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原创 可能是第一篇汉化PanACoTA教程。。。。(无原理,纯代码,下次补充。。。)
最近,SonicParanoid引入了使用高效且准确的程序mmseqs2来构建全基因组的方法,PPanGGOLiN使用相同的工具提供了一种按频率对全基因组家族进行统计分类的方法(19–21)。最近的一些程序还使用基于图的方法进一步完善了泛基因组,例如PPanGGOLiN和Panaroo(16)。为此,通过这两种工具对319个肺炎克雷伯菌的基因组数据集的分析提供了相似的结果(16)。一些工具,例如PIRATE(22)最近还被开发为在遥远的基因组之间聚集直向同源物。但是,所有这些程序都缺少比较基因组学中必不可.
2021-05-21 23:04:08 822
原创 从一个很大的fasta文件提取序列名称含有特定字样的序列
这是我导师给我的一个任务从一个很大的fasta文件提取序列名称含有特定字样的序列,合成新的fasta文件一开始一直想不到怎么去做,知道调用了split-fasta这个python库。话不多说,上代码!(这是基于windows下的啊打开pycharm copy好文件到项目目录系统终端输入:pip install spilt-fasta之后直接在命令行(系统终端命令行,不是python的)splitfasta 你要分割的fasta文件名.fasta之后他会创建一个目录test_split
2021-05-18 13:04:31 1928 2
空空如也
alphafold2-pytorch 库报错
2021-04-03
RSTUDIO 下python中文乱码,无法纠正。
2021-01-30
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