开源项目教程:curated_resources

开源项目教程:curated_resources

curated_resources:books: Curated lists for programming, books, movies, music, games, etc项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/cu/curated_resources

项目介绍

curated_resources 是一个收集和整理各种编程语言、工具和框架相关资源的仓库。该项目旨在为开发者提供一个便捷的方式来查找和学习各种技术资源,包括教程、文档、示例代码等。通过这个项目,开发者可以快速找到他们需要的学习材料,从而提高学习和开发的效率。

项目快速启动

要开始使用 curated_resources 项目,首先需要克隆仓库到本地:

git clone https://github.com/learnbyexample/curated_resources.git

克隆完成后,进入项目目录:

cd curated_resources

接下来,你可以浏览各个目录下的资源文件,例如:

cat Python/resources.md

这将显示 Python 相关的资源列表。你可以根据需要选择合适的资源进行学习。

应用案例和最佳实践

应用案例

假设你是一名 Python 开发者,想要学习 Django 框架。你可以通过 curated_resources 项目找到 Django 相关的教程和文档:

  1. 进入 Python 目录。
  2. 打开 Django/resources.md 文件。
  3. 根据提供的链接和资源进行学习。

最佳实践

  • 定期更新资源:由于技术不断更新,建议定期检查和更新 curated_resources 项目中的资源链接,确保信息的时效性和准确性。
  • 贡献资源:如果你发现某个领域的资源不足,可以考虑贡献自己的资源链接,帮助其他开发者。

典型生态项目

curated_resources 项目本身是一个资源集合,但它可以与其他开源项目结合使用,形成更强大的生态系统。以下是一些典型的生态项目:

  • learnbyexample:这是一个专注于编程学习的开源组织,提供了大量的编程教程和示例代码。
  • Awesome Lists:这是一个收集各种 Awesome 列表的项目,涵盖了从编程语言到开发工具的各个方面。

通过结合这些生态项目,开发者可以构建一个更全面的学习和开发环境。

curated_resources:books: Curated lists for programming, books, movies, music, games, etc项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/cu/curated_resources

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详细逐步解释下列代码:import os.path import re import yaml import csv from tasly import builder_utils ############################ # IntAct - MutationDs # ############################ def parser(databases_directory, download=True): relationships = set() # 加载yml文件 with open('./yml/mutationDsConfig.yml', 'r') as f: config = yaml.safe_load(f) header = config['header'] output_file_name = "mutation_curated_affects_interaction_with.csv" regex = r":(\w+)\(" url = config['mutations_url'] directory = os.path.join(databases_directory, "MutationDs") builder_utils.checkDirectory(directory) file_name = os.path.join(directory, url.split('/')[-1]) if download: builder_utils.downloadDB(url, directory) with open(file_name, 'r', encoding='utf-8') as mf: first = True for line in mf: if first: first = False continue data = line.rstrip("\r\n").split("\t") if len(data) > 12: internal_id = data[0] pvariant= '_'.join(data[1].split(':')) effect = data[5] organism = data[10] interaction = data[11] evidence = data[12] if organism.startswith("9606"): matches = re.finditer(regex, interaction) for matchNum, match in enumerate(matches, start=1): interactor = match.group(1) relationships.add((pvariant, interactor, "CURATED_AFFECTS_INTERACTION_WITH", effect, interaction, evidence, internal_id, "Intact-MutationDs")) # builder_utils.remove_directory(directory) return (relationships, header, output_file_name) if __name__ == '__main__': databases_directory = './databases' relationships, header, output_file_name = parser(databases_directory, download=True) # 新建CSV文件并写入表头 with open(os.path.join('./databases/MutationDs', output_file_name), 'w', newline='', encoding='utf-8') as f: writer = csv.writer(f) writer.writerow(header) for item in relationships: writer.writerow(item) print("Data saved to {} successfully!".format('entities.csv'))
05-31
这段代码的作用是解析一个特定的文件,并将其中的数据存储到一个 CSV 文件中。现在我将逐步解释代码: ``` import os.path import re import yaml import csv from tasly import builder_utils ``` 这段代码导入了四个 Python 模块 `os.path`, `re`, `yaml`, `csv`,以及一个自定义模块 `builder_utils`。 ``` def parser(databases_directory, download=True): relationships = set() # 加载yml文件 with open('./yml/mutationDsConfig.yml', 'r') as f: config = yaml.safe_load(f) header = config['header'] output_file_name = "mutation_curated_affects_interaction_with.csv" regex = r":(\w+)\(" url = config['mutations_url'] directory = os.path.join(databases_directory, "MutationDs") builder_utils.checkDirectory(directory) file_name = os.path.join(directory, url.split('/')[-1]) if download: builder_utils.downloadDB(url, directory) with open(file_name, 'r', encoding='utf-8') as mf: first = True for line in mf: if first: first = False continue data = line.rstrip("\r\n").split("\t") if len(data) > 12: internal_id = data[0] pvariant= '_'.join(data[1].split(':')) effect = data[5] organism = data[10] interaction = data[11] evidence = data[12] if organism.startswith("9606"): matches = re.finditer(regex, interaction) for matchNum, match in enumerate(matches, start=1): interactor = match.group(1) relationships.add((pvariant, interactor, "CURATED_AFFECTS_INTERACTION_WITH", effect, interaction, evidence, internal_id, "Intact-MutationDs")) # builder_utils.remove_directory(directory) return (relationships, header, output_file_name) ``` 这段代码定义了一个名为 `parser` 的函数,它接受一个参数 `databases_directory` 和一个可选参数 `download`,默认值为 `True`。该函数首先加载一个名为 `mutationDsConfig.yml` 的 YAML 文件,该文件包含一些配置信息,如 `header`、`mutations_url` 等。然后,函数使用 `os.path` 模块来构建一个目录名,该目录名为 `databases_directory` 加上 `MutationDs`。接着,函数使用 `builder_utils` 模块提供的 `checkDirectory` 函数检查该目录是否存在,如果不存在则创建该目录。然后,函数使用 `builder_utils` 模块提供的 `downloadDB` 函数下载一个名为 `mutations.tsv` 的文件,该文件存储了一些基因突变相关的数据。函数接着打开该文件,并读取其中的数据。函数使用 `re` 模块中的 `finditer` 函数找到所有匹配特定正则表达式的子字符串,然后将匹配的结果存储到一个名为 `relationships` 的集合中。最后,函数返回三个值:`relationships`、`header` 和 `output_file_name`。 ``` if __name__ == '__main__': databases_directory = './databases' relationships, header, output_file_name = parser(databases_directory, download=True) # 新建CSV文件并写入表头 with open(os.path.join('./databases/MutationDs', output_file_name), 'w', newline='', encoding='utf-8') as f: writer = csv.writer(f) writer.writerow(header) for item in relationships: writer.writerow(item) print("Data saved to {} successfully!".format('entities.csv')) ``` 这段代码检查当前模块是否为主模块,如果是,则执行下面的代码。首先,它定义了一个名为 `databases_directory` 的变量,该变量指定了存储数据的目录。然后,它调用 `parser` 函数,将 `databases_directory` 和 `download=True` 作为参数传递给该函数。函数返回三个值,这些值被分别赋值给三个变量 `relationships`、`header` 和 `output_file_name`。接着,代码使用 `csv` 模块创建一个新的 CSV 文件,并将 `header` 写入该文件。最后,代码遍历 `relationships` 集合中的元素,并将每个元素写入 CSV 文件中。
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