OpenBLAS blas_thread_init: pthread_create: Resource temporarily unavailable

当使用OpenBLAS的程序如OrthoFinder或SMC++遇到资源限制错误时,可以通过设置环境变量OPENBLAS_NUM_THREADS=1来限制线程数,避免超过系统限制。这通常是因为Python的Numpy库在使用OpenBLAS时创建过多线程导致的。通过限制线程数为1可以解决此问题。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

BLAS(Basic Linear Algebra Subprograms),翻译为基础线性代数子程序库,里面拥有大量已经编写好的关于线性代数运算的程序。OpenBLAS是其中一个实现了相关运算的开源程序库,其他软件在开发的时候就不需要额外造轮子,直接调用相关的API即可。

之前在使用OrthoFinder遇到了类似的问题,见https://github.com/davidemms/OrthoFinder/issues/68,最近在使用SMC++的时候也因为一样的问题报错

OpenBLAS blas_thread_init: pthread_create: Resource temporarily unavailable
OpenBLAS blas_thread_init: RLIMIT_NPROC 1024 current, 2583728 max
OpenBLAS blas_thread_init: pthread_create: Resource temporarily unavailable
OpenBLAS blas_thread_init: RLIMIT_NPROC 1024 current, 2583728 max
OpenBLAS blas_thread_init: pthread_create: Resource temporarily unavailable
OpenBLAS blas_thread_init: RLIMIT_NPROC 1024 current, 2583728 max
OpenBLAS blas_thread_init: pthread_create: Resource temporarily unavailable
OpenBLAS blas_thread_init: RLIMIT_NPROC 1024 current, 2583728 max

解决方法很简单,在运行代码之前设置一个环境变量

export OPENBLAS_NUM_THREADS=1

或python脚本中增加一行

os.environ["OPENBLAS_NUM_THREADS"] = "1"

问题的本质是,如果你的Python Numpy使用OpenBLAS进行数值运算,那么他可能创建过多的线程,超过了系统的限制,因此将其限制为1即可。

原文链接:https://blog.csdn.net/u012110870/article/details/106115577

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值