Python机器学习应用 | 聚类——DBSCAN方法及应用

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1 DBSCAN密度聚类

DBSCAN算法是一种基于密度的聚类算法:
• 聚类的时候不需要预先指定簇的个数
• 最终的簇的个数不定

DBSCAN算法将数据点分为三类:
• 核心点:在半径Eps内含有超过MinPts数目的点
• 边界点:在半径Eps内点的数量小于MinPts,但是落在核心点的邻域内
• 噪音点:既不是核心点也不是边界点的点

2 DBSCAN算法流程

1.将所有点标记为核心点、边界点或噪声点;
2.删除噪声点;
3.为距离在Eps之内的所有核心点之间赋予一条边;
4.每组连通的核心点形成一个簇;
5.将每个边界点指派到一个与之关联的核心点的簇中(哪一个核心点的半径范围之内)。

有如下13个样本点,使用DBSCAN进行聚类

取Eps=3,MinPts=3,依据DBSACN对所有点进行聚类(曼哈顿距离)。

对每个点计算其邻域Eps=3内的点的集合。
集合内点的个数超过MinPts=3的点为核心点
查看剩余点是否在核心点的邻域内,若在,则为边界点,否则为噪声点。

将距离不超过Eps=3的点相互连接,构成一个簇,核心点邻域内的点也会被加入到这个簇中。则右侧形成3个簇。

3 DBSCAN的应用实例

3.1 数据介绍

现有大学校园网的日志数据,290条大学生的校园网使用情况数据,数据包括用户ID,设备的MAC地址,IP地址,开始上网时间,停止上网时间,上网时长,校园网套餐等。利用已有数据,分析学生上网的模式。

3.2 实验目的

通过DBSCAN聚类,分析学生上网时间和上网时长的模式。
技术路线:sklearn.cluster.DBSCAN

3.3 数据实例

3.4 实验过程

使用算法: DBSCAN聚类算法

3.4.1 建立工程,导入sklearn相关包

import numpy as np
import sklearn.cluster as skc
from sklearn import metrics
import matplotlib.pyplot as plt

3.4.2 读入数据并进行处理

mac2id=dict()
onlinetimes=[]
f=open('TestData.txt',encoding='utf-8')
for line in f:
    mac=line.split(',')[2]
    onlinetime=int(line.split(',')[6])
    starttime=int(line.split(',')[4].split(' ')[1].split(':')[0])
    if mac not in mac2id:
        mac2id[mac]=len(onlinetimes)
        onlinetimes.append((starttime,onlinetime))
    else:
        onlinetimes[mac2id[mac]]=[(starttime,onlinetime)]
real_X=np.array(onlinetimes).reshape((-1,2))

3.4.3 上网时间聚类,创建DBSCAN算法实例,并进行训练,获得标签

X=real_X[:,0:1]

db=skc.DBSCAN(eps=0.01,min_samples=20).fit(X)
labels = db.labels_

3.4.4 输出标签,查看结果

print('Labels:')
print(labels)
raito=len(labels[labels[:] == -1]) / len(labels)
print('Noise raito:',format(raito, '.2%'))

n_clusters_ = len(set(labels)) - (1 if -1 in labels else 0)

print('Estimated number of clusters: %d' % n_clusters_)
print("Silhouette Coefficient: %0.3f"% metrics.silhouette_score(X, labels))

for i in range(n_clusters_):
    print('Cluster ',i,':')
    print(list(X[labels == i].flatten()))

结果如下:

3.4.5 画直方图,分析实验结果

plt.hist(X,24)
plt.show()


上网时间大多聚集在22:00和23:00

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