js一个方法中的两个语句中间加alert弹出和不加alert弹出执行结果不一样

最近遇到一个很奇怪的问题：

“js一个方法中的两个语句中间加alert弹出和不加alert弹出执行结果不一样”

A;

alert();

B;

和

A;

B;

最终的运行结果不一样

（我说它奇怪是因为，A语句确实是执行完了，我在A里面做了运行完成的标识，如果A执行完了才能去执行B，即使是这样，运行结果还是出乎我的意料）。

最终解决是延迟B的执行window.setTimeout(addPar,100,nodeId);

但是还是不清楚怎么回事。