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原创 emacs org初学者指南

昨天在群里,听kid讲解了一下org,感觉还不错,所以写在这里,希望更多的人能能知道,并且因而受益。废话不多说,直接上整理后的笔记。how to learn emacs orgTable of Contents1 前言1.1 怎么打开1.2 怎么保存1.3 怎么安装1.4 不用.org的格式2 写文档的大纲结构2.1 星号后要有空格才

2013-01-30 19:17:52 3608

原创 emacs的自动保存功能

今天下午用Emacs不巧正好卡了,不知道怎么办了。搜了下面一片文章,写的不错,所以转过来,大家分享一下:http://blog.csdn.net/zhaoxiatengkong_1/article/details/8244988特此表示感谢!*文件名:备份(backup)文件;#文件名#:自动保存(autosave)文件。使用emacs编辑head.c时产生的#head

2013-01-29 19:01:37 3834

原创 fedor安装w3m,并在emacs下使用,以及w3m的快捷键

网上的方法好像大多是不针对Fedora,所以简单的说一下。安装命令:yum install w3m-img -y然后安装:dudo yum install emacs-w3m具体的使用网上有很多的资料,大家自己去查一下。进入emacs后,alt+x w3m 就可以进入了三:emacs-w3m快捷键操作下面是一些常用的快捷键1:基本操作

2013-01-28 20:00:06 1221

原创 Emacs学习,配置篇

mark一下首先有个配置的问题,配置之前还要安装git,这个过程很是纠结,让初学者无所是从。我这里把我主要参考学习的文章,放在这里,为以后的配置积累自己的经验。一年成为Emacs高手(像神一样使用编辑器)首先,看了这篇文章,知道了很多的东西,然后就想着把其中所说的配置 下载下来。首先还要先学习一些git:这里主要看了这个http://roclinux.cn/?p=178一个

2013-01-28 19:56:29 1667 8

原创 vim小技巧总结(mark一下,今天第一个)

今天在使用vim的时候发现了一个一直没有注意的小技巧,当我们要在文本中搜索一个词的时候,我们一般用的是“/”也就是用/来进行查找,但是这里我们把光标放在我们要查找的单词前面,然后我按*号键,在整个文章中的这个单词都找出来了。大家可以试一试

2013-01-27 11:14:06 1226

原创 perl模板:t检验:ttest的安装与使用

这个模块写的时间是2003年,在window下怎么修改都感觉无法运行。所以转到linux下,linux开始报错,如下:我们来看一下当我们安装这个模块的时候发现他还依赖于其他的两个模块,所以总的思想就是,缺什么补什么,我们把这两个模块下载下来,然后安装了以后,运行程序发现还是有错误,说在某个目录下****.pm没有找到,这时候其实所有的东西在我们的电脑都已经齐全了,只不过这个模块太早的原因(

2013-01-22 10:05:39 3292

原创 perl模板的应用:随机排序:随机不放回取样

有时候我们可能需要随机的将一些的数字或者其他的元素进行随机的抽取,或者随机的排序,这里他们的本质是一样的。或者随机的排序我们也可以看作是不放回的随机取样。因为我们随机排序的每一个元素的顺序都是随机的。相当于每一个元素都是模拟的随机抽取。大家可能在科研的过程中用到。这里从百度知道里可以搜索到答案,这里稍作整理,以便后来的应用。程序内容如下,大家根据需要自己修改,用到的是perl的List::

2013-01-21 21:43:13 3943 2

原创 用vim diff进行两个文件的比较

我们知道可以用total commander来进行两个文件的比较,这是非常方便的,但是如果linux下没有TC应该怎么办呢?万能的vim也有的它的解决方案,今天恰好用到了,就从别人那里拿过来,mark一下,方便以后的回顾和使用。http://www.iflym.com/index.php/linux-develop/201110220002.html如果你工作在linux,

2013-01-19 22:15:49 4161

原创 写程序,做任务,写笔记的学问

有人可能会说,好的程序本身就是注释。有的人喜欢把笔记记到自己的笔记本上!但是,经过很长时间以后,是看一遍程序更容易懂,还是看看自己写的注释更容易懂。经过一年以后,你还能把你写的程序对应到你的笔记本上吗?如果一年可以,那么两年呢?所以最好的笔记,是和你的程序任务,毫无缝隙的绑到一块,看到程序,就能看到你的注释!只有这样才能更好的利用你的程序,重现你当时的思

2013-01-18 21:33:43 1062

原创 Unix&Linux大学教程,阅读mark

从今天开始翻看了这本书,在这里mark一下。以后顺便把学习到的东西记录到这里,以此来提醒自己!!第四章:开始使用Unixdata:显示时间和日期whoami:显示你的用户标识who:显示所有当前登录系统的用户标识w:谁在登录系统,并告诉你他们在干什么loginlogout:注销(有可能需要exit)exit:注销passwd:改变口令,也就是登陆

