AWS Batch 基因组分析项目教程
1. 项目的目录结构及介绍
aws-batch-genomics/
├── pipeline/
│ ├── tools/
│ └── ...
├── .gitignore
├── LICENSE
├── README.md
├── setup.sh
├── teardown.sh
├── template_cfn.yml
└── update.sh
- pipeline/: 包含项目的主要工具和脚本。
- .gitignore: 指定Git版本控制系统忽略的文件和目录。
- LICENSE: 项目的许可证文件。
- README.md: 项目的基本介绍和使用说明。
- setup.sh: 用于启动项目的脚本。
- teardown.sh: 用于关闭项目的脚本。
- template_cfn.yml: 项目的CloudFormation模板文件。
- update.sh: 用于更新项目的脚本。
2. 项目的启动文件介绍
setup.sh
setup.sh
是一个用于启动项目的脚本。它负责配置和部署项目所需的AWS资源。具体步骤包括:
- 配置AWS Batch环境。
- 部署CloudFormation模板。
- 初始化项目所需的资源。
使用方法:
./setup.sh
3. 项目的配置文件介绍
template_cfn.yml
template_cfn.yml
是一个CloudFormation模板文件,用于定义和配置AWS资源。它包含以下主要部分:
- Resources: 定义了AWS Batch、S3存储桶、IAM角色等资源。
- Parameters: 定义了模板的可配置参数,如环境名称、实例类型等。
- Outputs: 定义了模板输出的值,如Batch作业队列的ARN。
使用方法:
aws cloudformation deploy --template-file template_cfn.yml --stack-name my-genomics-stack --capabilities CAPABILITY_NAMED_IAM
通过以上步骤,您可以成功启动和配置AWS Batch基因组分析项目。