生命系统的本质是不同类型细胞之间的相互作用网络,对单个细胞开展研究有助于更深入的了解生命活动的复杂机制。尤其可以注重发现细胞间的异质性。
单细胞技术通过分离单细胞进行测序,可以分析组织中存在的细胞类型,鉴定细胞的状态,研究细胞间的异质性,通过单细胞水平的基因表达变化揭示分化发育、疾病发生发展、肿瘤耐药等分子机制。在肿瘤、辅助生殖、发育、育种、空间组学和多组学中都有应用。The Innovation|单细胞新技术与应用_腾讯新闻 (qq.com)
单细胞测序是单细胞技术中的核心。它是衔接实验和计算数据分析的关键一步。测序数据的可靠性、稳定性等关系着实验以及结果的准确性。
单细胞测序技术(Single cell sequencing)是在单个细胞水平上,对基因组、转录组及表观基因组水平进行测序分析的技术。其中单细胞RNA测序(scRNA-seq)是应用最多的技术。scRNA-seq可以揭示细胞的类型、状态、功能和相互作用,以及细胞在发育、分化、疾病等过程中的动态变化。
目前,scRNA-seq有居多的测序协议。不同的测序协议方法有着不同的优缺点。其中
🤩 scRNA-seq | 吐血整理的单细胞入门教程(从原理到代码实操)(一)-腾讯云开发者社区-腾讯云 (tencent.com)SMART-seq2是一种流行的低通量方法,提供全长转录本定量。它非常适合于更详细地研究一小群细胞(例如,差异同种异构体的使用,低表达转录物的表征)。10x Chromium是一种流行的高通量方法,使用UMIs进行转录本定量(从3 '或5 '端)。它非常适合于研究高度异质性的组织和大规模取样的大量细胞。
单细胞测序技术作为单细胞技术中的关键一步,它的应用与单细胞技术一致。在农业、医学、生物等领域都有涉及。
总结:
1、单细胞测序技术在多个领域都展现出了强大的应用前景,为科学研究提供了新的工具和方法。
2、单细胞测序技术为医学疾病研究提供强大的理论指导,可以推进诊断治疗的进展。
3、该技术涉及多种技术交叉,会存在一定测序方法上通量、灵敏度以及成本等问题。但随着技术的不断进步和成本的下降,这些问题将不断改善。该技术将在未来的生物学研究和医学诊断中发挥越来越重要的作用。
我目前正在学习单细胞测序,但尚未积累实践经验,因此对于如何选择合适的测序协议仍感困惑。希望各位能给予我一些宝贵的建议和指导。