R 4.0.2版本edgeR包的安装
2020年6月22日,R官网发布了版本4.0.2的R软件,具体更新了什么内容,待后续挖掘。作为一名流行病与卫生统计学硕士、刚入门的R小白,比较关注的是应用问题。这不,在安装包的时候就遇到了好多问题。在此记录下我学习、使用R的艰辛之路。
之前就听前辈说,不要去贸然更新R软件,一开始用的是R 3.5.3,但后浪就是不听话呀!断断续续学习,断断续续放弃,屡战屡败,重头再来,一下子把R和RStudio最新版本的都用上了。
- R版本 4.0.2
- RStudio版本 1.3.959
安装edgeR包
常规方法
一、菜单安装
RStudio 的packages界面install
R GUI界面安装程序包,查无此包
二、代码安装
install.packages("edgeR")
先在Rstudio尝试失败之后在R里再次输入代码安装仍然失败
高级方法:在Bioconductor中找到edgeR包
一、代码安装
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("edgeR")
中间可能由于网络的问题,到96%就不动了
看到也有大神这么安装,但没有尝试,应该也是连接bioconductor安装
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("edgeR")
二、下载压缩包到本地安装
Bioconductor有此包的压缩包,下载对应版本即可,此处下载Windows二进制版本
R软件或者RStudio本地安装即可
安装成功
看到successfully都要感动哭了
第一次在CSDN上写文章,琢磨这个Markdown编辑器,感觉熟悉之后好方便,好好用哦!笔芯~