NiftyReg 项目教程

NiftyReg 项目教程

niftyregThis project contains command line tools to perform rigid, affine and non-linear registration of nifti or analyse images as well as utilities项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ni/niftyreg

1. 项目目录结构及介绍

NiftyReg 项目的目录结构如下：

niftyreg/
├── github/workflows/
├── cmake/
├── logo/
├── reg-apps/
├── reg-io/
├── reg-lib/
├── reg-test/
├── third-party/
├── .gitignore
├── CMakeLists.txt
├── Doxyfile.in
├── LICENSE.txt
├── README.md
├── niftyreg_build_version.txt
└── update_version_hook

目录介绍

• github/workflows/: 包含 GitHub Actions 的工作流配置文件。
• cmake/: 包含 CMake 构建系统的相关文件。
• logo/: 包含项目的 Logo 文件。
• reg-apps/: 包含用于执行刚性、仿射和非线性配准的命令行工具。
• reg-io/: 包含用于读取和写入 Nifti 和 Analyze 格式图像的工具。
• reg-lib/: 包含配准算法的核心库文件。
• reg-test/: 包含测试代码和测试数据。
• third-party/: 包含第三方依赖库。
• .gitignore: Git 忽略文件配置。
• CMakeLists.txt: CMake 构建系统的根配置文件。
• Doxyfile.in: Doxygen 文档生成器的配置文件。
• LICENSE.txt: 项目的许可证文件。
• README.md: 项目的介绍和使用说明。
• niftyreg_build_version.txt: 构建版本信息文件。
• update_version_hook: 版本更新钩子文件。

2. 项目启动文件介绍

NiftyReg 项目的主要启动文件位于 reg-apps/ 目录下，包括以下几个关键文件：

• reg_aladin: 用于执行刚性和仿射配准的命令行工具。
• reg_f3d: 用于执行非线性配准的命令行工具。
• reg_resample: 用于应用配准变换、生成变形场或雅可比映射图像的工具。

这些文件是 NiftyReg 项目的主要入口点，用户可以通过命令行调用这些工具来执行图像配准任务。

3. 项目配置文件介绍

NiftyReg 项目的配置文件主要包括以下几个：

• CMakeLists.txt: 这是 CMake 构建系统的根配置文件，定义了项目的构建规则和依赖关系。
• Doxyfile.in: 这是 Doxygen 文档生成器的配置文件，用于生成项目的 API 文档。
• niftyreg_build_version.txt: 这个文件包含了项目的构建版本信息，通常由构建系统自动生成。

这些配置文件定义了项目的构建和文档生成规则，用户可以根据需要修改这些文件来定制项目的构建和文档生成过程。

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以上是 NiftyReg 项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这份教程能帮助你更好地理解和使用 NiftyReg 项目。

niftyregThis project contains command line tools to perform rigid, affine and non-linear registration of nifti or analyse images as well as utilities项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ni/niftyreg