【Rosalind Problems】好久没做题了……

最新推荐文章于 2024-09-22 17:12:26 发布
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分类专栏： Rosalind 杂七杂八的Python小代码 文章标签： python
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本文链接：https://blog.csdn.net/Emmett_Bioinfo/article/details/116997265
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今天发现好久没做题了，虽然代码常写，但是感觉那些题里和题后大家的讨论里能学到更多算法相关的东西，因为感觉有时候自己写的代码有点笨，可能数据一大就会爆炸。所以还是继续开始做题。之后也会继续写一下做题笔记。

然后现在我已经把所有的我的关于Rosalind的解题代码都放到Github上面保存了。

加油，继续进步叭！

EmmettPeng
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专栏目录
Bioinformatics-Problems-Rosalind：来自Rosalind的小型编码任务以及一些日常有趣的编码和学习活动
02-05
你好！ 我是维杰 生物信息学 :laptop_computer: 程序员Linux :red_heart: 情人不变 :hot_beverage: 学习者 我=（¼生物信息学家） +（¼程序员）+（½生物学家） 我叫Vijay Lakhujani ，是位生物信息学家，对基因组...
Rosalind网站答案生物信息学
09-09
Rosalind是一个在线平台，提供了一系列生物信息学的练习题，帮助初学者通过编程解决实际问题，掌握生物信息学的基础知识。 在提供的代码片段中，我们看到了以下几个关键知识点： 1. **统计DNA序列脱氧核苷酸数目**...
记录---Rosalind之problems&Solutions__0002
Ada's Corner
04-13 360
斐波那契数列 费波那契数列由0和1开始，之后的费波那契系数就是由之前的两数相加而得出。 首几个费波那契系数是：0, 1, 1, 2, 3, 5, 8, 13, 21, 34, 55, 89, 144, 233…… 起源于 Leonardo Fibonacci 描述兔子生长的数目时用上了这数列，假设： 第一个月初有一对刚诞生的兔子 第二个月之后（第三个月初）它们可以生育 每月每对可生...
记录---Rosalind之problems&Solutions__0001
weixin_34347651的博客
04-11 103
Rosalind is a platform for learning bioinformatics and programming through problem solving. http://rosalind.info/problems/list-view/ DNA：Counting DNA Nucleotides（对DNA的每一类碱基计数） 方式一 dic={} with open('...
Rosalind第15题——ros_bio15_LIA
他城她糖i的博客
07-30 130
如果第一次阅读，请查看写在前面 #阶乘的递归 def factorial(n): if n == 0: return 1 else: return n * factorial(n - 1) k, n = input("请输入k和n的值：").split(" ") k, n = map(int, (k, n)) m = 2 ** k #总共2^K次实验 i = 2 ** k #反向计算n，n+1……2^k成功的概率 p = 0 while i >=
rosalind练习题
qq_38790244的博客
07-25 1418
1、统计各碱基的数量, 计算整条序列长度 seq = '' with open('./1.txt', "r") as f: for line in f: if line[0] != ">": #print(line) line = line.strip().upper() ...
rosalind练习题六
weixin_44619692的博客
05-15 63
这道题要求我们计算两个等长的 DNA 序列之间的 Hamming 距离，也就是这两个序列在同一位置上不同碱基的数量。计算两个等长的 DNA 序列之间的 Hamming 距离。
rosalind练习题三
weixin_44619692的博客
05-10 62
ProblemAAAACCCGGTACCGGGTTTT# 方法一# 方法二。
Rosalind:罗莎琳德的解答练习
03-08
在生物信息学领域，Rosalind是一个非常受欢迎的在线学习平台，它专为那些希望通过解决实际问题来学习生物信息学和编程技术的人设计。Rosalind的练习涵盖了从基础到高级的各种生物信息学概念，主要使用Python编程语言...
Rosalind:罗莎琳德在线学习
05-18
为了使学习生物信息学变得轻松有趣，我们建立了Rosalind，这是一个通过解决问题来学习生物信息学的平台。 罗莎琳德提出了一系列智力上令人兴奋的问题，这些问题随着生物学和计算的复杂性而增加。 每个问题都会自动...
Rosalind-problem-codes:使用Python解决Rosalind问题的解决方案代码
04-08
在本项目"Rosalind-problem-codes"中，作者使用Python编程语言解决了Rosalind平台上的一系列生物信息学问题。Rosalind是一个在线教育平台，它将编程与生物学问题相结合，帮助用户学习生物信息学的基本概念和算法，...
宏基因组分箱CheckM评估结果的提取
Emmett Diary
05-16 4320
CheckM结果转化为易整理的表格形式
DNA-蛋白翻译过程的Python实现
Emmett Diary
04-08 2630
引言 最近为了给平台上加上一个将DNA序列翻译为蛋白序列的工具，写了一个任何生信玩家初学时都会写的代码。看了一些别人的翻译工具，我也想尽量把代码写的完整一点，在这个过程中首次接触并使用了BioPython，目前看起来还是很好用的。 代码 #!/bin/python3 from Bio.Seq import translate, reverse_complement from Bio import SeqIO from Bio.SeqIO.FastaIO import SimpleFastaParser i
初探Selenium：获取网页中的特定标签下的文本信息
Emmett Diary
03-09 2287
工作目的 组里师兄最近遇到一个问题，他有一堆有机物化学式需要去http://www.chemspider.com这个网站上看看有没有已知的结构和物质。他的化学式太多，一个一个查肯定效率低下，于是想用代码来做这件事。我之前也是正好瞅见过其他师兄用过selenium这个软件来做浏览器的模拟，想了一下可能自己可以试试这个东西的用法，然后就造出了下面这个代码。 代码 没空写太多废话，直接上代码： #!/bin/python3 #coding=utf-8 from selenium import webdriver
BioPython读取FASTA文件保留header中空格的方法
Emmett Diary
03-30 910
问题 最近开始学习使用Biopython这个工具包，非常方便地可以处理一些序列文件。最近用Bio.SeqIO模块进行读取fasta文件到字典中的时候发现一个问题，如果你的fasta文件>开头的那一行header中含有空格的话，该行内容以键存到字典里，这个header会被从第一个空格的地方截断，比如原本的文件是这样的： >Header1 this is the sequence name ATCGATCGATCG 读进去之后可能就变成了 >Header1 解决办法 使用descripti
用bs4完成html中标签中文本的爬取
Emmett Diary
03-11 647
其实还是为了昨天的工作（https://blog.csdn.net/Emmett_Bioinfo/article/details/114590394）。经过我查阅了一些资料，我发现用Selenium来做昨天这件事确实是大材小用了，因为获得文本内容其实只需要网页源代码，根本不需要把网页全部显示出来，昨天的做法对于这件事来说是又慢又吃力不讨好。 今天学习了一下beautiful soup4干了这件事，代码如下： #!/bin/python3 #coding=utf-8 #from selenium impor
简单题101. 对称二叉树 （python）20240922
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Sep21m_wyy的博客
09-22 398
【代码】简单题101. 对称二叉树 （python）20240922。
人工智能前沿：情感计算的探索与未来
"《人工智能之情感计算》报告深入探讨了情感计算的概念、技术、人才、应用和未来趋势，从1995年MIT教授Rosalind Picard提出情感计算概念到现代，该领域逐渐受到广泛关注。报告包含了丰富的图表，如情感计算研究内容...
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