Windows 10尝试Mimic III 建库

环境:Windows 10

参考:医学方的技术贴。嗯,其实过程挺简单的。

1 准备工作

已经申请并验证好physionet的账号和使用权限,并拿到培训证书。

开代理,下载好mimicIII的所有压缩包。

解压好所有的csv。

下载https://github.com/MIT-LCP/mimic-code。

下载并安装好windows版PostgreSQL。

下载并安装好Navicat Premium。

2 导csv入数据库

大概使用这些代码就行

## 因为是刚安装的软件,直接
CREATE DATABASE mimic OWNER postgres;

\c mimic

## 建立所有表格
\i C:/mimicbuild/postgres_create_tables.sql

# 遇到错误停止
\set ON_ERROR_STOP 1

# 注意,这是一个坑,注意查看mimic表的位置											
SET search_path TO public;

# 设置csv所在位置,这是原文第二个坑; \cd 后面的文件夹路径
\set mimic_data_dir 'C:/mimiciii'

# 开始导入csv所有数据,耗时慢
\i C:/mimicbuild/postgres_load_data.sql

# 设置索引
\i C:/mimicbuild/postgres_add_indexes.sql

# 检查数据完整性
\i C:/mimicbuild/postgres_checks.sql

最后运行完checks,看到下面这个验证全部通过即表明建库成功。

在这里插入图片描述

至此建库完毕。辛苦我这破旧的老电脑,花了几个小时才完成。

下面就可以开始数据挖掘了。

文章首发于微信公众号:颗粒神经元。欢迎关注。

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值