2013-01-15 19:56:52 1123

原创 excel统计选取行数的若干方法

当你经过排序以后,用鼠标选取了若干行,怎么知道一共选取了多少行呢?最简单的办法:当你用鼠标选中区域而尚未松开左键时,名称框中R字母前的数值就是所选区域行数,C字母前数值就是所选区域列数。松开左键,该数值消失,只显示区域中左键第1个按下(即选区中唯一泛白)的单元格地址。显示位置在:大家可以自己试一试。当行数增多时,在鼠标的右下角!!然后office的新版本里都有筛

2013-01-14 17:30:00 7776

原创 一个R程序,表达差异基因:探针分析

library(RankProd)#打开这个库TanZhen <- read.table("f:/r/L2_9311_LYP9/L2_9311_LYP9_1.txt",header=FALSE)#读入数据,这个数据要处理以后的,用read.csv读入以后是错误的#attach(TanZhen)#挂载数据#detach(TanZhen)#不用了将其挂起。#head(TanZhen)#nam

2013-01-11 10:32:17 3815

原创 blastall的使用方法,以及输出文件的格式记录

用blastall进行序列比对    blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大,其下面有非常多的参数,但是一般使用的参数如:-p、-i、-d、-o、-e等几个。-p: 执行的程序名称-d: 搜索的数据库名称-i : 要查询的序列文件名(Query File)-e:(数学)期望值(Expectation value),E值是

2013-01-07 17:29:11 13565

原创 vim-r-plugin ::帮助文档的翻译和应用,帮助文档,常看常新,你遇到的问题,别人都想到了

1. Overview                                    |r-plugin-overview| 2. Main features                               |r-plugin-features| 3. Installation                                |r-plugin-insta

2013-01-06 10:12:19 5865

原创 Linux/Unix下安装Perl模块有两种方法

摘自华夏35度http://www.cnblogs.com/zhangchaoyang/articles/2610573.htmlLinux/Unix下安装Perl模块有两种方法:手工安装和自动安装。第一种方法是从CPAN上下载  您需要的模块,手工编译、安装。第二种方法是联上internet,使用一个叫做CPAN的模块自动完  成下载、编译、安装的全过程。

2013-01-04 16:33:37 1328

原创 R从文件中读取数据,输出文件

看了几天的书,终于到这一步了,说实话,用R来做统计,很少有人手动的去输入那些数字,肯定是从别的地方导入的,我们用来处理就可以了,所以到这里才算是真正的入门,前面都是做基础的练手。我学习R从《R语言与统计分析》入手,第一个例子,从书上的例子,入手,为大家能够快速入门。在F盘下有个r文件夹,里面有个foo.txt的文件,文件的内容如下:treat   weightA

2013-01-03 16:35:21 11040

原创 vim编辑R代码的实现:::(R语言安装BIoconductor和BiocLite):R在linux的安装

在window下的安装很容易,大家都会,在linux下,如果手动编译安装还是有些麻烦的,特别是当报错的时候,还要找到报错的根源,所以我们安装的时候,如果有网络我们可以直接用命令,sudo yum install R就可以了,当然要你先获取最高权限,输入 密码。我们也可以用vim来编辑R代码,我们来看一下实现的形式。这里主要用的是一个vim的插件:http://www

2013-01-03 10:24:46 8112

perl-support模块修改\ii\io

perl-support 模版修改,\io \ii

2013-05-12

TeXmacs-chinese-fonts.tar.gz

输入中文的地方需要设置格式 如果全文是中文文档,可以选择菜单栏:Document->Language->Chinese 如果是部分文本需要设为中文,选择菜单栏:Format->Language->Chinese (也许不需要设置语言?例如, 最近版本, v1.0.7.19 在Ubuntu 12.10上,只要直接设置 Format -> Name -> CJK -> MicroHei 即可。) Trouble shooting: 官方的texmacs源版本依然比较旧,支持中文输入会有问题 而在Ubuntu上和Archlinux上的经验来看,最新的版本 v1.0.7.17 是没有问题的(v1.0.7.16都会存在问题)。而最新的版本需要源代码编译安装(可以在gitorious下载最新的.tar.gz包并解压缩)。 如果你看到的Chinese菜单项处于灰色不可用状态,说明没有安装TeXmacs没有找到合适的字体。 简单的解决办法是,下载fireflysung字体: http://www.study-area.org/apt/firefly-font/fireflysung-1.3.0.tar.gz 解压缩后,将其中的.ttf文件复制到 ~/.TeXmacs/fonts/truetype 目录下 之后命令行执行 texmacs --delete-font-cache 再次打开TeXmacs后,就应该看到菜单项已变为可用。

2013-04-28

GenomeAnalysisTK-2.2-15.tar.bz2

GATK的官方软件,因为要注册,所以放在这里,供大家下载使用!

2012-12-04

基因拼装软件stampy

序列拼装的经典软件,在linux下运行。

2012-11-26

U盘批量恢复

一个U盘文件的恢复程序,就这些功能了 以后再补充

2012-10-16

空空如也

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