<?xml version="1.0" encoding="utf-8" ?><rss version="2.0"><channel><title><![CDATA[good_rrrrr的博客]]></title><description><![CDATA[]]></description><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr</link><language>zh-cn</language><generator>https://blog.csdn.net/</generator><copyright><![CDATA[Copyright &copy; good_rrrrr]]></copyright><item><title><![CDATA[从GEO数据库下载转录组数据分析步骤]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161983324</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161983324</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Sun, 14 Jun 2026 19:57:15 +0800</pubDate><description><![CDATA[1.FTP（File Transfer Protocol）：通过FTP 下载数据时，会提供一个 FTP 地址，用户可以通过工具连接到 GEO 的服务器并下载文件。在各大测序数据库中，作者往往不会将自己整理好的数据直接上传，而是放一个raw data。今天分享一个GEO数据库上载录的于2020年发表的人RNA-seq测序数据，并教大家如何处理。小贴士：在GEO 数据库的下载栏中，FTP 和 HTTP 是两种用于下载数据的协议。3.custom和http是一种下载格式，只是custom支持单样本数据下载。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[国自然热点 诺奖前沿：相分离三大技术（b‑isox / TurboID / Hi‑MS）一次讲透]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161983310</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161983310</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Sun, 14 Jun 2026 19:54:47 +0800</pubDate><description><![CDATA[相分离蛋白往往包含内在无序区（IDR）、低复杂度序列（LCS），并携带多价结构域，能够建立多点弱相互作用（如静电作用、π-π堆积、氢键、疏水作用）。因此，如何高效、准确地富集和鉴定参与相分离的蛋白，成为当前研究的焦点。裂解细胞保留凝聚体；将TurboID与目标蛋白融合表达，在ATP和生物素存在下，TurboID快速标记邻近蛋白的赖氨酸残基，随后用链霉亲和素磁珠富集生物素化蛋白进行质谱分析。将这些方法与蛋白质组学联用，可系统鉴定细胞中的相分离蛋白，为揭示相分离的物质基础和调控机制提供有力工具。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[AlphaFold使用方法及可视化操作步骤]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161983260</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161983260</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Sun, 14 Jun 2026 19:50:21 +0800</pubDate><description><![CDATA[（14）需要白色背景的回到PyMol调整白色背景，重新导出。（4）然后复制序列粘贴到AlphaFold，提交任务。（1）打开下载文件，选择最高置信度的对接结果。（3）氨基酸序在UniProt下载，（5）重复操作，找到另一个蛋白质序列。（7）介绍一下PyMol的快捷操作。（2）接文件拖入PyMol软件。（8）调整好视角，导出3D结果。（9）去除3D，开始模拟对接。（6）更改文件名字方便管理。（6）转换成3D对接结构。（3）对一条链进行命名。（12）展示氨基酸位点。（2）选择添加蛋白质。（10）计算对接位点。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[投稿被秒拒？别再拿Cover Letter当“形式主义”！]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161983242</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161983242</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Sun, 14 Jun 2026 19:49:03 +0800</pubDate><description><![CDATA[在冲击SCI及《Nature》《Science》《Cell》等顶级期刊的征途中，许多研究者往往将全部心血倾注于打磨论文正文，却对Cover Letter（投稿信）草草了事。这是一个致命的认知误区。事实上，Cover Letter绝非可有可无的“形式附件”，而是决定稿件生死的“第一道关卡”。对于日理万机的期刊编辑而言，Cover Letter是他们快速判断稿件价值的窗口。一封平庸、敷衍的投稿信，足以让一篇实验扎实、创新充足的优质稿件惨遭“秒拒”（Desk Reject）。反之，一封精准、专业的Cover Le]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[蛋白互作界面残基太多不会挑？教你一步步筛出真正关键的结合位点]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161983237</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161983237</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Sun, 14 Jun 2026 19:48:06 +0800</pubDate><description><![CDATA[在做蛋白–蛋白互作（PPI）研究时，一个非常常见、但也很容易让人犯难的环节是：结构域找到了、对接也做了、分子动力学（MD）也跑了，界面上一口气跳出几十个氨基酸——ARG、LYS、ASP、GLU、TYR……看着都很重要。这时候常见的两种做法其实都不太理想：一股脑全写进文章里，像报菜单，缺乏重点；随手挑几个“看着顺眼”的讲，又容易被质疑依据不足。真正有价值的分析，不是把所有界面残基都罗列出来，而是。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[JAK-STAT 信号通路详解]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161646197</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161646197</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Wed, 03 Jun 2026 10:14:35 +0800</pubDate><description><![CDATA[被唤醒的 JAK 会互相「磷酸化」（图里写了 Tyrosine phosphorylation），相当于给信号「通电放大」。（STAT1/2/3/4/5A/5B/6）加上磷酸基团，让 STAT 从「休眠态」变成「激活态」（pSTAT）。橙色（肿瘤）：JAK2、STAT4/5A/5B → 突变后会驱动细胞疯狂增殖，诱发癌症（比如骨髓增殖性肿瘤）。