mOTUs 开源项目使用教程

mOTUs 开源项目使用教程

mOTUsmotus - a tool for marker gene-based OTU (mOTU) profiling项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/mo/mOTUs

1. 项目的目录结构及介绍

mOTUs 项目的目录结构如下：

mOTUs/
├── bin/
│   ├── motus
│   └── ...
├── config/
│   ├── config.yaml
│   └── ...
├── data/
│   ├── example_data.fasta
│   └── ...
├── docs/
│   ├── README.md
│   └── ...
├── src/
│   ├── main.py
│   └── ...
├── tests/
│   ├── test_main.py
│   └── ...
├── .gitignore
├── LICENSE
├── README.md
└── requirements.txt

目录介绍：

• bin/: 包含可执行文件，如 motus。
• config/: 包含配置文件，如 config.yaml。
• data/: 包含示例数据文件，如 example_data.fasta。
• docs/: 包含项目文档，如 README.md。
• src/: 包含源代码文件，如 main.py。
• tests/: 包含测试文件，如 test_main.py。
• .gitignore: Git 忽略文件。
• LICENSE: 项目许可证。
• README.md: 项目说明文档。
• requirements.txt: 项目依赖文件。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件位于 bin/ 目录下，主要文件是 motus。该文件是一个可执行脚本，用于启动 mOTUs 工具。

启动文件介绍：

• motus: 主启动脚本，用于执行 mOTUs 工具的主要功能。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置文件位于 config/ 目录下，主要文件是 config.yaml。该文件包含了 mOTUs 工具的配置选项。

配置文件介绍：

• config.yaml: 主配置文件，包含各种配置选项，如数据库路径、输出路径等。

database_path: /path/to/database
output_path: /path/to/output
threads: 4

以上是 mOTUs 开源项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这份教程能帮助你更好地理解和使用 mOTUs 工具。

mOTUsmotus - a tool for marker gene-based OTU (mOTU) profiling项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/mo/mOTUs