安装R语言扩展包vegan

本文介绍了如何在R环境中安装生态学扩展包vegan,以及使用vegan进行非度量多维尺度排序(NMDS)和Bray-Curtis距离计算的方法。
摘要由CSDN通过智能技术生成

这周的作业我开始得好迟啊。。。然而还是要努力做啊。。。

××××××××××××××我是萌萌哒分割线××××××××××××××××××××××××××××××××××××

首先,百度进入官方页面,看到这些:

也就是说,需要先安装permute和lattice包。那么,如何安装??

首先下载.tar.gz,然后在命令行

sudo R CMD INSTALL package.tar.gz

进入R环境,使用library()查看现在已经安装的包

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下面的内容来自vegan tutorial

Ordination分类:

1. Non-metric Multidimensional scaling

使用isoMDS函数计算,需要用vegdist作为输入。vegdist里存放的是表示群落之间不相似性程度的值,典型的是Bray-Curtis dissimilarity。

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