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RSS订阅原创 使用SMRTlink分析转录组三代测序（PacBio Iso-seq）（未完成）
目录摘要安装流程摘要测序三个样品：sample1.subreads.bam # 测序结果，一般都有几百GB的大小sample1.subreads.bam.pbi # 由pbindex根据bam文件生成的索引文件，与samtools index生成的索引文件不同sample2.subreads.bamsample2.subreads.bam.pbisample3.subreads.bamsample3.subreads.bam.pbi安装略流程1、生成CCS序列，这一步比较耗时
2021-03-14 15:50:10
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原创 Linux系统的虚拟内存的简单配置
Linux系统的虚拟内存管理1、什么是虚拟内存（Swap）？2、添加虚拟内存3、启用虚拟内存4、关闭虚拟内存5、删除虚拟内存1、什么是虚拟内存（Swap）？虚拟内存是计算机系统内存管理的一种技术。它使得应用程序认为它拥有连续的可用的内存（一个连续完整的地址空间），而实际上，它通常是被分隔成多个物理内存碎片，还有部分暂时存储在外部磁盘存储器上，在需要时进行数据交换。目前，大多数操作系统都使用了虚拟内存，如Windows家族的“虚拟内存”；Linux的“交换空间”等。操作环境：Ubuntu 20.04 （
2021-03-12 21:26:25
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原创 笔记本WIFI过一段时间后无网络连接
华硕X550VC笔记本，安装Windows10 操作系统。使用WIFI连接网络，过一段时间后WIFI无网络访问，可能几个小时。WIFI本身是有网络访问的，是笔记本的问题，尝试断开连接再重连，就再也连不上了，必须重启电脑。尝试过设备的电源管理方面的设置，也没有用，也不知道是不是自己的笔记本太老了出现的问题。某次我在设备管理中把无线网卡的驱动卸载了之后，过一会系统自动重
2017-07-16 10:12:41
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原创 笔记本安装Linux双系统WIFI无法使用
我的是华硕X550VC笔记本，安装Ubuntu系统后刚进入系统WIFI没网，搜索用不到网络，多次重装都是这样。不知道是什么原因导致的。解决办法：进入系统后，先使用Fn+休眠键让系统休眠，过几秒钟之后再进入系统，此时WIFI就能建立网络连接了。
2017-07-16 10:06:49
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原创 计算基因组染色体长度的Python脚本
调用命令：python cal_chrom_length.py hg19.fasta hg19.len import sysimport osfasta_path = sys.argv[1]len_path = sys.argv[2]temp_path = len_path + ".temp"fw = open(len_path, "w+")os.system("fasta
2017-06-21 15:00:49
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原创 Windows 10 关闭系统自动更新
Windows 10 默认不支持关闭系统更新，而自动更新十分频繁，遇上更新失败，撤销更新更加麻烦，可以通过组策略和服务对更新进行禁用。1、输入命令：gpedit.msc进入组策略设置，依次打开“管理模板”、“Windows组件”、“Windows更新”、“配置自动更新”，选择“已禁用”，“确定”。2、输入命令：services.msc，进入服务设置界面。选择“Windows upd
2017-06-16 19:14:16
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原创 VS2013使用本地GIT管理源代码
一、需要的软件：1、JRE：JAVA运行时环境，scm-manager运行在java虚拟机中。2、scm-manager：提供git仓库的功能3、git工具：vs2013通过git工具与scm-manage实现通讯4、vs2013旗舰版：编写源代码二、操作过程：1、下载并安装java运行环境，注意区分32/64位。http://www.oracle.com/techne
2017-05-31 22:16:05
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原创 Linux下快速MD5检测
当下载了一大批的文件之后，需要检查下载下来的文件是否完整，校验MD5是一个不错的选择。1、检测单个文件的MD5值：md5sum filename2、如果目录下有md5.md5文件，该文件描述了该文件夹下的所有文件的MD5值，可批量校验，该文件的内容为一个文件一行，格式为3、使用一下命令进行批量校验：md5sum -c md5.md5
2017-05-25 16:40:18
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原创 使用sftp下载文件
1、在终端下，输入命令:sftp username@hostname2、回车后要求输入密码，输入密码后进入账户目录。3、我需要将根目录下的AAA文件夹下载到本地，输入命令：get -r AAA如果不是文件夹就不需要-r参数4、等待下载完成。
2017-05-25 15:39:40
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原创 Linux下安装Gviz
在全新的Ubuntu 16.04 LTS版64位桌面版操作系统下1、安装libxml2sudo apt-get install libxml2sudo apt-get install libxml2-dev2、安装libcurlsudo apt-get install libcurl3sudo apt-get install libcurl4-gnutls-dev3
2017-05-17 16:55:49
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原创 Linux下加快SSH链接验证
1、在服务器端以管理员权限编辑/etc/ssh/sshd_configsudo vim /etc/ssh/sshd_config2、添加以下设置：UseDNS noUseDNS的功能主要是当客户端链接服务器时，使用客户端的IP查询得到计算机名称，再根据计算机名称查询得到IP，如果这两个IP不一致则拒绝登录，主要适用于主机欺骗。关闭该功能后不再验证IP，节省时间。
2017-05-16 16:36:02
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原创 CentOS Linux 7 安装 VirtualBox
1、在oracle官网下载VirtualBox的安装包：http://download.virtualbox.org/virtualbox/5.1.22/VirtualBox-5.1-5.1.22_115126_el7-1.x86_64.rpm2、下载VIrtualBox的公钥：https://www.virtualbox.org/download/oracle_vbox.asc3
2017-05-12 12:26:59
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空空如也
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