VASP全家桶示例 | Singularity方案

已于 2022-09-03 21:42:33 修改
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分类专栏： singularity 文章标签： centos ubuntu linux
于 2022-04-26 15:00:49 首次发布
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/hpc4you/article/details/124426759
版权
本文介绍了如何使用Singularity容器优化VASP计算，通过示例展示了使用编译后的版本相比原始版本能显著减少计算时间。提供了下载镜像、简易安装和运行计算的详细步骤，并强调无需配置MPI和编译器。
摘要由CSDN通过智能技术生成

特别声明

要想达到最佳的计算效率, 记得选用合适的参数, 具体可以查阅如下讲座视频. 如果你看了视频, 还是不理解, 可以付费来快速获取解决方案. ​​​​​​​

工作站、小型集群解决方案—让VASP跑的更快

https://www.cailiaoren.com/vinfo.php?show=2&id=216&vid=1938

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VASP从头编译: 系统安装, 系统组件准备, 编译套件安装, vasp源码编译https://www.cailiaoren.com/vinfo.php?show=2&id=11&vid=1927

补充更新

故事梗概. 某日某网友通过微信联系我, 问能否提供vasp调优. (对方未提供姓名, 就称作某网友好了)

经过简单交流, 发现我恰好也有几台E5-2686 v4双路服务器, 配置有8x16GB内存, 普通机械硬盘. 

下图, 是使用他编译的版本, 在他机器上的运算耗时. 图片显示大概是4630秒, 也就是至少1小时多了(应网友要求, 删除部分隐私信息). 

下图, 是使用这位网友提供的算例, 在我的机器上, 使用我编译的版本(也就是这篇blog提到的百度共享中提供的版本), 计算耗时:

可见, 耗时大概是967秒, 十分钟多一点. (最后那两行, 是我的计算脚本自动插入的)

简单说, 967 vs

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hpc4you
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