单细胞不同数据形式读入及创建Seura汇总（自备）

目录

单细胞简介（略）

 10×genomics技术

得到的数据

seurat对象

Seurat对象中的Assay

归一化和标准化的区别

数据读入与创建seurat对象

①标准的10X genomics

1）单个样本数据

2）多个样本数据

②整理的表达矩阵txt或csv

1）CSV压缩GZ

2）txt压缩GZ

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单细胞简介（略）

单细胞上游分析 - 生物信息云 (bioinfocloud.github.io)

单细胞 RNA 测序（Single cell RNA sequencing，scRNA-seq）是一种在单细胞水平上利用 RNA 测序对特定细胞群体进行基因表达谱定量的高通量实验技术。待测组织经过单细胞分离、RNA 提取、逆转录、文库构建和测序，便可利用数据分析获得多个细胞的基因表达谱。

 10×genomics技术

首先在凝胶微珠上种上特定的DNA片段，DNA片段由三部分组成：Barcode、UMI、PolyT组成。Barcode是16个碱基的长度。一共有400万种Barcode，一个微珠是对应于一种Barcode，通过这400万种Barcode，可以把凝胶微珠给区分开。<