FASTX-Toolkit安装在指定目录下

本文详细介绍了如何在Linux环境下手动安装FASTX-Toolkit,并将其安装在指定的目录下,包括下载libgtextutils,配置安装路径,更新环境变量等步骤。
摘要由CSDN通过智能技术生成

最近安装了一下用于分析fastq文件的软件FATAX-Tookit和大家分享一下安装过程。


首先要安装 libgtexutils

可以在以下网址下载libgtexutils和FASTA-Toolkit:分别为libgtextutils-0.7.tar.gz 和 fastx_toolkit-0.0.14.tar.bz2 文件

http://cancan.cshl.edu/labmembers/gordon/fastx_toolkit/download.html

也可以在命令行里面输入获取软件,下载软件后进行解压,编译,编译的时候加入--prefix=/你/有权限/读写/的路径/,不然的话默认安装在/usr/local/bin/路径下

$ wget https://github.com/agordon/libgtextutils/releases/download/0.7/libgtextutils-0.7.tar.gz

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