WSL4MIS 开源项目使用教程

WSL4MIS 开源项目使用教程

WSL4MISScribbles or Points-based weakly-supervised learning for medical image segmentation, a strong baseline, and tutorial for research and application.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ws/WSL4MIS

1. 项目的目录结构及介绍

WSL4MIS 项目的目录结构如下：

WSL4MIS/
├── data/
│   └── ACDC/
├── img/
├── LICENSE
├── README.md
├── code/
│   ├── config/
│   ├── dataset/
│   ├── models/
│   ├── utils/
│   └── main.py
└── scripts/
    ├── preprocess.sh
    ├── train.sh
    └── test.sh

目录结构介绍

• data/: 存放数据集的目录，例如 ACDC 数据集。
• img/: 存放项目相关的图像文件。
• LICENSE: 项目的许可证文件。
• README.md: 项目说明文档。
• code/: 核心代码目录，包含以下子目录和文件：
  • config/: 配置文件目录。
  • dataset/: 数据集处理相关代码。
  • models/: 模型定义相关代码。
  • utils/: 工具函数和辅助代码。
  • main.py: 项目的主启动文件。
• scripts/: 包含预处理、训练和测试的脚本文件。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件是 code/main.py。这个文件负责初始化配置、加载数据、构建模型、执行训练和测试等任务。以下是 main.py 的主要功能模块：

import config
import dataset
import models
import utils

def main():
    # 加载配置
    cfg = config.load_config()
    
    # 加载数据集
    train_loader, val_loader = dataset.load_data(cfg)
    
    # 构建模型
    model = models.build_model(cfg)
    
    # 训练模型
    utils.train(model, train_loader, val_loader, cfg)
    
    # 测试模型
    utils.test(model, val_loader, cfg)

if __name__ == "__main__":
    main()

启动文件功能介绍

• config.load_config(): 加载配置文件，获取项目的运行参数。
• dataset.load_data(cfg): 根据配置加载训练和验证数据集。
• models.build_model(cfg): 根据配置构建模型。
• utils.train(model, train_loader, val_loader, cfg): 执行模型训练。
• utils.test(model, val_loader, cfg): 执行模型测试。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置文件存放在 code/config/ 目录下。配置文件通常是一个 YAML 或 JSON 文件，用于定义项目的各种参数，如数据路径、模型参数、训练参数等。

配置文件示例

data:
  path: "data/ACDC"
  batch_size: 8
  num_workers: 4

model:
  name: "UNet"
  input_channels: 1
  output_channels: 4

train:
  epochs: 100
  lr: 0.001
  weight_decay: 0.0001

test:
  save_path: "results"

配置文件参数介绍

• data: 数据相关配置，包括数据路径、批量大小和数据加载的线程数。
• model: 模型相关配置，包括模型名称、输入通道数和输出通道数。
• train: 训练相关配置，包括训练轮数、学习率和权重衰减。
• test: 测试相关配置，包括测试结果保存路径。

通过以上配置文件，可以灵活地调整项目的运行参数，以适应不同的实验需求。

WSL4MISScribbles or Points-based weakly-supervised learning for medical image segmentation, a strong baseline, and tutorial for research and application.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ws/WSL4MIS