单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)及细胞分离技术分类汇总

本文介绍了单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术的重要性,它揭示了细胞间的表达异质性,并概述了几种常见的细胞分离技术,包括Micropipetting、Laser Capture Microdissection、FACS、Microdroplets和Microfluidics。此外,还对比了测全长和仅测3'或5'端转录本的技术,强调了它们在基因表达检测中的优缺点。最后,展示了不同scRNA-seq技术在检测准确性和灵敏性方面的表现。
摘要由CSDN通过智能技术生成

单细胞测序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu)

在过去的十多年里,高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域,极大促进了相关的研究和应用。其中转录组测序(RNA-seq)被广泛应用于测定和描绘各类物种的基因或转录本的表达情况。但传统的转录组测序技术(bulk RNA-seq)是基于群体细胞,每个样本包含成千上万个细胞,所以最终反映的是基因在群体细胞中平均表达水平,从而掩盖了不同细胞之间的表达异质性。近年来,单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,非常有利于研究细胞间的表达异质性。目前单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)已经广泛应用于各类物种(特别是人、小鼠等)的不同类型组织和细胞系,包括正常和病变细胞等。自从2009年等由汤富酬等人开发出了第一种单细胞转录组测序技术,目前已经有几十种不同的单细胞转录组测序技术相继被开发出

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