洛谷OJ: P1140 相似基因(DP)

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思路:仍然是一道简单的DP,首先我们来分析一下有几种策略可以选择

1.令第一条链的碱基与空碱基配对

2.令第二条链的碱基与空碱基配对

3.令两条链的碱基相互配对

那么我们很容易就能够得到状态转移方程了,dp[i][j]表示第一条链的1~i部分与第二条链的1~j部分的最大匹配值

dp[i][j] = max{dp[i][j], dp[i-1][j]+a[i]与空碱基的匹配值, dp[i][j-1]+b[j]与空碱基的匹配值, dp[i-1][j-1]+a[i]与b[i]的匹配值}

因为i和j都要用到之前的状态,所以i和j都从1开始推

/**
 *	题目: 洛谷OJ:  P1140 相似基因(DP)
 *	题型: DP
 **/
#include <cstdio>
#include <cstring>
#include <iostream>
using namespace std;

const int maxn = 100+10;
const int w[6][6] = {{0,0,0,0,0,0},
			  	  	 {0,5,-1,-2,-1,-3},
					 {0,-1,5,-3,-2,-4},
					 {0,-2,-3,5,-2,-2},
				 	 {0,-1,-2,-2,5,-1},
					 {0,-3,-4,-2,-1,0}};
int dp[maxn][maxn], a[maxn], b[maxn], n, m;

int create() {
	char ch; 
	cin >> ch;
	switch(ch) {
		case 'A': return 1; 
		case 'C': return 2; 
		case 'G': return 3; 
		case 'T': return 4; 
	}
}

int main()  {
	/************input**************/
	cin >> n; for(int i = 1; i <= n; i++) a[i] = create();
	cin >> m; for(int i = 1; i <= m; i++) b[i] = create();
	/*******************************/
	
	/************init***************/ 
	//初始化工作一定要做好, 开始因为初始化疏忽大意WA了一个点 
	memset(dp, -0x3f, sizeof(dp));
	dp[0][0] = 0;
	for(int i = 1; i <= n; i++) dp[i][0] = dp[i-1][0] + w[a[i]][5];
	for(int i = 1; i <= m; i++) dp[0][i] = dp[0][i-1] + w[b[i]][5];
	/*******************************/
	for(int i = 1; i <= n; i++) {
		for(int j = 1; j <= m; j++) {
			//为了方便阅读就不使用这种写法了 
			//dp[i][j] = max( dp[i][j], max( dp[i-1][j]+w[a[i]][5], max(dp[i][j-1]+w[b[j]][5], dp[i-1][j-1]+w[a[i]][b[j]]) ) );
			dp[i][j] = max(dp[i][j], dp[i-1][j]+w[a[i]][5]); //令a[i]与空碱基配对 
			dp[i][j] = max(dp[i][j], dp[i][j-1]+w[b[j]][5]); //令b[j]与空碱基配对
			dp[i][j] = max(dp[i][j], dp[i-1][j-1]+w[a[i]][b[j]]); //令a[i]与b[j]配对 
		}
	}
	cout << dp[n][m] << endl;
	return 0;
}

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