=-L/usr/local/NETCDF/lib

然后进行下一步编译。

$ ./configure --prefix=/usr/local/NETCDF FC=gfortran

4.mpich的安装:
解压之类的步骤同上,同样放到usr下面。
解压到指定路径。

$ tar zxf mpich-3.2.tar.gz 
$ ./configure -prefix=/usr/local/mpi/

5.rttov的安装:
rttov解压出来东西较多,同样新建个path来存放。

$ tar zxf rttov113.tar.gz 
$ cd src
$ ../build/rttov_compile.sh

打完收工。目前应该就完成了WRF-DA编译安装前所有需要的依赖库的编译及安装。下一篇更新WRF-DA具体的编译与安装。由于对Linux系统不熟悉,加上坑爹的rttov,博客写了两三天。从内心坚持要提醒大家的一点,Linux编译环境一定要注意环境变量!!!

最后重点鸣谢几位主要参考大神的博客以及相关文档:

https://wenku.baidu.com/view/58851bc269eae009591bec0a.html
https://nwpsaf.eu/site/software/rttov/rttov-v12/
http://www2.mmm.ucar.edu/wrf/users/wrfda/updates-3.8.1.html
https://xg1990.com/blog/archives/190
http://blog.csdn.net/luoying_1993/article/details/53228473

展开阅读全文

没有更多推荐了,返回首页