如何生成HDF5文件

在使用深度学习学习图像文件的时候,如果图片文件很多,比如大几千张,或者几万张。如果将一个图片再接一个图片导入到内存中,会极大地拖慢深度学习算法运行速度。我们都有过这样的经验,如果将一个文件夹里面有几万个文件的文件夹进行复制,其速度要比将文件夹打包之后复制速度要慢很多。

为了不让IO运算(将硬件中的图片一个一个导入到内存中)成为深度学习训练速度无法提高的一个瓶颈,这里来介绍一种方法,就是将很多的文件打包成一个HDF5的文件格式,最后用深度学习算法学习的时候,直接HDF5文件中导入数据就可以。

HDF5文件介绍

HDF5是一种数据存储格式,特别适合向磁盘中存取大数据的时候使用。一个HDF5文件可以被看成一个组,包含了不同的数据集,数据集可以是图像表格等等。HDF5组结构类似于文件系统的目录层次结构,根目录再包含其他目录。节点目录里存放相应的数据集。

在这里插入图片描述
安装很简单,使用pip

pip install h5py

如何将训练数据生成HDF5文件

class HDF5DatasetWriter:
    def __init__(self, dims, outputPath, dataKey="images", bufSize=1000):
        # 如果输出文件路径存在,提示异常
        if os.path.exists(outputPath):
            raise ValueError("The supplied 'outputPath' already exists and cannot be overwritten. Manually delete the file before continuing", outputPath)

        # 构建两种数据,一种用来存储图像特征一种用来存储标签
        self.db = h5py.File(outputPath, "w")
        self.data = self.db.create_dataset(dataKey, dims, dtype="float")
        self.labels = self.db.create_dataset("labels", (dims[0],), dtype="int")

        # 设置buffer大小,并初始化buffer
        self.bufSize = bufSize
        self.bu
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HDF5是一种用于存储和管理大规模科学数据的文件格式,而Java是一种广泛使用的编程语言。在Java中,我们可以使用HDF5的Java接口库来生成HDF5格式的文件。 要生成HDF5格式文件,首先需要在Java项目中导入HDF5库。可以通过在项目中添加相应的Maven/Gradle依赖项或手动导入库的jar文件来完成。一旦导入了HDF5库,就可以开始使用它来生成HDF5文件。 在Java中,可以通过以下步骤来生成HDF5格式文件: 1. 创建一个HDF5文件对象。这可以通过使用HDF5库中的H5File类来实现。可以指定文件的名称和打开方式(例如创建新文件或打开现有文件)。 2. 在文件中创建一个组。可以使用HDF5库中的H5Group类来实现。组是HDF5中的一种层次结构,可以用来组织和管理数据集。 3. 向组中添加数据集。数据集是存储实际数据的对象。可以使用HDF5库中的H5Dataset类来创建数据集。需要指定数据集的名称、数据类型和维度等属性。 4. 将数据写入数据集。可以使用HDF5库中的相应方法将数据写入数据集中。根据数据类型的不同,可以使用不同的写入方法。例如,可以使用write方法将整数或浮点数写入数据集,或者使用writeString方法将字符串写入数据集。 5. 关闭文件。在数据写入完成后,应该关闭HDF5文件以释放资源。可以使用H5File类中的close方法来关闭文件。 通过上述步骤,我们可以在Java中生成HDF5格式的文件。这个文件可以包含组和数据集,以及用户定义的数据。

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