：像「清道夫」，给激活的 JAK/STAT 贴「降解标签」，让它们被细胞「清理掉」。：像「橡皮擦」，直接擦掉 STAT 上的磷酸，让它立刻「断电」。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[小鼠脊髓取材实操步骤]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161646160</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161646160</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Wed, 03 Jun 2026 10:13:35 +0800</pubDate><description><![CDATA[脊髓作为神经系统的低级中枢，其功能虽然基础，却至关重要；它不仅构成了高级中枢功能的基础，而且高级中枢的某些功能也需要借助脊髓来实现。（5）剪开脊柱，中心白色的就是脊髓。（4）减去不需要的皮肤和肌肉。（7）取出的脊髓如图所示。（6）用镊子取出脊髓。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[核 DNA 不再被“封印”：Cell 发现细胞可通过纳米管把整段染色体送给邻居]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161646095</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161646095</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Wed, 03 Jun 2026 10:12:07 +0800</pubDate><description><![CDATA[一篇颠覆教科书认知的论文刚刚登上《细胞》——科学家首次证实，人类细胞之间可以直接传递完整的核DNA片段，并且这些“外来基因”能在受体细胞中稳定留存、正常表达，甚至赋予细胞全新的可遗传特性（比如耐药性）。这一发现，无异于在哺乳动物细胞中找到了类似细菌“水平基因转移”的隐秘通道。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[小鼠脑切片HE图解析：从矢状面到冠状面]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161646062</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161646062</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Wed, 03 Jun 2026 10:11:14 +0800</pubDate><description><![CDATA[11（中脑）、9（脑桥）、8（延髓）、10（脊髓）组成生命活动的基本中枢；：1（皮质）、9（纹状体）、2（胼胝体）、5（侧脑室）、3（海马体）延续了前一张切片的布局，8（丘脑）仍清晰可见。：3（第三脑室）、4（丘脑）、5（下丘脑）、19（视前区）、16（垂体）构成了信息中继和内分泌调控的核心枢纽。：6（中脑）、7（脑桥）是脑干的关键节段，4（小脑）的叶片状结构十分醒目，三者共同调控运动、平衡与觉醒。：1（皮质）覆盖全脑表面，7（胼胝体）在中线处连接左右半球，8（侧脑室）是脑脊液循环的主要腔室。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[如何用GTEx Portal分析SNP]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161645877</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161645877</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Wed, 03 Jun 2026 10:07:15 +0800</pubDate><description><![CDATA[GWAS 正是通过扫描全基因组范围内的 SNP，寻找那些在病例组中频率显著高于或低于对照组的位点，进而推断这些 SNP 或其邻近区域可能参与了疾病的发生或性状的形成。可以说，没有 SNP，就没有现代意义上的 GWAS；GWAS（Genome-Wide Association Study，全基因组关联分析）是一种无假设驱动的研究方法，旨在通过比较大量病例组（患病个体）和对照组（健康个体）的全基因组 SNP 数据，系统性地识别与特定表型（如疾病、身高、药物反应等）显著相关的遗传变异。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[结肠“瑞士卷”制片法]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161361075</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161361075</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Sun, 24 May 2026 11:10:37 +0800</pubDate><description><![CDATA[在肠道病理研究中，如何完整保留小鼠结肠的全层结构、同时避免人为损伤，一直是实验操作的难点。本文分享一套改良版“瑞士卷”制片技术，无需剖开肠管、无需机械顶压，即可获得高质量的全结肠切片，特别适合炎症、隐窝异常等病变的连续观察。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[Masson染色原理、步骤、判读及常见问题]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161361053</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161361053</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Sun, 24 May 2026 11:09:42 +0800</pubDate><description><![CDATA[将石蜡切片依次浸入二甲苯Ⅰ（20 min）→ 二甲苯Ⅱ（20 min）→ 无水乙醇Ⅰ（10 min）→ 无水乙醇Ⅱ（10 min）→ 95%酒精（5 min）→ 90%酒精（5 min）→ 80%酒精（5 min）→ 70%酒精（5 min）→ 蒸馏水洗。：依次置入95%酒精Ⅰ（5 min）→ 95%酒精Ⅱ（5 min）→ 无水乙醇Ⅰ（5 min）→ 无水乙醇Ⅱ（5 min）→ 二甲苯Ⅰ（5 min）→ 二甲苯Ⅱ（5 min）；：用于后期酸化固定，强化各组织成分的色彩对比度，避免染色模糊、串色问题。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[帕金森病脑内aSyn，竟搭着免疫细胞快车直抵肠道]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161312033</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161312033</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Fri, 22 May 2026 12:30:13 +0800</pubDate><description><![CDATA[α- 突触核蛋白异常堆积是帕金森病标志性病理改变，长久以来业内普遍认定，该致病蛋白主要依托迷走神经通路，在大脑与肠道间来回传递。而一篇刊发于《Nature Communications》的前沿研究，推翻了这一传统观点，证实CD11c 阳性免疫细胞能够直接搭载病理性 α- 突触核蛋白，将其从脑组织定向输送至回肠部位，进而诱发肠道炎症、消化功能失常，为解析帕金森病脑肠联动病变开辟全新方向。