周报第三十一周

周报第三十一周

学习时间

周报第三十一周：2023.12.4-2023.12.10

本周进度

1.查询schiclusterde New Tutorial,之前跑的代码，组会时说之前跑的都是比较老的turorial(2019年的论文)，查询new turorial(2023年论文)之后搜集数据集，查看了snm3C数据集的格式，其结果是基因的甲基化图谱，分为2d的bedpe文件和1d的bed文件。
2.阅读了schicluster new tutorial的compartment和embedding部分的代码。

下周计划

1.阅读完毕schicluster的代码，理解其架构。
2.跑完schicluster的new turorial。
3.熟悉snm3C及其甲基化测序技术。