GTEx & TOPMed 数据生产与分析管道项目教程

GTEx & TOPMed 数据生产与分析管道项目教程

gtex-pipelineGTEx & TOPMed data production and analysis pipelines项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/gt/gtex-pipeline

1. 项目的目录结构及介绍

gtex-pipeline/
├── gene_model/
├── genotype/
├── phASER/
├── qtl/
├── rnaseq/
├── .gitignore
├── LICENSE.txt
├── README.md
├── TOPMed_RNAseq_pipeline.md

• gene_model/: 包含基因模型的相关文件。
• genotype/: 包含基因型的相关文件。
• phASER/: 包含phASER分析的相关文件。
• qtl/: 包含数量性状位点（QTL）分析的相关文件。
• rnaseq/: 包含RNA-seq分析的相关文件。
• .gitignore: Git忽略文件。
• LICENSE.txt: 项目许可证文件。
• README.md: 项目介绍和使用说明。
• TOPMed_RNAseq_pipeline.md: TOPMed RNA-seq管道详细描述。

2. 项目的启动文件介绍

项目中没有明确的“启动文件”，但主要的执行脚本和配置文件通常位于各个子目录中。例如，rnaseq/目录中可能包含用于RNA-seq分析的启动脚本。

3. 项目的配置文件介绍

项目中没有明确的“配置文件”，但每个子目录中可能包含用于特定分析任务的配置文件。例如，rnaseq/目录中可能包含用于RNA-seq分析的配置文件。

具体的配置文件和启动脚本需要根据实际需求和文档中的说明进行查找和使用。

gtex-pipelineGTEx & TOPMed data production and analysis pipelines项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/gt/gtex-pipeline