分子动力学模拟技术研讨

最新推荐文章于 2024-07-22 16:49:43 发布
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分类专栏： 线下培训 文章标签： LAMMPS
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科学研究手段中，计算机模拟已经与理论、实验方法已成三足鼎立之势。分子动力学的模拟方法已在物理、化学、材料、生物等学科得到广泛的应用。为更好的推广和传播模拟的方法与技巧。近期有个分子动力学模拟技术的研讨会和LAMMPS培训服务，分享给大家。详细信息可以到www.isimuly.com查看：http://www.isimuly.com/forum.php?mod=viewthread&tid=734&extra=page%3D1

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MS分子动力学模拟具体实施步骤
01-26
MS分子动力学模拟具体实施步骤，应用material studio进行分子动力模拟
分子动力学简介
rogerzhanglijie的专栏
10-18 5171
分子动力学是一门结合物理，数学和化学的综合技术。分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要是依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动，以在由分子体系的不同状态构成的系综中抽取样本，从而计算体系的构型积分，并以构型积分的结果为基础进一步计算体系的热力学量和其他宏观性质。 　　分子动力学简史 　　1957年：基于刚球势的分子动力学法（Alder and Wainwright） 　　1964年：质点系への
Material Studio中分子动力学模拟得到密度density和溶解度参数
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handsome213的博客
07-22 709
使用sketh工具画出全原子分子，以异辛烷为例子。
Materials Studio 做分子动力学MD（CO2为例）
热门推荐
Code Wang的博客
12-09 2万+
1.新建CO2模型 （1）首先在MS中新建一个项目，命名为MD，然后把CO2的.pdb文件拖进来，.pdb文件可以根据GaussianView得到，百度也搜得到。 （2）然后建立块体。点击Modules➡Amorphous Cell➡Calculation。如图所示。 （3）选择块体的大小，输入分子的个数，其他参数可以再具体设置。如图所示。 （4）运行出来后出现下图所示的界...
分子动力学MD交流论坛
sinat_41351675的博客
09-01 514
MD交流论坛 欢迎来到我的博客！坚持比努力重要。 http://www.isimuly.com/
非绝热量子分子动力学模拟软件QXMD的开发与应用
软件X 10（2019）100307原始软件出版物QXMD：非绝热量子分子动力学的开源程序Fuyuki Shimojoa，Shogo Fukushimaa，Hiroyuki Kumazoea，Masaaki Misawab，Satoshi Ohmurac，Pankaj Rajakd，Kohei Shimamurae，Lindsay...
RXMD：一个可扩展的反应分子动力学模拟器
软件X 11（2020）100389原始软件出版物RXMD：一个可扩展的反应分子动力学模拟器，用于优化求解时间放大图片作者：Kan，a，d，J. Kaliaa，b，c，d，Aiichiro Nakanoa，b，c，d，e，Pankaj Rajakf，Priya Vashishtaa，...
"MISTIQS：量子计算机上的开源量子动力学模拟软件
软件X 14（2021）100696原始软件出版物MISTIQS：一个在量子计算机上进行量子动力学模拟的开源软件放大图片作者：a，b，c.接头a，Ken-ichi Nomuraa，放大图片创作者：Sahil Gulaniac，Rajiv K. Kaliaa，Aiichiro ...
间日疟原虫Plasmepsin V的分子对接及动力学研究
医学信息学解锁19（2020）100331间日疟原虫Plasmepsin V的分子对接及动力学研究Muthusaravanan Sivaramakrishnana，b，Kumaravel Kandaswamy b，Sivarajasekar Natesan c，Ruban Durairaj Devarajand，Sankar Ganesh...
四天后你就是应用分子动力学软件（NAMD、AMBER）的神！
C1012562281的博客
06-28 959
分子动力学模拟是分子模拟中最接近实验条件的模拟方法，能够从原子层面给出体系的微观演变过程，直观的展示实验现象发生的机理与规律，促使学术研究向着更高效、更经济、更有预见性的方向发展。可以解决和研究DNA的折叠和性质、蛋白与配体的识别机制、跨膜蛋白的工作机理、蛋白酶与底物的反应、蛋白与蛋白的耦合、比较野生型与突变蛋白的不同特性等。
分子动力学模拟方法概述
07-11
本文简单介绍了分子模拟的基本概念、基本过程和原子之间的相互作用势，如Lennard-Jone势。论述几种有用的差分法。
分子动力学模拟方法及其应用.pdf
08-06
介绍分子动力学的基本概念和应用，可以帮助解决初学者对概念的理解
AMBER分子动力学模拟软件（AMBER18, AMBER19)
01-08
AMBER分子动力学模拟软件（AMBER18, AMBER19) AMBER是著名的老牌开源分子动力学模拟软件，最新版本是AMBER19（但是19版本的并行模拟模块还没公布，只有AmberTools19）如果需要并行计算可以下载编译18版本 由于AMBER国外网站下载非常不稳定，经常掉线，并且每次掉线以后又需要重头下载，非常折腾人，故分享此百度云盘链接给需要的同学们。
MMTK-2.7.9分子动力学模拟软件包
08-19
这一款开源的优秀分子动力学模拟软件包，从事分子动力学研究的软件开发童鞋可以在此基础上进一步开发，或者将其作为科研工具也可以，采用编程语言为python和C。
分子模拟-学习笔记（二）
qq_45559223的博客
12-09 2185
接着分子模拟-学习笔记（一)。 补充： 分子模拟技术的优势 ①加深对材料性质、不同组分的作用及反应机理的认识； ②对现有实验进行引导并虚拟实验技术，减少实 验次数与实验成本； ③预测实验无法检测的关键结构与性质。 在分子模拟的主要方法中，量子力学可以描述电子结构的变化, 而分子力学可以描述基态原子结构的变化。分子动力学可以描述各种温度的平均结构和分子结构的物理变化过程。蒙特卡洛方法通过玻尔兹曼因子的引入能够描述各种温度的平均结构。（分子动力学和蒙特卡洛方法与温度相关） 量子力学法 量子力学是研究微观粒子的运
分子动力学模拟软件_材料领域十大常用绘图软件
weixin_39690105的博客
12-10 2979
作为材料领域的科研工作者，你是否常为如何表达自己的思想而苦恼？作为学术论文创造者，你是否为论文中图文单一而叹气？在这里，GO小妹推荐给你几款常用绘图软件，让你论文从此成为焦点！1——OriginProOringinPro的主要功能为数据分析和绘图。Origin的数据分析主要包括统计、信号处理、图像处理、峰值分析和曲线拟合等各种完善的数学分析功能。进行数据分析时，只需将原始数据粘贴进Origin表格...
计算机分子模拟的意义包括,浅谈计算机分子模拟技术.docx
weixin_39542111的博客
07-23 457
文档介绍：--------------------------校验:_____________-----------------------日期:_____________浅谈计算机分子模拟技术《计算机分子模拟》文献综述浅谈计算机分子模拟技术专业班级:应用化学1301班姓名:张盼学号:1303030126任课教师:赵联明开课时间:2015-2016学年第2学期成绩教师签名浅谈计算机分子模拟技术摘要...
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