【ICPC-223】poj 3080 Blue Jeans

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思路：kmp+子串枚举

分析：
1 题目要求的是给定m个DNA序列，每个DNA序列长度固定为60，问m个DNA序列的最长的公共子串
2 初看题目无从下手，但是你仔细研究发现是要找m个序列的公共子串，那么这个子串必定存在于第一个DNA序列里面。这个时候就可以想到去枚举第一个DNA序列的所有子串，由于长度为60那么最多3600个子串，由于m最多10个；所以算一下复杂度就是0(3600*n*m),n是60和m最大10，那么这样的复杂度是可以接受的。

代码：

#include<iostream>
#include<algorithm>
#include<cstring>
#include<cstdio>
using namespace std;

#define MAXN 70
#define N 11

int t , m;
char DNA[N][MAXN];
int next[MAXN];

/*求next数组*/
void getNext(char *str){
    int len = strlen(str);
    next[0] = next[1] = 0;
    for(int i = 1 ; i < len ; i++){/*这里从1开始*/
       int j = next[i];
       while(j && str[i] != str[j])
           j = next[j];
       next[i+1] = str[i] == str[j] ? j+1 : 0;
    }
}

/*查找*/
bool find(char *str , char *tmpDNA){
   int len = strlen(str);
   int j = 0;
   for(int i = 0 ; i < 60 ; i++){
      while(j && str[j] != tmpDNA[i])
        j = next[j];
      if(str[j] == tmpDNA[i])
        j++;
      if(j == len)/*如果找到了return true*/
        return true;
   }
   return false;
}


int main(){
   int maxLen , vis;
   char ans[MAXN];
   char tmp[MAXN];
   scanf("%d" , &t);
   while(t--){
      scanf("%d" , &m);
      for(int i = 0 ; i < m ; i++)
         scanf("%s" , DNA[i]);
      /*枚举第一个DNA序列的所有子串*/
      maxLen = 0;
      for(int i = 0 ; i < 60 ; i++){/*枚举起点*/
         memset(tmp , '\0' , sizeof(tmp));
         int cnt = 0;
         for(int j = i ; j < 60 ; j++){/*枚举终点*/
            tmp[cnt++] = DNA[0][j];
            vis = 1;
            for(int k = 1 ; k < m ; k++){
               if(!find(tmp , DNA[k])){/*没找到就是不满足直接break*/
                   vis = 0;
                   break;
               }
            }
            /*如果tmp是m个序列的共同子序列则判断长度*/
            if(vis){
                 if(maxLen < cnt){
                     maxLen = cnt;
                     memcpy(ans , tmp , sizeof(tmp));
                  }
                  /*长度相等则判断字典序*/
                  else if(maxLen == cnt && strcmp(ans , tmp) > 0)
                     memcpy(ans , tmp , sizeof(tmp));
            }
         }
      }
      if(maxLen < 3)
        printf("no significant commonalities\n");
      else
        printf("%s\n" , ans);
   }
   return 0;
}