临床中帕金森患者常出现便秘、排便失调等肠胃不适，这类症状往往早于肢体震颤、行动迟缓等运动障碍显现。病理检测也发现，致病的 α]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[别再“拍脑袋”定药浓：IC₅₀ 浓度梯度设计的实用思路]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161311919</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161311919</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Fri, 22 May 2026 12:25:15 +0800</pubDate><description><![CDATA[IC₅₀ 实验看似套路，实则处处是坑。与其凭感觉随手加药，不如花两轮预实验，把浓度区间摸清、把有效窗口找准。毕竟，药不是加得越多越好，而是加得刚刚好才最有说服力。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[巨噬细胞M1型与M2型的差异]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161311877</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161311877</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Fri, 22 May 2026 12:24:16 +0800</pubDate><description><![CDATA[M1型巨噬细胞主要由干扰素-γ（IFN-γ）、肿瘤坏死因子-α（TNF-α）及脂多糖（LPS）等促炎信号诱导。M1型是强效的促炎效应细胞，大量分泌IL-1β、TNF-α、IL-6等炎症介质，通过释放ROS和NO直接杀伤病原体及肿瘤细胞，并推动Th1型免疫应答。M2型则表现为免疫抑制与抗炎特性，主要分泌IL-10、TGF-β等抑炎因子，倾向于诱导Th2型反应，通过吞噬作用限制炎症扩散。巨噬细胞具有高度的功能可塑性，依据微环境信号的不同，可极化为功能迥异的M1型（经典活化）与M2型（替代活化）两大表型。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[如何从知网引用参考文献]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161311818</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161311818</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Fri, 22 May 2026 12:23:10 +0800</pubDate><description><![CDATA[（4）下载的文件用EndNote打开，并引用至Word中。（2）找到需要引用的参考文献，选择引用格式。（1）打开知网，搜索文献。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[基因鉴定步骤及常见问题]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161311761</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161311761</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Fri, 22 May 2026 12:21:48 +0800</pubDate><description><![CDATA[请选择适当的引物设计软件进行引物设计，注意引物的 GC 含量、二级结构、二聚体、退火温度、长度、特异性等方面的问题。在加入酶切位点等的引物中，一定要注意加入酶切位点等后整条引物的 GC 含量、二级结构、二聚体、退火温度、长度、特异性等方面的问题。一般情况下，重量约为 15mg 的 1cm 长的小鼠尾尖刚好能浸没在含有 100μl 消化液的 PCR 管中，小鼠尾巴的重量不宜超过 15mg。剪除头发的多余部分，仅需保留头发的根部区域并将其置于上述配制好的 100μl 消化液中，每次提取只需一根带根部的头发。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[港大教授因AI虚假参考文献卸任副院长]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161172510</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161172510</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Sun, 17 May 2026 22:45:39 +0800</pubDate><description><![CDATA[随着生成式AI在学术研究中的普及，越来越多的科研人员开始借助AI工具辅助文献检索、整理与引用，试图提升研究效率，但AI固有的“幻觉”特性，正成为侵蚀学术诚信的隐形杀手。所谓AI“幻觉引文”，并非简单的信息错误，而是AI在缺乏足够权威数据支撑时，基于语义关联“凭空捏造”的虚假引用，这种现象的产生，源于大语言模型的“过度补全”机制——当AI无法检索到精准匹配的文献时，会自动生成看似规范、合理的引用内容，以此满足使用者的需求，却完全无视内容的真实性。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[基质胶（Matrigel）的适用与非适用实验]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161172502</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161172502</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Sun, 17 May 2026 22:44:53 +0800</pubDate><description><![CDATA[基质胶（Matrigel）是一种模拟细胞基底膜及细胞外基质（ECM）成分的培养辅助材料，富含多种与细胞生命活动相关的蛋白质，能构建接近体内环境的三维多孔结构，提供物理支架、生化信号及内源性生长因子，广泛应用于各类细胞培养实验。但并非所有实验都需使用基质胶。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[iPS 细胞帕金森疗法落地日本：治疗费 5530 万日元（237.57万人民币）]]></title><link>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161172487</link><guid>https://blog.csdn.net/good_rrrrr/article/details/161172487</guid><author>good_rrrrr</author><pubDate>Sun, 17 May 2026 22:43:30 +0800</pubDate><description><![CDATA[纳入公共医保，5 月 20 日起正式生效，单人治疗定价为 5530.67 万日元。这也是日本首个获批医保报销的 iPS 细胞再生医疗产品，标志着干细胞治疗从科研走向规模化临床应用的关键一步。2026 年 5 月 13 日，日本中央社会保险医疗委员会正式决议，将全球首款 iPS 细胞来源的帕金森病再生治疗药。这款疗法由日本住友制药联合京都大学高桥淳团队研发，2026 年 3 月已获日本厚生劳动省。，预计今年夏季也将纳入日本医保，共同构成日本 iPS 再生医疗首批落地成果。]]></description><category></category></item></channel></rss>