freesurfer制作组平均模板

本文档介绍了如何使用FreeSurfer的`make_average_subject`命令制作组平均模板,以及该过程涉及的参数选项。它还提到了FreeSurfer如何通过模板文件将个体受试者表面注册到平均参考表面,并讨论了创建自定义模板和区域地图集的方法,包括手动创建标签和使用`mris_ca_train`工具。
摘要由CSDN通过智能技术生成
  • make_average_subject #制作组平均模板
    • make_average_subject --out avgsubject --subjects subj1 subj2 subj3 subj4 #实例1

      • make_average_subject --out avgsubject --subjects 2 4
      • make_average_subject --out avgsubject --subjects 1.nii 2.nii 3.nii 4.nii 5.nii
      • tkregister2 --fstal --s avgsubject --mgz
      • 检查平均主题volume是否与 talairach 主题一致:
      • tkmedit avgsubject orig.mgz lh.white
      • 检查平均被摄体表面是否与体积对齐。您应该看到曲面或多或少地与褶皱对齐。请记住,这是talairach,因此音量会很模糊。
    • make_average_subject --subjects 1 2 3 4 5 6 7 --fsgd --f --out
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