探索医疗数据的新维度:DicomToMesh

探索医疗数据的新维度:DicomToMesh

DicomToMeshA command line tool to transform a DICOM volume into a 3d surface mesh (obj, stl or ply). Several mesh processing routines can be enabled, such as mesh reduction, smoothing or cleaning. Works on Linux, OSX and Windows.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/di/DicomToMesh

在医疗成像领域,DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)是广泛使用的标准图像格式。然而,将这些2D切片转化为可供研究和分析的3D模型并非易事。这就是DicomToMesh的角色所在——一个强大的命令行工具,可以轻松地从DICOM图像集构建3D网格,并提供了丰富的后处理选项。

项目简介

DicomToMesh是一个跨平台的工具,支持Linux, macOS和Windows,它能自动将一系列的DICOM图像转换为STL, OBJ或PLY格式的3D网格。借助先进的Marching Cubes算法,你可以从医学扫描中创建出精细的三维表面模型。

dicom2mesh

技术解析

工具的核心在于利用Marching Cubes算法,通过设定阈值(iso-value)来确定哪些体素应该被包括在3D模型内。你可以通过命令行参数-t X定义这个阈值。此外,项目还提供了一系列的后处理功能:

  • 网格简化 (-r):使用指定比例减少多边形数量,降低文件大小,不影响整体结构。
  • 平滑处理 (-s):去除噪声,使3D模型更加平滑。
  • 移除小对象 (-e):移除不感兴趣的小型物体,保持模型整洁。

应用场景

DicomToMesh适用于多种情境:

  • 医学研究:帮助科学家和医生直观地理解复杂的身体结构。
  • 教育培训:创建逼真的解剖模型,辅助学习。
  • 个性化医疗:定制手术规划,如假肢设计或手术模拟。

项目特点

  1. 直观命令行界面:无需图形界面,简单命令即可完成复杂操作。
  2. 可视化功能:通过-v选项查看3D模型,双击表面可获取坐标信息。
  3. 体积渲染 (-vo):显示 DICOM 数据的体积渲染,调整颜色映射以突出关键区域。
  4. 易于安装和自建:提供预编译包(Ubuntu 18.04),或者使用CMake和VTK库进行本地构建。
  5. Docker 支持:快速部署到任何平台,无需本地配置。

要立即体验DicomToMesh的强大功能,请访问项目GitHub页面进行安装和探索。让我们一起开启医学影像数据分析的新旅程!

DicomToMeshA command line tool to transform a DICOM volume into a 3d surface mesh (obj, stl or ply). Several mesh processing routines can be enabled, such as mesh reduction, smoothing or cleaning. Works on Linux, OSX and Windows.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/di/DicomToMesh

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