SUNDIALS 开源项目教程
项目介绍
SUNDIALS(SUite of Nonlinear and DIfferential/ALgebraic Equation Solvers)是由 Lawrence Livermore National Laboratory 开发的一套用于求解非线性方程和微分/代数方程的求解器集合。该项目包含多个包,如 CVODE、CVODES、ARKODE 等,广泛应用于科学计算和工程领域。
项目快速启动
安装
首先,克隆项目仓库到本地:
git clone https://github.com/LLNL/sundials.git
进入项目目录并进行编译安装:
cd sundials
mkdir build
cd build
cmake ..
make
sudo make install
示例代码
以下是一个简单的 CVODE 示例代码,用于求解一个简单的 ODE 系统:
#include <cvode/cvode.h> // CVODE 头文件
#include <nvector/nvector_serial.h> // 本地向量头文件
#include <sunmatrix/sunmatrix_dense.h> // 密集矩阵头文件
#include <sunlinsol/sunlinsol_dense.h> // 密集线性求解器头文件
#include <sundials/sundials_types.h> // 类型定义头文件
// 定义 ODE 系统
static int f(realtype t, N_Vector y, N_Vector ydot, void *user_data) {
realtype *ydata = N_VGetArrayPointer(y);
realtype *ydotdata = N_VGetArrayPointer(ydot);
ydotdata[0] = -0.04 * ydata[0] + 1.0e4 * ydata[1] * ydata[2];
ydotdata[1] = 0.04 * ydata[0] - 1.0e4 * ydata[1] * ydata[2] - 3.0e7 * ydata[1] * ydata[1];
ydotdata[2] = 3.0e7 * ydata[1] * ydata[1];
return 0;
}
int main() {
// 初始化变量
realtype t0 = 0.0;
realtype t1 = 0.4;
realtype reltol = 1.0e-4;
realtype abstol = 1.0e-8;
N_Vector y = N_VNew_Serial(3);
realtype *ydata = N_VGetArrayPointer(y);
ydata[0] = 1.0;
ydata[1] = 0.0;
ydata[2] = 0.0;
// 创建 CVODE 求解器
void *cvode_mem = CVodeCreate(CV_BDF);
CVodeInit(cvode_mem, f, t0, y);
CVodeSStolerances(cvode_mem, reltol, abstol);
// 设置线性求解器
SUNMatrix A = SUNDenseMatrix(3, 3);
SUNLinearSolver LS = SUNLinSol_Dense(y, A);
CVodeSetLinearSolver(cvode_mem, LS, A);
// 求解 ODE
realtype t = t0;
while (t < t1) {
CVode(cvode_mem, t1, y, &t, CV_NORMAL);
printf("t = %0.2f, y = %0.4e, %0.4e, %0.4e\n", t, ydata[0], ydata[1], ydata[2]);
}
// 释放资源
N_VDestroy(y);
CVodeFree(&cvode_mem);
SUNLinSolFree(LS);
SUNMatDestroy(A);
return 0;
}
应用案例和最佳实践
应用案例
SUNDIALS 在多个领域有广泛应用,例如:
- 气候模型:用于求解复杂的气候变化模型。
- 生物医学工程:用于模拟生物体内的生化反应过程。
- **