RNA-seq(1) :用conda安装RNA-seq所需要的工具-学习笔记

最新推荐文章于 2024-05-13 09:49:17 发布
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分类专栏： 生信分析 文章标签： python
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这篇文章算是对下面若干篇主要参考资料的补充。也是本人在经历四个下午之后终于完成的第一步的一点记录。

1.我下载了多个miniconda，有2 ，有3，两者有什么不同，我没深究。但是，采用下面代码在Linux下载，没有问题，但是安装总是安装不上，起初怀疑是网络问题，因为蹭隔壁邻居家的，后来心痛开了热点，发现还是这样，解压不完全，卡在了30-80%的进度条上。果断放弃，回到了清华镜像网站上，换成了miniconda3- 4.5.12版本，一切恢复到正常。这就是今天一下午干的活。

 wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
 bash  Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
 source /home/leo/miniconda3/bin/activate
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leo12354
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06-04 8833
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RNA-seq——一、Linux软件安装
Dzfly
08-19 1813
在安装软件时，优先考虑conda安装。conda使用起来不仅方便快捷，而且能够帮助管理软件。当遇到conda安装不了的软件时，可以使用wget进行安装。都安装不了的话，就需要找到软件官网，看看是不是缺少依赖的环境或者软件已经停止维护了。总而言之，软件对应的官网很重要。
第二章 RNA-seq一般分析流程全套
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02-22 3万+
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07-29 693
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Bioconda：生物信息学的高效工具库
最新发布
gitblog_00047的博客
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解决CondaHTTPError:HTTP 000 CONNECTION FAILED for url＜https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda***
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今天做项目的时候，Python导入一个包一直有各类问题，而后最终锁定问题是CondaHTTPError:HTTP 000 CONNECTION FAILED for url＜https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda*** 锁定是这个问题之后就好办了。 首先打开cmd命令查看自己的conda的通道配置。 命令如下：conda config --show 输入命令之后就可以查看到自己的 channels的配置源了。 方法一：直接通过cmd修改 conda co
零基础入门转录组分析——第一章（软件的安装）
weixin_49878699的博客
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kallisto-nf:Kallisto和Sleuth RNA-Seq工具的nextflow实现
05-15
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